分子生物學中核心概念的語義分析.pdf

1、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的確立標志著生物學進入分子生物學時代。分子生物學的快速發(fā)展使得生物學成為繼相對論和量子力學革命以來發(fā)展最快、成就最多的學科之一。分子生物學理論的巨大成就,對人類的認識論、思維方式及社會發(fā)展都產(chǎn)生了很大的影響。因此,對其核心概念進行分析,顯得尤為必要。而在對這些概念的表征、指稱、意義、真理性、實在論等問題的分析過程中,語義分析方法作為一種普遍的、具有時代特征的語義學方法論,在生物學哲學中的運用既是無法避開的,也是一種不

2、可忽視的科學的研究方法。語義分析方法在科學哲學中運用的“中性”特點,使得其對科學實在論等傳統(tǒng)問題的研究具有超越性。并且生物學理論表述的多元化特征使得語義分析方法的應(yīng)用更具有靈活性。因此,本文使用語義分析的方法對分子生物學中遺傳的載體——基因、遺傳的機制——中心法則、遺傳信息以及遺傳的信息——遺傳密碼進行了系統(tǒng)的分析。嘗試厘清這些概念的本質(zhì),以期對它們作為科學概念以及哲學概念的夯實與完善都有所意義。但是,需要明確的一點是,對任何概念的語義

3、分析都無法離開其語形表征的前提,因為,沒有語形表征的語義分析是沒有意義的。而對任何概念語形表征的分析也都無法離開對其的語義分析,因為,沒有語義分析的語形表征是空洞的。同時,對每一個概念語義分析的意義使用又無法離開語用的選擇,即對每一個概念的語義分析都不能脫離對其社會語境的分析,因為,脫離了語用分析的語義分析就可能是狹隘的、不可通約的。因此,語形、語義以及語用這三者之間是一個有機的語境論的整體,無法割離。而文章在對基因、中心法則、遺傳信息

4、以及遺傳密碼這些概念的語義分析過程中,無論是自覺的或者不自覺的,都是建立在這三者統(tǒng)一的一個語境論的基礎(chǔ)之上。
　　本論文主要包括緒論、五章的系統(tǒng)論述以及結(jié)束語。其中緒論部分主要介紹了論文的研究目的和意義、國內(nèi)外研究現(xiàn)狀以及研究的主要內(nèi)容等。
　　第一章為“分子生物學中的語義分析”:1.1、首先闡述了在分子生物學中語義分析興起的背景,其中主要論述了生物學哲學興起的背景,以及語義分析方法在科學哲學與生物學哲學中的應(yīng)用傳統(tǒng);1.2

5、、論述了在分子生物學哲學中語義分析的本質(zhì)特征以及意義,表明了分子生物學哲學中語義分析的本質(zhì)應(yīng)該是一種語境論的語義分析,并討論了語義分析方法與分子生物學概念的指稱確定、語義闡釋、形式化構(gòu)建、經(jīng)驗性驗證、真理性、實在論等問題之間的關(guān)系。
　　第二章為“基因的語義分析”:其中2.1、在語境論的基礎(chǔ)上分三個階段分析了基因概念的語義變遷——古希臘時期、19世紀60年代后顆粒遺傳學說提出到DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)之間、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)之后至今

6、,表明基因概念的語義變遷是依賴于特定的語境,隱喻的發(fā)生轉(zhuǎn)移;2.2、討論了語境論視野下的基因本質(zhì),主要包括對大眾科學下基因概念誤區(qū)的分析、基因概念還原本質(zhì)的分析以及基因概念的語境論解釋;2.3、論述基因理論發(fā)展過程中的隱喻機制,闡述了基因理論發(fā)展過程中的隱喻思維及其方法論功能。
　　第三章為“中心法則的語義分析”:3.1、闡述了中心法則形成的邏輯基礎(chǔ),主要包括理論基礎(chǔ)(時代背景知識)與社會基礎(chǔ);3.2、利用語義分析的方法,對作為科

7、學理論的中心法則的語義變遷進行了分析,并指出這種變遷是在分子生物學縱向語境的不斷變化中實現(xiàn)的。只有在特定的語境下對中心法則進行不同層面的語義解釋,才不會導(dǎo)致其語義的局限性,在中心法則語義變遷的過程中充分體現(xiàn)了語境論的認識特征;3.3論述了中心法則對于現(xiàn)代生物學的哲學意義以及傳統(tǒng)意義下分別作為科學理論與作為研究方法的中心法則的意義局限性,表明傳統(tǒng)意義下作為科學理論的中心法則反映了一種還原論的思維,中心法則為還原論者研究基因組提供了一種方法

8、論上的保障,然而這種自下而上的還原的研究策略帶來的問題是研究的復(fù)雜度驚人;3.4結(jié)合計算機模擬,提出了一種自上而下的中心法則新的研究策略,試圖對上面的困境給出一種解答。
　　第四章為“遺傳信息的語義分析”:4.1、為信息概念的語義溯源,討論了信息概念的產(chǎn)生以及之后對早期信息概念的挑戰(zhàn)與辯護;4.2、闡述了對信息概念持否定態(tài)度的學者對這一概念的幾個詰問;4.3、討論了關(guān)于遺傳信息的討論中最主要的問題之一——基因是否具有信息?并表明,

9、我們既不能忽略信息在經(jīng)驗事實上的使用,也不能過分強調(diào)信息的語義性質(zhì),而應(yīng)該在語境論的基底上對其進行完整的理解;4.4、使用語義上升和語義下降的方法對信息的概念進行了語境論的解釋,并討論了信息概念的部分語義性質(zhì);4.5、討論了基因與非基因系統(tǒng)中信息遺傳的特征。
　　第五章為“遺傳密碼的語義分析”:5.1、為遺傳密碼的語義溯源,從遺傳密碼的提出開始,討論了遺傳密碼發(fā)現(xiàn)的邏輯,并闡述了遺傳密碼的語義性質(zhì);5.2、論述了遺傳密碼內(nèi)涵與解釋