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文檔簡介
1、直突搖蚊亞科是搖蚊科中最大的一個亞科,迄今已記錄12個屬群的132屬。同時被國際搖蚊學(xué)界公認(rèn)為是系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最復(fù)雜的分類單元。該亞科與搖蚊科已知其它10個亞科之間的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系以及亞科內(nèi)基于形態(tài)學(xué)劃分初步確定的12個屬群是否為單系群、屬群之間以及屬群內(nèi)各屬之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系長期以來一直是一個懸而未決而且爭議頗多的難題。本研究首次應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)手段,對直突搖蚊亞科高級分類階元進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的分析研究,論文分為四個部分:
2、 第一部分總論:對搖蚊科及直突搖蚊亞科的分類學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育研究的歷史及現(xiàn)狀進(jìn)行了簡單的回顧,并對其中相關(guān)的系統(tǒng)發(fā)育研究工作進(jìn)行了總結(jié)。同時還簡要的介紹了分子系統(tǒng)學(xué)研究方法,研究現(xiàn)狀,建樹方法,線粒體基因與核基因在昆蟲中的應(yīng)用,總結(jié)了搖蚊科分子系統(tǒng)學(xué)研究的概況。
第二部分:系統(tǒng)闡述了取樣原則和方法步驟。具體介紹了研究過程中標(biāo)本采集,鑒定,試驗方法,設(shè)備型號,分析軟件,運(yùn)算過程與參數(shù)等實驗步驟。
第三部分:用PCR
3、產(chǎn)物直接測序法測定了直突搖蚊亞科及外群33屬39種線粒體基因COII和16SrRNA、核基因28SrDNA的部分片段序列,使用ClustalX1.83進(jìn)行序列比對,MEGA4.1進(jìn)行序列組成分析,按照線粒體基因、核基因、核基因之間聯(lián)合、線粒體與核基因之間聯(lián)合分別組成單基因及聯(lián)合數(shù)據(jù)集。在PAUP*4.0中采用NJ法、MP法、ML法以及在Mrbayes V3.1.2中的貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育推論法構(gòu)建了直突搖蚊亞科高級階元系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,得出以下結(jié)
4、論:
1.線粒體基因COII及16S rRNA具有昆蟲線粒體所具有的高A+T含量,分別為69.8%,和78.4%;COII的變異位點數(shù)目最多,16SrRNA的次之,而核28SrDNA最保守,其A T含量與線粒體基因之間存在著明顯的區(qū)別。
2.數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示:COII的第三位點在分類單元間存在堿基組成偏向性;16SrRNA及COII的第三位點存在堿基替換飽和現(xiàn)象;PTP檢驗揭示四個數(shù)據(jù)集及其聯(lián)合數(shù)據(jù)集都含有顯
5、著區(qū)別于隨機(jī)信號的系統(tǒng)發(fā)育信息;ILD檢驗顯示核基因間不存在異質(zhì)性,其它聯(lián)合數(shù)據(jù)集之間存在異質(zhì)性。
3.采用四種方法對四個數(shù)據(jù)集以及各聯(lián)合數(shù)據(jù)集分別構(gòu)建MP,ML,NJ,BI樹,比較它們之間的差異,結(jié)果表明聯(lián)合數(shù)據(jù)集四種樹解析力在解釋一些屬群關(guān)系方面優(yōu)于單基因建樹,而且核基因與線粒體聯(lián)合要優(yōu)于核基因聯(lián)合樹,四個基因片段聯(lián)合ML樹和BI樹優(yōu)于MP樹和NJ樹。分析認(rèn)為基因聯(lián)合可以增加樹的解析力,進(jìn)而推測單個基因數(shù)據(jù)存在的系統(tǒng)發(fā)
6、育噪音如堿基偏向性,堿基替換飽和,以及基因間的不相合因素可能在聯(lián)合建樹時彼此消長從而提高了樹的穩(wěn)健性。
4.基于分子數(shù)據(jù)構(gòu)建的直突搖蚊亞科內(nèi)類群間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
①裸須搖蚊屬為較早分化出來的類群,解釋了該屬在該亞科中的原始性。
②棒脈一真開氏搖蚊屬群較早被分出,支持依據(jù)形態(tài)特征得到的該屬群是一個單系的推論,也解釋了在形態(tài)上它們具有相似的一些近祖特征,它們之間的關(guān)系為((心突搖蚊屬,真開氏搖蚊屬)雅
7、明搖蚊屬)(棒脈搖蚊屬,提尼曼搖蚊屬))。
③環(huán)足搖蚊復(fù)合體得到很好的支持,它們的關(guān)系為((((環(huán)足搖蚊屬,擬毛突搖蚊屬)齒搖蚊屬)擬突搖蚊屬)(流環(huán)足搖蚊屬,刀突搖蚊屬))構(gòu)成環(huán)足搖蚊屬復(fù)合體:但是沒有與直突搖蚊屬形成環(huán)足一直突搖蚊屬群,由于研究所取的直突種類有限,我們的結(jié)論有待于進(jìn)一步尋求更多,更充分的證據(jù)。
④((陸直突搖蚊屬,偽直突搖蚊屬)擬毛突搖蚊屬)構(gòu)成偽直突搖蚊屬群;(擬開氏搖蚊屬,克萊施密搖蚊
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