陸地棉產(chǎn)量、纖維品質(zhì)等性狀與SSR標記的關聯(lián)分析.pdf

1、作為世界上最重要的天然纖維作物，棉花為我國紡織產(chǎn)業(yè)的發(fā)展作出了重大貢獻。當前，提高產(chǎn)量、改善纖維品質(zhì)是棉花育種工作的重要目標。在充分了解陸地棉品種（系）的遺傳多樣性的基礎上，篩選到與產(chǎn)量、纖維品質(zhì)等性狀相關聯(lián)的標記位點，對拓寬棉花育種的遺傳基礎以及提高棉花育種效率具有重要意義。
　　 1.本研究利用均勻分布于26條染色體上的125對SSR標記對126份陸地棉品種（系）進行遺傳多樣性、群體結構和連鎖不平衡(LD)分析;并進行了產(chǎn)量

2、和纖維品質(zhì)等性狀與SSR標記的關聯(lián)分析，發(fā)掘出一批優(yōu)異的等位變異位點。獲得主要結果如下:(1)遺傳多樣性分析檢測到125個位點，共有423個等位變異，平均每個標記為3.38個，基因多樣性含量(GDC)平均值為0.49，多態(tài)性信息含量(PIC)平均值為0.41，說明供試材料遺傳多樣性比較豐富。
　　 (2)使用Structure軟件推算126份陸地棉材料結構，確定存在2個類群，且品種（系）的分類具有地域性。與采用Nei氏距離聚類的

3、結果比較具有較高的一致性。
　　 (3)使用TASSEL軟件進行連鎖不平衡分析表明，D’＞0.5的位點組合占11.95％，支持的不平衡成對位點(P＜0.01)組合占7.13％。表明，陸地棉SSR標記位點間LD水平整體較低。但連鎖不平衡矩陣圖顯示陸地棉染色體上LD分布不均勻，在A13、D1和D8染色體上LD水平較高。
　　 (4)通過關聯(lián)分析，共檢測出55個標記與14個性狀呈極顯著關聯(lián)，其中與單株鈴數(shù)、果枝數(shù)、株高、鈴重、

4、衣分、種仁蛋白含量、種仁脂肪含量、纖維長度、纖維比強度、馬克隆值、短纖維含量、纖維整齊度、纖維伸長率及纖維反射率呈極顯著相關聯(lián)的分子標記分別有11、1、1、1、4、7、4、6、4、1、2、1、9和3個。研究結果為這些性狀的分子標記輔助育種奠定了基礎。
　　 (5)通過關聯(lián)分析進行了優(yōu)異等位變異的發(fā)掘，檢測到大量標記位點與產(chǎn)量、品質(zhì)等性狀相關聯(lián)，發(fā)掘出了一批關聯(lián)優(yōu)異位點、等位變異及攜帶優(yōu)異等位變異的載體材料。為棉花育種中的親本選拔

5、、組合選配及后代等位變異輔助選擇提供了重要參考信息。
　　 2.利用CodonW軟件對棉花13個A、D基因組二倍體棉種和2個異源四倍體棉種的核基因組蛋白編碼序列進行了同義密碼子偏愛性分析，主要結果如下:
　　 (1)不同棉種的密碼子堿基構成相似，而且使用T結尾的頻率高于A，使用C結尾的頻率高于G，即密碼子第三位堿基上嘧啶出現(xiàn)頻率高于嘌呤。RSCU值分析表明不同棉種在密碼子選用上存在明顯的偏愛性，并且這種偏愛性在不同棉種間

6、存在較高的一致性;確定了在15個棉種中通用的20個高頻密碼子，并通過比較兩個高低密碼子偏性庫RSCU值，確定出15個棉種的15個最優(yōu)密碼子(Preferred codon)（△RSCU≥0.3）。
　　 (2) ENC-plot分析表明密碼子偏性用法主要由突變和選擇共同作用所致，其中選擇起主導作用。與前人研究比較發(fā)現(xiàn)，陸地棉核基因組與葉綠體基因組在涉及8種氨基酸的高頻密碼子上和最優(yōu)密碼子上存在較大差異。
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