簡介：分類號分類號R7351密級密級表觀遺傳學表觀遺傳學沉默沉默DACH1抑制抑制TGFΒ信號通路信號通路并促進食管癌促進食管癌的生長生長EPIGEICSILENCINGDACH1PROMOTESESOPHAGEALCANCERGROWTHBYINHIBITINGTGFΒSIGNALING作者姓名吳亮學科專業(yè)內科學（消化系病）導師郭明洲研究員答辯委員會主席論文答辯日期二〇一四年五月二十八日院校地址北京市復興路28號郵政編碼100853解放軍醫(yī)學院博士學位論文目錄英文縮略詞表1中文摘要2英文摘要4前言6第一部分DACH1在食管癌細胞系中的表達及甲基化改變111實驗材料112實驗方法133結果204討論225小結24第二部分DACH1在人食管癌組織中的表達及甲基化改變251實驗材料252實驗方法273結果324討論355小結36第三部分DACH1在食管癌中的功能研究371實驗材料372實驗方法403結果494討論535小結55第四部分DACH1對TGFΒ信號通路的影響561實驗材料562實驗方法583結果604討論625小結63結論64參考文獻65文獻綜述69攻讀學位期間文章發(fā)表情況78致謝79

簡介：我國藝術院校和工科院校相既在上世紀80年代初期開始設立工業(yè)設計學科，走上了對產品造型設計的教學體系，涌現了大量對工業(yè)設計史的研究書籍文獻。這些文獻對設計工作者了解世界工業(yè)設計發(fā)展史，啟發(fā)設計史思維方面起作重大的作用。但是這些設計史文獻都是對世界設計史作縱向概括性論述，而對于設計發(fā)展過程中的橫向遺傳基因鏈卻未作更詳細的論述與分析，對于為什么會在設計發(fā)展過程中浮現歷史產品的影子以及為什么會出現這樣風格那樣風格的反復與輪回均未作分析說明。因而，研究產品設計史的遺傳基因鏈，以更好地把握歷史和現在的關系成為當前設計史教育中一項迫切的任務。一從社會學和心理學的角度來分析產品設計中的遺傳學我們知道，當一種社會形態(tài)不適應生產力發(fā)展的時候，必然會被另一種社會形態(tài)所取代，社會形態(tài)也會在原有基礎上得到進一不發(fā)展；同樣，當一種設計風格、流派變得呆板、干巴、千篇一律時，也會引起人們的不滿，受到大眾的抵制，而大眾在這個時候又會把目光拋向一些新穎并具有過去影子的新產品，以滿足自己的求異心理和懷舊情懷。二、從文化的角度分析產品設計中的遺傳學產品設計是一種社會創(chuàng)造活動，是在一定社會環(huán)境中進行的，因而必將受到環(huán)境中的人文、歷史等因素的影響，會辨證地繼承該環(huán)境中歷史長期以來遺留下來的優(yōu)秀文化；而現在產品設計的優(yōu)秀成果，會作為一種當代歷史的沉淀物流傳下去，進一步指導將來地設計，形成新的設計文化。如此不斷的延續(xù)、發(fā)展，從而推動整個社會的向前發(fā)展。近年來設計在全球范圍內得到了迅速的發(fā)展，各國根據本國的情況走上不同的設計文化道路日本針對本國貧乏的的能源背景形成節(jié)能、價廉、體積小的設計文化方向；斯堪的納維亞國家結合自己精湛的手工藝傳統(tǒng)特色形成獨樹一幟的區(qū)域個性設計特色；中國人面對祖先五千年的悠悠歷史文化，在設計中該如何繼承，如何去發(fā)展三、產品設計中的遺傳學要研究工業(yè)設計史就必須了解建筑設計史，了解建筑設計史中的各種風格和流派，因為建筑設計和工業(yè)設計總是有著千絲萬縷的關系，在西方現代主義風卷過全球之后，世界建筑正向一體化方向發(fā)展，專家呼吁地方建筑必須同地方歷史特色結合起來，以形成自己的獨特文化。就拿重慶來說吧，一座座的吊角樓正在消失，取而代之的是一幢幢四方體的高樓大廈。我們要改變“窮”、“舊”的面貌是應該的，但我們又不能把老祖宗的東西一股兒全拋棄，那樣我們會被子孫罵后腦的。因此，我們必須學會怎樣把歷史和現代結合起來，正確把握設計中的遺傳學。從現代設計開始就有兩種造型形態(tài)（理性形態(tài)與曲面形態(tài)）共同構成產品外觀造型形態(tài)。兩種形態(tài)你唱罷來我登場，彼此斗爭，同時又促進對方的向前發(fā)展，當理性形態(tài)占據主流地位時，曲面形態(tài)便退后次要位置完善自己，等待理性形態(tài)發(fā)展到頂峰下滑時，它會又重振旗鼓，以嶄新的面貌逐步又占據設計的主流，直到自己衰退時，又讓理性形態(tài)重新登場，如此反復與輪回，共同推動著設計形態(tài)的向前發(fā)展。從近幾年國際著名車展上的概念車可以看出“新鋒銳”和“復古風”正成為兩種主要的產品設計造型語言。新鋒貌的棱線風格可以看作是對60年代“硬邊藝術”及包豪斯理性風格的回歸與發(fā)展，它繼承了后兩者的棱線遺傳基因；而“復古風”更是遺傳了三、四十年代汽車造型的圓潤古典風格，形成了新的造型語言。

