基于貝葉斯網(wǎng)絡(luò)模型的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、現(xiàn)代科技的發(fā)展,尤其是生物實驗技術(shù)和下一代基因測序設(shè)施的發(fā)展,每天都會產(chǎn)生大量的生物實驗數(shù)據(jù)。為了有效的分析和利用這些數(shù)據(jù),需要構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),去挖掘隱藏在數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)現(xiàn)象、原因。現(xiàn)在如何更好的實現(xiàn)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,已經(jīng)成了生物信息學(xué)的十分熱門研究方向之一。在這篇文章中,通過對比用于建立基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的一般模型,發(fā)現(xiàn)貝葉斯網(wǎng)絡(luò)模型最適用于建立基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),同時采用了正態(tài)分布的思想給數(shù)據(jù)填充缺失值,并調(diào)用R語言中有關(guān)包,對比分析爬山

2、、禁忌等算法在構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)上的優(yōu)劣。通過構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),我們可以探索到各個基因之間的相互影響和調(diào)控關(guān)系。這可以指導(dǎo)我們更加清楚的了解疾病產(chǎn)生的根源,進而能夠有效的診斷出是什么疾病,并根據(jù)基因表達的水平,設(shè)計具有針對性地藥物,這對現(xiàn)代醫(yī)學(xué)、藥學(xué)地發(fā)展有著相當(dāng)重要的促進作用。本文主要研究了如何通過貝葉斯網(wǎng)絡(luò)模型來模擬、構(gòu)建真實的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為了提高所構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)的精確程度,采用了BDE評分函數(shù)、貪婪的爬山算法等手段來實現(xiàn),同時還采用了信

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