單基因擾動(dòng)的自適應(yīng)灰關(guān)聯(lián)聚類算法.pdf

1、隨著人類基因組計(jì)劃的完成，對(duì)基因功能的揭示成為后基因組時(shí)代的研究熱點(diǎn)。而基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究正是從全局的變化中探索基因功能，研究基因之間的相互調(diào)控表達(dá)關(guān)系。 研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的方法一般包括計(jì)算機(jī)方法和生物學(xué)方法。計(jì)算機(jī)方法包括聚類分析建立模型和通過(guò)“逆向工程”方法推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。其中聚類方法使用廣泛，且已有方法較多，通過(guò)聚類找出具有相似功能，表達(dá)模式也相似的基因集合，這是研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的有效的重要得方法之一。 生物學(xué)方

2、法一般使用基因擾動(dòng)實(shí)驗(yàn)，它通過(guò)操縱一個(gè)基因或其產(chǎn)物來(lái)控制基因活動(dòng)，從中獲得基因相互調(diào)控關(guān)系的信息，從而重構(gòu)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。由于生命組織的基因組規(guī)模巨大，而單個(gè)基因擾動(dòng)一般需要1-3個(gè)月，且花費(fèi)高昂，因此單基因擾動(dòng)實(shí)驗(yàn)的對(duì)象一般為局部組織。單基因擾動(dòng)實(shí)驗(yàn)采取全基因擾動(dòng)方法，即每個(gè)參與實(shí)驗(yàn)的基因都進(jìn)行一次擾動(dòng)，一旦選取的實(shí)驗(yàn)基因數(shù)量過(guò)大，而其中存在一些對(duì)于構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)沒(méi)有太大影響的基因，就會(huì)造成實(shí)驗(yàn)成本的不必要上升和實(shí)驗(yàn)周期的無(wú)端增加。因