基于多信息融合的蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測方法研究.pdf

1、蛋白質(zhì)只有處于特定的細胞器如線粒體、細胞核、細胞質(zhì)等，才能參與正常的生命活動。蛋白質(zhì)亞細胞定位信息可以為蛋白質(zhì)功能的預(yù)測提供有用的線索，也能對蛋白質(zhì)的相互作用、進化研究等提供必要的信息。生物實驗方法既費時又費力，在實際應(yīng)用中遠遠不能滿足生物序列數(shù)據(jù)急劇增長的需要。為了加速蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的注解進程，越來越多的研究者利用智能計算方法進行蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測。本文針對蛋白質(zhì)信息的提取、融合及預(yù)測等信息處理問題，主要研究內(nèi)容如下：
　　

2、1.綜述了近幾年蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測的研究進展，主要是蛋白質(zhì)序列的特征信息提取和預(yù)測分類算法。常見的特征表示有氨基酸組分信息，偽氨基酸組分信息和位置特異性得分矩陣等，以及后來研究者逐漸廣泛使用的基于基因本體論和功能域等的方法。預(yù)測分類方法主要是支持向量機和K近鄰等。
　　2.提出了一種基于氨基酸的進化保守信息和位置特異性得分矩陣信息融合的蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測方法?；诎被嵝蛄刑岢龅鞍踪|(zhì)序列的進化信息和保守信息；對氨基酸序列的位置

3、特異性得分矩陣進行分割，經(jīng)不同分割比例實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)黃金分割比例達到最優(yōu)，進而提出黃金分割法并統(tǒng)計分割后片段的組分信息；將以上幾種信息融合應(yīng)用于凋亡蛋白數(shù)據(jù)集的亞細胞定位預(yù)測，ZD98數(shù)據(jù)集和CL317數(shù)據(jù)集的全局準確率分別達到98.98％和91.11%。
　　3.提出了一種基于蛋白質(zhì)序列的共有序列組分信息和基因本體論信息融合的蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測方法研究?；谠夹蛄泻凸灿行蛄行畔⑻崛。Y(jié)合氨基酸的物化性質(zhì)信息，通過搜索基因本體論