簡介：胚胎植入前遺傳學診斷（PREIMPLANTATIONGEICDIAGNOSIS，PGD）胚胎植入前遺傳學篩查（PREIMPLANTATIONGEICSCREENING，PGS）是在輔助生殖技術（ASSISTEDREPRODUCTIVETECHNIQUES，ART）時，針對于有特定遺傳疾病風險的夫婦，對體外受精（INVITROFERTILIZATION，IVF）胚胎進行活檢，采用多種技術進行遺傳學診斷，以選擇正常胚胎進行移植，提高臨床妊娠率和臨床分娩率，降低流產率，是輔助生殖技術與分子生物學技術相結合而形成的一種產前診斷技術。PGS是對植入前的胚胎進行染色體非整倍進行檢測，目前所用的PGDPGS技術有聚合酶鏈反應（POLYMERASECHAINREACTION，PCR），熒光原位雜交（FLUESCENCEINSITUHYBRIDIZATION，FISH），全基因組擴增技術（WHOLEGENOMEAMPLIFICATION，WGA），比較基因組雜交芯片（COMPARATIVEGENOMICHYBRIDIZATIONARRAYS，ACGH），單核苷酸多態(tài)性芯片（SINGLENUCLEOTIDEPOLYMPHISMARRAYS，SNP），二代測序技術（NEXTGENERATIONSEQUENCINGTECHNOLOGY，NGS）等。WGA是一種能對微量甚至是極微量DNA進行有效擴增的技術，其擴增產物可被多種常規(guī)分子技術用于下游的遺傳學分析。盡管現有多種被優(yōu)化的WGA技術，但本質上都可歸于擴增前引物延伸反應PRIMEREXTENSIONPREAMPLIFICATION，PEP、簡并寡核苷酸引物PCRDEGENERATEOLIGONUCLEOTIDEPRIMERPCR，DOPPCR和多重置換擴增MULTIPLEDISPLACEMENTAMPLIFICATION，MDA1這三種方法。WGA技術已在臨床廣泛應用，如循環(huán)腫瘤細胞的基因分型2，法醫(yī)樣本的鑒定，PGDPGS胚胎的染色體和單基因病的基因分析等。通過ART所獲得的胚胎發(fā)生染色體異常的可能性較高，這是導致胚胎植入失敗、孕早期胎停育及自發(fā)性流產的重要原因。在PGDPGS領域，ACGH和SNP芯片因能夠檢測胚胎24條染色體且具有較高的可靠性和準確性，而被廣泛應用于鑒別整倍體與非整倍體胚胎34。無論是芯片技術還是NGS平臺，都依賴于WGA技術這一關鍵步驟將胚胎活檢樣本的微量DNA高保真擴增，產生的足量DNA能夠用于芯片的雜交或NGS的建庫。關于WGA技術在PGDPGS領域的應用多有研究，但是基于現有NGS平臺，針對于不同WGA技術在PGDPGS領域應用的橫向研究未見報道。在PGDPGS的臨床實踐中，ACGH和SNP芯片在染色體異常的檢測方面顯現出較高的可靠性和準確性。但是，現有的商業(yè)化的芯片平臺在探針設計、探針定制以及染色體探針密度分布方面存在顯著不同，此外，某些平臺因檢測分辨率較低難以檢測出具有顯著臨床意義的IVF胚胎染色體異常。另外，SNP芯片在檢測染色體三體和其它由于未減數分裂重組導致的染色體重復方面也存在不足。在臨床實踐中，從胚胎樣本活檢到出具檢測報告，芯片平臺工作流程繁瑣，且需對DNA進行標記、雜交。因芯片及相關試劑費用高昂，探針數量有限等客觀因素，致使芯片檢測效率較低。而NGS結合強有效的生物信息學算法，使對IVF胚胎染色體異常的檢測更加全面且更加經濟有效，為PGDPGS領域的發(fā)展帶來新機遇。