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文檔簡介
1、目的:采用人結(jié)腸癌HT-29為親本細(xì)胞株,持續(xù)藥物濃度遞增法構(gòu)建人結(jié)腸癌耐藥細(xì)胞株,細(xì)胞學(xué)觀察腫瘤細(xì)胞生物學(xué)特性變化,全人類基因組表達(dá)譜芯片分析比較兩株細(xì)胞基因表達(dá)譜差異,初步探索結(jié)腸癌細(xì)胞中可能與5-Fu耐藥相關(guān)的基因,為今后進(jìn)一步研究耐藥機制、篩選耐藥分子標(biāo)記物奠定基礎(chǔ)。
方法:⑴采用5-Fu持續(xù)接觸濃度梯度遞增法構(gòu)建人結(jié)腸癌耐藥細(xì)胞株HT-29/5-Fu;⑵觀察耐藥細(xì)胞株HT-29/5-Fu的生物學(xué)特性:觀察細(xì)胞形態(tài)變化
2、和克隆形成率;MTT法測定生長曲線和藥物敏感性;Western blot分析胸苷酸合成酶(TS)、二氫嘧啶脫氫酶(DPD)的表達(dá)情況;流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期和凋亡;⑶利用全人類基因組表達(dá)譜芯片檢測耐藥細(xì)胞株HT-29/5-Fu及其親本HT-29細(xì)胞差異表達(dá)的基因,并運用生物信息學(xué)的方法篩選出可能與5-Fu耐藥相關(guān)的基因及通路。
結(jié)果:①歷時10個月成功建立了能在1μg/mL5-Fu濃度下穩(wěn)定生長的耐藥細(xì)胞株HT-29/5-Fu
3、;②HT-29/5-Fu耐藥細(xì)胞的生物學(xué)特性發(fā)生改變,其耐藥指數(shù)為3.59;與HT-29細(xì)胞相比,HT-29/5-Fu細(xì)胞形態(tài)發(fā)生改變,生長緩慢,克隆形成率降低,TS和DPD高表達(dá),S期細(xì)胞比例增多,更能耐受5-Fu誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡;③基因芯片結(jié)果顯示:HT-29/5-Fu耐藥細(xì)胞與其親本HT-29細(xì)胞相比,共有211個差異表達(dá)的基因(變化倍數(shù)≥2或≤0.5),其中有115個基因表達(dá)上調(diào)(變化倍數(shù)≥2),96個基因下調(diào)(變化倍數(shù)≤0.5)
4、。這些表達(dá)失調(diào)的基因中有17個基因已被報道過與各種化療藥物耐藥相關(guān),其中與5-Fu耐藥密切相關(guān)的基因包括編碼5-Fu作用靶酶的TYMS、ABCG2、YES1和MDK。另外,某些差異表達(dá)的基因還與多藥耐藥(M DR)、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EM T)、腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲、抗凋亡和細(xì)胞周期捕獲等相關(guān)。GO(基因功能)分析結(jié)果顯示上述差異表達(dá)基因在跨膜轉(zhuǎn)運活性、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)活性、DN A結(jié)合以及轉(zhuǎn)錄因子活性等分子功能方面得到了富集。KEGG通路分析顯示
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