疫苗臨床試驗數(shù)據(jù)標準化和項目管理網(wǎng)絡(luò)化實現(xiàn)初探.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  疫苗的應(yīng)用大大提高了現(xiàn)代人群的健康水平,疫苗臨床試驗的結(jié)果決定了疫苗是否能夠普及應(yīng)用,在這其中,規(guī)范數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析過程與疫苗的研制及其動物實驗、臨床試驗過程同樣至關(guān)重要。為了規(guī)范數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析的整個過程,從全局上研究如何對此部分進行項目管理,實現(xiàn)從創(chuàng)建變量開始到統(tǒng)計分析結(jié)束所有信息都可追溯并且有相應(yīng)的具體內(nèi)容規(guī)范文件和事件記錄文件,在此基礎(chǔ)上設(shè)計出符合現(xiàn)代網(wǎng)絡(luò)化的電子項目管理系統(tǒng)。
  方法:
  

2、以臨床數(shù)據(jù)交換標準協(xié)會(Clinical Data Interchange Standards Consortium,CDISC)標準為基礎(chǔ),根據(jù)臨床數(shù)據(jù)獲取協(xié)調(diào)標準(Clinical Data Acquisition Standards Harmonization,CDash)說明中的變量名命名法則對用以收集原始數(shù)據(jù)的電子化病例報告表(Case ReportForm,CRF)的變量命名進行定義,以制作出符合CDash標準的變量名列表,

3、并在此變量名列表基礎(chǔ)上制作病例報告表注釋(CRF annotation,aCRF),根據(jù)CRF注釋法則配合CDash標準變量命名列表和標準編碼建立CDash aCRF注釋文件。以分析數(shù)據(jù)模型(Analysis DatasetModel,ADaM)標準制作符合疫苗臨床試驗統(tǒng)計分析使用的分析數(shù)據(jù)集。在這個過程中使用SAS軟件編寫宏程序以完成數(shù)據(jù)管理過程所需要的數(shù)據(jù)處理。
  以中國疾病預(yù)防控制中心開發(fā)的流行病學(xué)動態(tài)數(shù)據(jù)采集平臺(Epi

4、demiological DynamicData Collection platform,EDDC)為基礎(chǔ),運用其已有功能搭建出針對數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析的疫苗臨床試驗項目管理系統(tǒng),根據(jù)疫苗臨床試驗的數(shù)據(jù)管理計劃(Data Manage Plan,DMP)將從數(shù)據(jù)管理到統(tǒng)計分析的全部過程按照時間順序制作表格后在EDDC系統(tǒng)中形成電子化模式,并利用系統(tǒng)管理員權(quán)限設(shè)定用戶分層權(quán)限,利用服務(wù)器終端的網(wǎng)絡(luò)和數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)儲存功能實現(xiàn)平臺的網(wǎng)絡(luò)化。對從系

5、統(tǒng)中導(dǎo)出的文件通過SAS軟件處理后,利用SAS AF建立人機交互界面的功能制作系統(tǒng)相對應(yīng)的疫苗臨床試驗進度查詢插件,插件中所需要的程序由SAS軟件進行編寫。
  結(jié)果:
  建立了適用于疫苗臨床試驗的CDash標準變量名列表,并與變量名長度限制在八個字符的Epidata等常用錄入軟件的變量命名一一對應(yīng),在此基礎(chǔ)上進行電子化CRF的建庫,并創(chuàng)建了疫苗臨床試驗項目相對應(yīng)的aCRF注釋文件,通過SAS軟件編程實現(xiàn)了非標準和標準變量

6、命名之間的轉(zhuǎn)換。根據(jù)疫苗臨床試驗統(tǒng)計分析特點和常用的分析指標建立了ADam標準的受試者水平分析數(shù)據(jù)集(ADam Subject-Level Analysis Dataset,ADSL)、基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(ADam Basic Data Structure,BDS)分析數(shù)據(jù)集以及其相應(yīng)的分析數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)和分析變量元數(shù)據(jù)文件。
  搭建疫苗臨床試驗項目管理系統(tǒng),實現(xiàn)了外網(wǎng)訪問,并配備有離線端手機端等多種訪問形式。系統(tǒng)能夠?qū)γ總€臨床試驗項目