我們將NGS技術與生物信息學聯合應用開發(fā)出適用于單細胞PGS分析的高分辨率拷貝數變異測序技術（COPYNUMBERVARIATIONSEQUENCING，CNVSEQ），以解決胚胎活檢樣本的CNV檢測問題，同時將基于PCR的SUREPLEXWGA方法引入現有PGS流程，評估其檢測染色體異常的效能，使CNVSEQ的臨床轉化應用成為可能，并有望取代ACGH及SNP芯片在PGS領域的應用，對胚胎染色體異常進行精準檢測。目的1依托所研發(fā)的CNVSEQ技術平臺，對三種WGA方法以PCR為基礎的SUREPLEX和MALBAC與以MDA為基礎的REPLIG，從擴增覆蓋度、敏感性、特異性和可重復性等方面進行對比研究。希望通過我們的研究，將具有擴增優(yōu)勢的WGA方法引入現有的測序流程。2分別用回顧性研究和雙盲研究，以ACGH為金標準，利用CNVSEQ檢測染色體非整倍性和非平衡易位，全面評估其檢測染色體異常的效能，并進一步將CNVSEQ技術臨床轉化應用至PGS領域。方法1選取6名具有臨床表型的染色體疾病患者為研究對象，1名正常核型的男性為陰性對照，收集研究對象的外周血，提取基因組DNA（GENOMICDNA，GDNA），純化后梯度稀釋至15PG，顯微操作從患者的凍融外周血中分離單細胞，分別在稀釋GDNA單細胞水平和單細胞水平，對SUREPLEX、MALBAC和REPLIG三種WGA方法全基因組覆蓋度、敏感性、特異性和可重復性等方面進行對比研究。2選取24例經ACGH檢測的WGA產物，其中10例WGA產物用于回顧性研究，14例WGA產物用于雙盲研究，我們以ACGH為金標準，驗證CNVSEQ在檢測染色體非整倍體和非平衡易位方面的效能，通過直接比較ACGH和CNVSEQ對同一例胚胎單卵裂球活檢的WGA產物的檢測結果，來驗證CNVSEQ的檢測效能。選擇3對需行PGS檢測的夫婦進行初步的臨床轉化。結果1從技術方法、產量、濃度、平均擴增產物長度、所需時間、操作難易程度等方面對SUREPLEX、MALBAC和REPLIG這三種WGA方法進行了比較，SUREPLEX和MALBAC在可操作性上確有一定優(yōu)勢。2SUREPLEX和MALBAC這兩種基于PCR的WGA方法較MDA具有更好的基因組覆蓋度、較少的擴增偏倚。3針對于低起始模板量的DNA，無論是15PGGDNA還是單細胞，基于PCR的WGA方法在擴增覆蓋度、穩(wěn)定性、敏感性、特異性和可重復性等方面均優(yōu)于不依賴PCR的MDA技術。4回顧性研究和雙盲研究驗證了CNVSEQ在檢測染色體非整倍體和非平衡易位方面的效能，結果證實CNVSEQ在對染色體CNV的檢測方面具有高準確率和特異性。5CNVSEQ初步實現其臨床轉化應用，已成功在3對不孕不育夫婦實施，其中一對夫婦在選擇染色體整倍體胚胎植入后分娩一健康女嬰，使不孕不育患者真正受益。結論1針對低起始模板量的DNA，無論是稀釋GDNA單細胞水平還是單細胞水平，基于PCR的SUREPLEX和MALBACWGA方法在擴增覆蓋度、穩(wěn)定性、敏感性、特異性和可重復性等方面均優(yōu)于不依賴PCR的REPLIGMDA技術，聯合使用CNVSEQ技術能有效對臨床病理性CNVS做出診斷。2CNVSEQ在對染色體CNV的檢測方面具有高準確率和特異性，隨著NGS技術的迅速發(fā)展，其有望取代ACGH及SNP芯片在PGS領域的應用，對胚胎染色體異常進行精準檢測。

簡介：燃料乙醇是第一個實現大規(guī)模生產應用的生物質可再生能源，主要通過釀酒酵母發(fā)酵轉化淀粉和糖類原料獲得。當前，燃料乙醇的生產應用仍面臨諸多資源與成本制約因素，主要集中在原料受到土地和水資源限制、生產過程能耗高及廢料處理等難題。針對燃料乙醇的生產現狀，世界各國學者和工程技術人員認為高溫發(fā)酵、濃醪發(fā)酵和非糧纖維乙醇三種發(fā)酵技術是提升燃料乙醇經濟與社會效益的有效途徑。但這幾種發(fā)酵技術的運用對釀酒酵母菌株耐受環(huán)境中生長和發(fā)酵抑制因子（如高溫、高滲、高乙醇濃度和纖維原料抑制物乙酸、糠醛及酚類物質）的能力提出了更苛刻的要求。研究釀酒酵母對這些脅迫因子的耐性機制，以及選育具高抗逆性和乙醇轉化率的釀酒酵母菌株成為了突破這些新發(fā)酵技術瓶頸的關鍵所在，也是一項具有重大理論與實際應用意義的科學研究課題。本文主要通過比較功能基因組學研究方法，揭示不同釀酒酵母菌株間的基因組差異，以及這些差異如何影響菌株的耐性和發(fā)酵性能。