西北干旱半干旱地區(qū)甘草根瘤菌遺傳多樣性研究.pdf

1、在數(shù)值分類(lèi)的基礎(chǔ)上，利用PCR-RFLP技術(shù)對(duì)39甘草根瘤菌的16SrDNA，23SrDNA，IGS，nodA和nifH5個(gè)基因片段的指紋圖譜進(jìn)行了研究。首次利用分子手段研究了西北干旱半干旱地區(qū)甘草根瘤菌的遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育地位。 對(duì)16SrDNA的四種限制性酶切圖譜的研究顯示，所有菌株在75％的相似水平上聚為3個(gè)類(lèi)群，第Ⅰ類(lèi)群在85.0％的水平上被分為2個(gè)小的亞群，第1亞群的9株供試菌株同參比菌株R.galegae(HAMB

2、I540)聚在一起，第2亞群中供試菌株同參比菌株R.indigoferae(CCBAU71042)聚為一個(gè)小的亞群。這表明此類(lèi)群和根瘤屬有較為緊密的親緣關(guān)系。第Ⅱ類(lèi)群中的供試菌株和參比菌株，在83.0％的相似水平上被劃分成3個(gè)小的亞群，第1和第2亞群分別與根瘤菌屬、中慢生根瘤菌屬聚在一起，但第3亞群中的5株菌沒(méi)有和任何參比菌株聚在一起，因此對(duì)于這5株菌的分類(lèi)地位需要利用分子雜交等實(shí)驗(yàn)方法進(jìn)行深入的研究。第Ⅲ類(lèi)群中NWGSH005、NWX

3、SHG007和NENG0033株供試菌株和快生根瘤菌在95％的相似水平上聚在一起，S.meliloti是這一類(lèi)群的中心菌株。 16SrDNA的PCR-RFLP的分析結(jié)果表明，分離自中國(guó)西北干旱半干旱地區(qū)的甘草根瘤菌存在明顯的遺傳多樣性，他們分別和根瘤菌、中慢生根瘤菌和中華根瘤菌屬的參比菌株聚為一起。 由23SrDNA的PCR-RFLP分析結(jié)果可以看出，在85.0％的相似水平上新疆和陜西的菌株分別聚為四個(gè)單獨(dú)的類(lèi)群。新疆的

4、菌株大部分分布在第Ⅰ和第Ⅱ類(lèi)群中，而陜西的菌株大部分分布在第Ⅳ類(lèi)群中。在23SrDNA分析結(jié)果中可以看出，所有供試菌株都表現(xiàn)出了很強(qiáng)的地域性。來(lái)源于新疆的菌株存在著更為豐富的遺傳多樣性，因?yàn)樾陆木曛g存在更大的遺傳距離，類(lèi)群Ⅰ和類(lèi)群Ⅱ在65.0％的相似水平上聚為一個(gè)大的遺傳群，中間被參比菌株隔開(kāi)。來(lái)自陜西、寧夏的菌株主要集中在第Ⅲ和第第Ⅳ類(lèi)群中，它們?cè)?0.0％的相似水平上聚在一起。 IGS的酶切結(jié)果顯示出豐富的遺傳多樣性，

5、基因型多達(dá)33種。由聚類(lèi)分析圖可以看出，所有菌株在68.0％的相似水平上聚在一起，在83.0％的相似水平上，供試菌株和參比菌株分成五個(gè)主要類(lèi)群，在IGSPCR-RFLP分析中參比菌株沒(méi)有以種屬的形式分開(kāi)。在85.0％的相似水平上，第Ⅰ類(lèi)群的6株菌和第Ⅲ類(lèi)群的5株菌(全部來(lái)自新疆)沒(méi)有同任何參比菌株聚在一起，說(shuō)明新疆的菌株受地域性影響較大。新疆地處內(nèi)陸，在長(zhǎng)期的進(jìn)化過(guò)程中甘草根瘤菌容易形成了獨(dú)立的分類(lèi)群。 對(duì)數(shù)值分類(lèi)結(jié)果中第一表觀