7、的數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析過程中產(chǎn)生文件進行保存,并自動記錄操作時間和負責(zé)人員的信息,對系統(tǒng)設(shè)立了賬戶權(quán)限分級,整個系統(tǒng)可定期自動備份至網(wǎng)絡(luò)云盤。運用SAS AF模塊制作了配套的進度查詢插件,并以兩種形式對其進行配置:項目管理系統(tǒng)數(shù)據(jù)導(dǎo)出后用SAS程序進行處理放入插件相應(yīng)文件夾內(nèi)或在項目進行過程中直接通過插件逐條將內(nèi)容輸入。
  討論:
  CDICS標準在中國疫苗臨床試驗中的應(yīng)用仍然處于起步階段,疫苗與藥物有所區(qū)別和獨有的部分目

8、前在CDICS標準中還沒有明確的描述,現(xiàn)在按照CDISC命名和分域規(guī)則得到的變量名列表需要在之后不斷的實際應(yīng)用中進行擴充和完善。國內(nèi)目前還沒有對aCRF做出明確的要求,但是從長遠角度看,aCRF的建立定義了eCRF中每個變量的變量名、格式、長度和單位等等的必要信息,規(guī)范了數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析,使其更加透明化,標準化,并能更好的連接整個團隊的工作,提高了效率,有效減少了錯誤的發(fā)生。ADam分析數(shù)據(jù)集的應(yīng)用則是將CDash標準下的原始數(shù)據(jù)集和

9、之后的分析處理過程連接了起來。
  我國臨床試驗周期相對較長,在這個過程中又可能同時進行若干個不同的試驗項目,數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析又往往由不同的人員進行處理,將這一過程中發(fā)生的事件全部記錄下來,文件全部歸類保存就顯得尤為重要。項目管理系統(tǒng)對于長期進行臨床試驗項目的研究機構(gòu)非常必要,EDDC項目管理系統(tǒng)可以對已完成的項目和正在進行或還未進行的項目進行一定的規(guī)劃和處理,并且每進行一次臨床試驗,從中吸取經(jīng)驗后進行改進使整個系統(tǒng)更加完善。在

10、線、離線、多客戶端以及SASAF進度查詢插件可以滿足不同環(huán)境下對管理系統(tǒng)的使用。但是也存在著一些問題,這些客戶端之間和網(wǎng)絡(luò)端之間的連接較為單向,即離線端能上傳至網(wǎng)絡(luò)端,但網(wǎng)絡(luò)端的數(shù)據(jù)只能供進度查詢插件使用,仍有很多地方需要進一步優(yōu)化。
  結(jié)論:
  CDISC標準與臨床試驗相結(jié)合從對原始數(shù)據(jù)的采集就開始運用CDash標準進行變量命名并將其屬性、長度和單位都明確定義能夠?qū)?shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析起到很好的規(guī)范作用,分域制作的變量名

11、列表可以隨著試驗項目累積不斷擴展,用SAS軟件編寫的變量名替換宏程序在數(shù)據(jù)管理程序之前運行一次就可以將傳統(tǒng)錄入軟件中不規(guī)范的命名轉(zhuǎn)換為CDash標準的變量名,標準化后的變量名與研究數(shù)據(jù)列表模型(Study Data Tabulation Model,SDTM)和ADam分析數(shù)據(jù)集變量命名之間的映射有助于數(shù)據(jù)在各個結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)集之間轉(zhuǎn)換,并且標準化后的變量名即使脫離了數(shù)據(jù)集也能了解其含義。ADam標準下的分析數(shù)據(jù)集有助于統(tǒng)計分析結(jié)果的重現(xiàn),

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