同時也利用基因組變構和基因工程等方法來選育性能改進的釀酒酵母菌株。主要研究內容和結果如下1、燃料乙醇工業(yè)菌株的耐受性和發(fā)酵性能比較選取實驗室菌株Z1和乙醇發(fā)酵工業(yè)上常用的釀酒酵母Z2Z7系列菌株，研究比較其對高溫等脅迫抑制因子的耐受性及其在高溫、濃醪和纖維素水解液三種條件下的發(fā)酵性能。結果表明，即便是同一生產用途的釀酒酵母菌株在多種脅迫耐受性和發(fā)酵性能上存在顯著差別、各具優(yōu)勢。相比之下，菌株Z7（ZT系列）在濃醪條件下的乙醇產量和糖醇轉化率上要明顯優(yōu)于其它常用工業(yè)菌株，菌株Z5在高溫條件下乙醇產量最高，菌株Z3對纖維素水解液中抑制物耐性要高于其它菌株。2、比較功能基因組學指導菌株個性化育種對工業(yè)菌株YJS329Z5和實驗室菌株BYZ1進行表型比較分析，發(fā)現Z5在對多種環(huán)境脅迫因子耐性和發(fā)酵性能上要優(yōu)于BYZ1。兩菌株在海藻糖、質膜成分和抗氧化因子等生化因子的含量上也有明顯差異。脈沖場凝膠電泳PFGE和比較基因組雜交結果表明，Z5是一株核型規(guī)則的二倍體菌株。利用二代高通量測序技術對Z5的一株單倍體菌株YJSH1進行深度測序和從頭組裝，并與S288C基因組進行了SNP、進化關系、INDEL和F的差異分析。利用RNASEQ研究了該兩株菌株的表達譜，在基因表達水平上對兩株菌株的表型差異進行機制探討。重點分析了轉錄因子MSN24，HAP1，HSF1，和ARR1自身表達差異原因和對整個表達譜和菌株表型的影響。同時結合基因組序列信息舉例分析了一些SNPS、INDELS和基因拷貝數變化對基因表達的影響。在了解Z5基因組信息以及一些序列變異對表型的影響后，用基因操作的方法對Z5進行針對性的分子改造，并提出了比較功能基因組學指導微生物個性化育種的育種新理念。3、基因組結構變異對菌株表型的影響及其機制利用PFGE和比較基因組雜交對菌株Z27進行了基因組結構比較，結果顯示Z3和Z5是二倍體菌株，Z2，Z4，Z6和Z7是非整體菌株，在多條染色體上發(fā)生大片段的擴增現象。綜合菌株Z27的DNA序列進化關系、表型和生理生化的分析的結果，我們推測基因組結構變異在這些菌株表型分化中的作用可能比序列差異的作用大。通過對CUP1和YFL052W等特定基因的過表達和敲除發(fā)現這些基因的拷貝數變化會對菌株的表型產生顯著影響。此外，對Z7和Z5在生長和發(fā)酵條件下的表達譜和生理生化比較研究發(fā)現，“非整倍壓力應激”可能是這些菌株脅迫耐性和發(fā)酵性能差異的重要機制。4、通過基因組結構變異改進菌株的復雜性狀對Z7進行多輪的基因組重構后，獲得濃醪發(fā)酵性能顯著提高的SV突變株，證明了基因組變構能有效改進酵母菌株的復雜性狀。其中一株突變株ZTS3較Z7在乙醇產量上提高66％，而且對乙醇、H2O2和高溫的耐受性也明顯改進。ZTS3相對于Z7來說在多條色體上發(fā)生了大片段的拷貝數增多或減少。我們證明了基因YFL052W拷貝數和表達量的增加是ZTS3多種脅迫耐性提高的一個重要原因。對ZTS3和Z7所有差異基因的功能分類及相關生理代謝分析發(fā)現，ZTS3的非整倍壓力應激反應要少于Z7，具體反映在參于核苷酸等小分子的合成、細胞增殖、海藻糖和抗氧化因子等抗逆因子合成基因在ZTS3上調參于蛋白折疊、轉運和定位、能量代謝和離子平衡等過程的基因在ZTS3中發(fā)生下調。因此推斷特定基因拷貝數的變化和非整倍性的調整是基因組變構改進菌株復雜性狀的兩種重要機制。

