應用生物信息學篩選，Id2對人膠質母細胞瘤化療藥物敏感性的影響.pdf

1、第二軍醫(yī)大學博士學位論文應用生物信息學篩選，Id2對人膠質母細胞瘤化療藥物敏感性的影響姓名：趙振宇申請學位級別：博士專業(yè)：外科學（神經外科）指導教師：盧亦成陳菊祥20100501第二軍醫(yī)大學博士學位論文第一部分應用生物信息學篩選人膠質母細胞瘤化療相關的基因目的：本部分實驗旨在應用生物信息學技術篩選影響膠質母細胞瘤患者生存時間和化療藥物作用相關的基因。方法：對2批膠質瘤患者Biostar基因芯片和1批膠質瘤患者Affymetrix基因芯片

2、進行分析。通過長期隨訪，完善芯片中膠質瘤患者的臨床資料。以生存時間12個月將膠質母細胞瘤患者分為生存時間長、短兩組，篩選兩組間差異基因及與化療藥物作用相關的差異基因，明確差異基因參與的功能和通路，并構建與化療藥物作用相關基因參與的信號傳導網絡，從而篩選出影響化療效果的核心基因。結果：2003年BIOSTAR芯片，2007年BIOSTAR芯片和2007Affymetrix芯片中GBM生存時間長短兩組間與化療藥物相關的差異基因分別是429條

3、，74條，2018條。3批芯片的差異基因主要參與8l項基因功能，主要參與36條信號傳導通路。通過對差異基因功能、通路、網絡的分析，得到影響膠質母細胞瘤化療藥物作用的核心基因29條。結論：通過嚴謹的實驗設計和科學的統(tǒng)計學判別，結合患者完整的生存資料，可應用生物信息學對基因芯片的大量數據進行挖掘和分析。篩選出29條影響GBM患者生存時間，影響GBM化療藥物作用的核心基因，為進一步功能實驗奠定基礎，為GBM患者的預后判斷和個性化治療提供依據。

4、關鍵詞：膠質母細胞瘤，基因芯片，生物信息學，化療敏感性第二部分Id2在腦膠質瘤組織和膠質瘤細胞株中的表達研究目的：研究Id2在正常腦組織、不同級別腦膠質瘤組織及膠質細胞株和惡性膠質瘤細胞株U87、U251、SHG44中的mRNA和蛋白表達水平。方法：應用real—timePCR檢測Id2mRNA的在28例不同級別腦星形膠質細胞瘤和4例正常腦組織以及膠質細胞株和惡性膠質瘤細胞株U87、U251、SHG44中的表達。應用免疫組織化學染色檢測

5、Id2在56例腦星形膠質細胞瘤組織和4例正常腦組織中的蛋白表達水平，應用Westernblot檢測Id2的在28例不同級別腦星形膠質細胞瘤和4例正常腦組織的蛋白表達水平。結果：real—timePCR結果提示Id2mRNA表達水平在星形膠質瘤組織中明顯上調，與正常腦組織相比差異有統(tǒng)計學意義(43533532VS189116：P=O000)。Id2mRNA水平在高級別膠質瘤組織中的表達水平明顯高于低級別膠質瘤，二者之間差異有統(tǒng)計學意義(5