基于支持向量機的含平面?zhèn)谓Y的RNA二級結構預測.pdf

1、隨著人類基因組計劃實施的不斷深入，生物學的數(shù)據(jù)信息飛速增長，如何從這些海量數(shù)據(jù)中提取有用的知識，揭示這些數(shù)據(jù)所蘊含的生物學意義，是對計算機科學的巨大挑戰(zhàn)。從結構上來挖掘生物分子在生命過程中的作用，首先要解決的問題就是結構預測。偽結是 RNA二級結構中最難預測的一種，目前的算法主要是對平面?zhèn)谓Y進行預測。平面?zhèn)谓Y對RNA功能的實現(xiàn)起著關鍵的作用，對含平面?zhèn)谓Y的RNA二級結構預測的研究具有重要的現(xiàn)實意義。
　　首先，本文針對RNA堿基的

2、預測分類問題進行研究，給出了基于FDAGSVM的對RNA堿基進行預測分類的算法。RNA堿基的準確分類是正確預測其二級結構的前提，該算法對決策結果進行了模糊化處理，以計算模糊隸屬度代替取符號運算，并依據(jù)模糊隸屬度的值決定樣本在決策有向無環(huán)圖中的路徑。
　　其次，針對利用E-NSSEL標識序列恢復RNA二級結構過程中堿基的編碼問題，本文提出了一種把 RNA序列中可能配對的兩個堿基看作為一個整體進行編碼的方法。先將一個堿基的局部環(huán)境模式