RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)圖形表示法及相似性分析研究.pdf_第1頁(yè)
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1、生物序列的表示和比較是生物信息處理的兩個(gè)基本問(wèn)題，也是近年來(lái)生物信息學(xué)研究的重點(diǎn)。RNA是重要的生命物質(zhì)，隨著最近非典、禽流感等病毒的出現(xiàn)，作為其主要遺傳物質(zhì)的RNA也逐漸成為研究的重點(diǎn)之一。 本文以RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的分析比較為背景，提出了新的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)圖形表示方法，為生物序列的分類(lèi)、分析、比較和儲(chǔ)存等研究提供了新的途徑。另外，還展示這些表示法在RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)相似性分析上的具體應(yīng)用。 通過(guò)對(duì)現(xiàn)有的RNA圖形表示法的研究

2、分析，在廖波提出的三維表示法的基礎(chǔ)上，擴(kuò)充了堿基的分類(lèi)，增加了假結(jié)內(nèi)外自由基的劃分，提出了一種新的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)三維圖形表示法－S曲線組表示法。采用矩陣不變量的方法，將S曲線組表示法應(yīng)用在6種典型的RNA分子片斷的相似性分析上，可以有效的計(jì)算出它們之間的相似度。S曲線組表示法包含更豐富的生物學(xué)信息，對(duì)RNA分子的相似性比較和分析更加準(zhǔn)確。 小波分析是近些年來(lái)迅速發(fā)展的信號(hào)處理方法，本文提出了一種可以將RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)表示成為波形信

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