簡介：天津大學碩士學位論文X849001基于神經遺傳學習算法的模型優(yōu)化研究STUDYOFTHEMODELINGOPTIMIZATIONBASEDONNEURALNETWORKANDGA專業(yè)管理科學與工程研究生杜健指導教師李波副教授天津大學管理學院2005年1月ABSTRACTTHEENSEMBLELEARNINGISAHOTSPOTINTHEINTELLIGENTLEARNINGFIELDITHASBEENPAIDATTENTIONFROMITS’VERYBEGINNINGANDHASBEENUSEDSUCCESSFULLYINMANYFIELDSBECAUSEOFITS’GOODPERFORMANCEANDUSABILITYTHECOMBINATIONOFENSEMBLEALGORITHMSANDUNSTABLELEARNERSHASSHOWNIMPRESSIVEEFFECTBOTHINACCURACYANDSTABILITYATTHESAMETIME，PARTHENOGENETICALGORITHMISAHOTSPOTDUETOITS’MATURITYITISADOREDBYSOMANYRESEARCHERSDUETOITS’ABILITYTOSOLVECOMBINATIONPROBLEMSESPECIALLYPROBLEMSINLARGESCALEBASEDONTHEALGORITHMSDISCUSSEDABOVE，THISARTICLEDOESSOMEUSEFULSTUDYINSOMEASPECTSSOMETHINGWASDONEASBELOW1SOMEEXPERIMENTSWEREDONETOTESTIFYTHEVALIDITYOFTHEBOOSTINGALGORITHMBASEDONTHESTUDYOFTHEENSEMBLEALGORITHMTHEEXPERIMENTSWEREBASEDONTHEUCIDATABASE，ANDTHEPURPOSEISTOPROVETHEGOODPERFORMANCESOFBOOSTINGINSOMEASPECTSASSERVICEABILITY；STABILITYTHEABILITYOFPARAMETEROPTIMIZATIONATLAST，WEDISCUSSTHESERVICEABILITYAND“OVERFITTINGPROBLEM”FROMTHEPOINTOFMARGIN，ANDSHOWITININTUITIONISTICGRAPHICS2BASEDONTHESTUDYABOVE，WEPUTFORWARDANEWMETHODTOULTERIORLYOPTIMIZEPARAMETERSOFBOOSTINGALGORITHMHERETHEMETHODSWEUSEDAREGENETICALGORITHMANDLSEALGORITHMANDTHESIMULATIONRESULTSSHOWTHATBOTHMETHODSCARLIMPROVETHEPERFORMANCEMO∞3ASTOPARTHENOGENETICALGORITHM，WEBRINGFORWARDANIMPROVEDALGORITHMBASEDONPARTHENOGENETICALGORITHMTOSOLVETHECSPPROBLEMANEWMETHODWASBROUGHTFORWARDTOSIMPLI匆THECODINGPROCESS，ATTHESAMETIME，ANOPERATORWASINTRODUCEDTOHEIPTOFINDTHEBESTGLOBALSOLUTIONANDTHEALGORITHMHASBEENTESTIFIEDTOBEAEXCELLENTONETHROUGHTHETESTINMORETHANONEINDUSTRIALENTERPRISESALLPROOFSSHOWTHATITISAGOODMETHODTOSOLVETHECSPPROBLEMBOTHINTHECUTTINGACCURACYANDCALCULATINGEFFICIENCYKEYWORDSENSEMBLELEARNING，PARTHENOGENETICALGORITHMCSPPROBLEM，NEURALNETWORKBOOSTINGBAGGING

簡介：該文的研究對象是基于遺傳算法的數據挖掘方法及其這些方法在生物信息學中的應用該文的研究分為相互關聯的四個部分該文針對目前廣泛采用的EMBL核酸序列數據庫提出了有針對性的聯機分析處理OLAP實現方案第二利用遺傳算法改進傳統(tǒng)的數據挖掘方法在這方面該文提出了基于遺傳算法的K均值聚類分析方法并把該方法與傳統(tǒng)的K均值聚類和基于單純遺傳算法的聚類方法做了比較第三將改進的數據挖掘方法應用在生物信息學中該文針對氨甘酸序列的聚類問題提出了基于遺傳算法的解決方案第四對生物信息學中已有數據挖掘算法做進一步的優(yōu)化該文針對蛋白質的空間結構預測問題在前人工作的基礎上提出了基于并行遺傳算法的解決方案

