基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的特征基因提取和分類方法的研究.pdf

1、DNA微陣列技術(shù)的高速發(fā)展，使得能夠在一張微型的芯片上同一時(shí)間監(jiān)測(cè)數(shù)以萬計(jì)的基因在同一條件下的基因表達(dá)水平，它不但有利于判定腫瘤組織的類別及其新亞型的發(fā)現(xiàn)，而且為腫瘤分子生物學(xué)方面的研究提供了可靠的科學(xué)依據(jù)。隨著技術(shù)和實(shí)驗(yàn)儀器的不斷發(fā)展，產(chǎn)生了大量基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，通過研究分子水平上腫瘤的發(fā)生發(fā)展機(jī)制，定位腫瘤相關(guān)基因、揭示腫瘤基因間的調(diào)控關(guān)系從而為腫瘤的診斷和治療開辟一條新的途徑。
　　本文基于腫瘤基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行了特征基因提取

2、和分類方法的初步研究，且分析了對(duì)應(yīng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。主要內(nèi)容如下:
　　1.針對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)中奇異值對(duì)樣本一階信息和二階信息的影響，提出了一種基于鄰域不定性信息和記分準(zhǔn)則的腫瘤特征基因的提取方法，首先，利用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)樣本點(diǎn)集的鄰域不定性信息找出最具代表性的樣本點(diǎn)基因表達(dá)值;然后，把該樣本點(diǎn)及其周邊鄰近點(diǎn)的基因表達(dá)值看作下一步分析的對(duì)象，結(jié)合記分準(zhǔn)則提取腫瘤特征基因子集;最后，使用KNN分類器對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行分類實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)采用了利用D