幾種胡敏酸和富里酸分子結(jié)構(gòu)模型的三維可視化與特性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、選取幾種經(jīng)典的胡敏酸和富里酸模型,使其與金屬離子和西瑪嗪分子(有機農(nóng)藥分子)作用,將生成的結(jié)合物利用HyperChem軟件繪制二維分子結(jié)構(gòu)模型,然后將其進行三維轉(zhuǎn)換和結(jié)構(gòu)優(yōu)化。據(jù)優(yōu)化過程生成日志文件中的能量值、能量梯度及計算得出QSAR特征參數(shù),從模型之間、模型與單體之間,對計算得到的三維模型性質(zhì)加以對比和分析得出結(jié)論,通過主成分分析方法對上述結(jié)論進行驗證。結(jié)果表明: 1.從不同的HA與FA模型的疏水性順序和O/C原子數(shù)比值排序

2、對照可知,模擬腐殖酸模型的疏水性與該模型O/C原子數(shù)比值成反比,腐殖物質(zhì)本身具有較強的親水性(即較低的疏水性),HA模型中的Dragunov-HA和FA模型中的Schnitzer和Khan模型更符合這一點。胡敏酸的Stevenson-HA、Dragunov-HA和富里酸的Alvarez-Puebla模型在水溶液中和高溫條件下都能達到更好的穩(wěn)定性。胡敏酸分子Dragunov-HA和富里酸分子Schnitzer和Khan模型比其它胡敏酸、富

3、里酸分子模型的疏水性強,胡敏酸分子Felbeck-HA和富里酸分子Buffle-FA的折射性、極性比其它胡敏酸、富里酸分子模型強。 2.在Hyperchem軟件操作平臺上,對幾種胡敏酸、富里酸分子模型與金屬離子K<'+>、Na<'+>、Ca<'2+>、Pb<'2+>的結(jié)合物進行三維模擬。從結(jié)合物模型之間、模型與單體之間對比結(jié)合物模型的QSAR參數(shù),得出各種模型的特點。綜合比較結(jié)果表明:Fuchs-HA和Alvarez-FA與金屬

4、離子結(jié)合物的疏水性小于其他它腐殖酸分子;Felbeck-HA和Buffle-FA與金屬離子結(jié)合物的折射性、極性、近似表面積、柵格表面積、體積、質(zhì)量同比小于其它腐殖酸分子。疏水性與折射性、極性、近似表面積、柵格表面、體積、質(zhì)量在HA和FA與金屬離子結(jié)合物模型上表現(xiàn)出的不同,應用主成分分析的結(jié)果正好驗證了上述現(xiàn)象,說明此軟件對于腐殖質(zhì)結(jié)構(gòu)設(shè)計具有一定的可信度。因此,我們得出Felbeck-HA和Buffle-FA與金屬離子結(jié)合物相比其它模型

5、結(jié)合物的結(jié)構(gòu)更加合理。 3.以Hyperchem軟件為工具建立胡敏酸、富里酸與西瑪嗪分子結(jié)合物模型,得出結(jié)論為:總的來說,與胡敏酸和富里酸單體相比,結(jié)合物的QSAR參數(shù)都增加了,其中Fuchs-HA和Alvarez-FA與西瑪嗪分子結(jié)合物的疏水性、近似表面積同比小于其它結(jié)合物,然而,F(xiàn)elbeck-HA和Buffle-FA與西瑪嗪分子結(jié)合物,在剩下的QSAR參數(shù)中,均同比小于結(jié)合物。主成分分析將疏水性和近似表面積劃分為一組,其它

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