簡介：南開大學博士學位論文中文摘要摘要脂肽類生物表面活性劑屬于細菌產生的代謝產物，其合成酶基因約占整個基因組染色體大小的O。7％，以結構復雜的操縱予形式存在，內部包含重疊基因。脂肽合成酶基因在芽孢桿菌感受態(tài)形成和分化發(fā)育調控網絡中處于中心地位，感受態(tài)的形成需要5’末端序列，芽孢的有效生成則需要整個操縱子基因轉錄與表達，它本身由兩個QUORUMSENSING系統(tǒng)調控，目前所有的轉錄調控和作用機制證據的獲取均來自非高產脂肽生產菌，對高產脂肽生產菌脂肽基因的調控模式和作用機制尚不清楚。本文以高產脂肽生產菌BACILLUSSUBTILISNK．LI為材料，探索脂肽合成酶基因盤玷轉錄調節(jié)的分子遺傳學機理，特別是早期感受態(tài)基因COMA對矗玎基因的轉錄調控。研究內容主要包括以下五部分1對脂肽高產菌株采用多相分類技術，綜合其表型、基因型和系統(tǒng)發(fā)育的信息，確立分類地位2采用基因敲除技術構建缺失菌株，確立COMA基因與瑤艚基因之間的關系3采用報道基因融合技術研究COMA基因與枷基因的時序表達模式；4對高產脂肽菌株直接進行遺傳操作，研究構建工程菌的理論基礎和策略，構建一系列穿梭表達載體，研究∞MA基因對枷基因的轉錄調控模式；5利用BACILLUSLICHENIFORMISNKX3研究脂肽性能及其在突破微生物特重原油開采局限上的可能性。通過對脂肽高產菌株進行遺傳操作，制備出轉化率高達1108個轉化子／LTGDNA的感受態(tài)；利用COMA基因獲得了提高脂肽產量的證據，證實了早期感受態(tài)基因COMA是脂肽合成酶基因轉錄和表達的前提條件；提出了完整的COMA基因與枷基因的時序表達模式證實了脂肽具有改變細胞表面親疏水性的作用和抗生素活性；本研究突破了微生物開采特重原油油藏的局限性，在遼河冷東油田特重原油油藏單井處理中獲得成功，開發(fā)了特重原油油藏蒸汽開采后期的接替技術。關鍵詞BACILLUSSUBTILISNKLL脂肽合成酶基因垂蝦早期感受態(tài)基因CDMA轉錄調控微生物提高原油采收率南開大學博士學位論文引言1．引言芽孢桿菌BACILLUS作為細菌分類中的一個屬，歷經了百年的歷史。如今，人們對它的研究幾乎涉及到了革蘭氏陽性可生孢細菌的各個領域。尤其在感受態(tài)的形成、芽孢形成及其調控、遺傳操作、菌種改良、生物技術等領域。枯草芽孢桿菌BACILLUSSUBTILIS作為BACILLUS的模式種，它的研究處于該屬各領域的中心位置。BSUBTILIS為桿狀，G，可產芽孢，好氧的細菌，廣泛存在于土壤、水域等自然環(huán)境中。它是重要工業(yè)酶的來源，在外界營養(yǎng)供應不足的條件下，可通過停止生長，增加代謝強度，產生～系列應答反應來應付環(huán)境的變化。一旦條件適應，又可以恢復正常生長。然而當營養(yǎng)條件繼續(xù)惡化時，則通過產生芽孢來抵御惡劣的自然環(huán)境。另外，B．SUBTILIS還可自發(fā)進入一種生理狀態(tài)一即感受態(tài)。對B．SUBTILIS的研究包括細胞壁的合成與細胞生長及細胞分裂；中間代訪F過程酶的基因定位；芽孢形成和萌發(fā)有關的生化和形態(tài)學變化的基因的確定；轉化和轉導過程中遺傳交換機制；感受態(tài)等基因的分析與定位；DNA、RNA與蛋白質的合成，以及其它如抗生素等產生的基因定位等。這些研究得以進展，首先應該歸功于SPIZIZENI】及其學生研究并發(fā)展的B．SUBTILIS168菌株的轉化系統(tǒng)，目前國際上用作遺傳工程的B．SUBTILIS宿主幾乎都來自這一菌株。正是這一系統(tǒng)，導致了BACILLUS遺傳學分析這一時代的來臨。芽孢桿菌遺傳保存中，IJ,BACILLUSGENETICSTOCKCENTER，BGSC將B．SUBTILIS遺傳學的研究劃分為三個不同的時代，分別是經典遺傳學時代，分子遺傳學時代及基因組時代?！?58年，SPIZIZENLL】在論文中寫道“DNAISOLATEDFROMAWILDTYPESTRAINCANTRANSFORLNTHESEBACTERIATONUTRITIONALINDEPENDENCE”。揭開了經典遺傳學的序幕。從1958年至1977年19年間，人們關注著B．SUBTITIS的遺傳交換與重組機制，這一時期獲得并采用生化方法分析了大量的遺傳突變體營養(yǎng)缺陷型，芽孢產生缺陷型等等，到2001年共有897株B．SUBTILIS遺傳突變菌株保存在美國俄亥俄州立大學的BACILLUS遺傳保存中心。1977年對研究B．SUBTILIS遺傳學的科學家們而言是一個永遠不會忘記的～年。該年報道了B．SUBTILIS基因在E．COLI表達系統(tǒng)中獲得了表達∞L，同時抗性質粒在B．SUBTITIS中獲得了表達14】。一個RSUBTILIS蛋白表達的新紀元宣告來臨，之

簡介：中山大學碩士學位論文釀酒酵母ADE13基因缺失致死表型的遺傳學基礎姓名王丹丹申請學位級別碩士專業(yè)生物化學與分子生物學指導教師賀雄雷20100530中【JJ人學碩士學位論文有可能是由于該基岡缺失后，使得細胞內其他基岡的功能受到影響，或者使得細胞內積累了某些細胞毒性物質，導致細胞死亡。本研究不僅為遺傳學中必需基因等基本概念提供理論參考價值，為進一‘步的遺傳學研究以及腺嘌呤代謝途徑的研究提供方法依據和理論基礎，而且有助于更深入一步的認識基岡間相互作用關系。關鍵詞必需基岡；ADEI基岡敲除；挽救Ⅱ

簡介：分類號密級華中農業(yè)大學博士學位論文甘藍型油菜諸葛菜異附加系和代換系的建立及遺傳學ESTABLISHMENTANDCYTOGENETICSOFBRASSICANAP／ZSORYCHOPHRAGVIOLACELLSALIENADDITIONSANDSUBSTITUTIIRA2MUSVIOLACELLSALIENADITIONSANSBSTITUUONS博士研究生丁力學號09301010035指導老師李再云教授專業(yè)作物遺傳育種研究方向油菜分子細胞遺傳學獲得學位名稱農學博士獲得學位時間2013年華中農業(yè)大學植物科學與技術學院作物遺傳改良國家重點實驗室，國家農作物分子技術育種中心中國武漢430070二。一三年六月甘藍型油菜一諸葛菜附加系和代換系的建立及細胞遺傳學目錄摘要IABSTRACTIII1文獻綜述111植物異染色體系研究進展及其在植物遺傳改良中的應用1111異附加系1112異代換系2113易位系4114異染色體系的鑒定51141形態(tài)學標記51142細胞學標記51143生化標記61144分子標記612染色體的異常細胞遺傳行為7121細胞有絲分裂染色體異常行為71211體細胞聯會和體細胞交換71212親本染色體組分開現象91213染色體消除91214核內有絲分裂91215多次有絲分裂10122細胞減數分裂染色體異常行為101221減數分裂聯會異常101222未減數配子現象12123染色體的其他異常行為1612。31染色體的不均等傳遞161232染色體在運動中的異常行為1613非整倍體研究進展18131單體一19132缺體20T

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簡介：大數據處理技術是近幾年來被熱議的話題，它被廣泛地應用于物理，天文，金融及其他科學研究領域。近年來，大數據處理技術在材料科學領域也得到了有效的應用，自2011年日本福島核電站爆炸事故之后，科學家嘗試利用SIC材料作為下一代核聚變反應堆的包殼材料，本課題的主要工作是利用改進的遺傳算法對用于SIC材料大數據處理的關鍵勢能函數進行優(yōu)化，使得針對SIC材料的大數據計算結果更為準確。作為改進型遺傳算法提出的理論基礎，本文首先介紹了遺傳算法的基本原理和主要流程，對常見的編碼方式，適應度函數構造方式以及交叉變異方式做了詳細介紹。鑒于自適應遺傳算法具備的諸多優(yōu)點，本文選用自適應遺傳算法作為初始的改進框架，并詳細分析了傳統(tǒng)自適應遺傳算法的基本原理和優(yōu)缺點。為了進一步遏制自適應遺傳算法存在的局部最優(yōu)化和早熟收斂問題，本文將一種適用于實數編碼的新型交叉方式引入傳統(tǒng)的自適應遺傳算法，并對自適應遺傳算法的調節(jié)公式加以改進，提出一種基于算數交叉的自適應遺傳算法，新型算法在優(yōu)化效果方面比傳統(tǒng)自適應遺傳算法有較大提高。TERSOFF勢能函數是SIC材料大數據處理的核心函數，在TERSOFF勢能函數中，需要優(yōu)化的參數有30個之多，為了使優(yōu)化能夠達到預期效果，就必須使用大規(guī)模種群，同時增加迭代的次數，這就帶來了算法執(zhí)行時間過長，效率低下的弊端。為了解決這一問題，本文將并行計算的思想引入到基于算數交叉的自適應遺傳算法中，提出了一種基于算數交叉的并行自適應遺傳算法，并利用這一算法對TERSOFF勢能函數進行了優(yōu)化，然后利用改進后的勢能函數在曙光5000A超級計算機上進行了大數據計算，并對計算結果進行評估，證明了優(yōu)化結果的正確性和算法的有效性。同時，對比了幾種遺傳算法的收斂代數，運行時間等數據，說明了新型遺傳算法的改進效果。最后，本文利用基于算數交叉的并行自適應遺傳算法開發(fā)了一種用于SICHE材料大數據計算的勢能函數，并針對輻照損傷條件下SIC材料的關鍵特性進行了分子動力學大數據計算和分析，證明了新型遺傳算法的有效性。

簡介：CLASSIFIEDINDEXCONFIDENTIALYES／NONOCODE10224NO。130610505DISSERTATIONFORTHEMASTERDEGREEGENETICFEATURESOFENTERICPROTOZOANSANDPOPULATIONGENETICSSTUDYOFENTEROCYTOZOONBIENEUSIINPIGSFROMNORTHEASTCHINACANDIDATEWANQIANGSUPERVISORAPLIWEIDEGREECATEGORYMASTEROFAGRICULTURECOLLEGECOLLEGEOFVETERINARYMEDICINEFIRSTLEVELDISCIPLINEVETERINARYMEDICINESECONDLEVELDISCIPLINEPREVENTIVEVETERINARYMEDICINEHARBINJUNECHINA2016東北農業(yè)大學農學碩士學位論文32畢氏腸微孢子蟲多位點序列分析與群體遺傳學研究一22321各位點基因型與連鎖不平衡分析22322多位點序列分型24323亞群體結構與群體遺傳學分析254J寸倉2941豬畢氏腸微孢子蟲的流行與基因型分布2942豬隱孢子蟲的流行與蟲種分布3043畢氏腸微孢子蟲多位點序列分型與群體遺傳學305結論33致射34參考文獻35攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術論文44

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簡介：隸南Y大誓博士學位論文基于神經可塑性異常假說的抗抑郁劑藥物遺傳學研究本論文獲國家863計劃項目2008AA022413和國家973計劃項目2007CB512308資助。東南大學學位論文獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學位論文是我個人在導師指導下進行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加以標注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得東南大學或其它教育機構的學位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均己在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名犟絲盤魚日期堂墮弘東南大學學位論文使用授權聲明東南大學、中國科學技術信息研究所、國家圖書館有權保留本人所送交學位論文的復印件和電子文檔，可以采用影印、縮印或其他復制手段保存論文。本人電子文檔的內容和紙質論文的內容相一致。除在保密期內的保密論文外，允許論文被查閱和借閱，可以公布包括刊登論文的全部或部分內容。論文的公布包括刊登授權東南大學研究生院辦理。研究生簽名上扛塑生璽．一導師簽名二三蠡L日期之蚴礦

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