基于Linux高性能集群的GeoFEM系統(tǒng)移植與應用.pdf

1、本文介紹了基于Linux和MPI的PC集群的構建方法、基于PC集群的GeoFEM系統(tǒng)移植方法、GeoFEM的基本應用流程，以及應用GeoFEM對彈性體受力邊值問題，即受到邊界力時的內(nèi)部結點位移進行模擬的過程與結果。 GeoFEM是一套開放源代碼的大型并行有限元數(shù)值模擬軟件，是日本RIST小組(Research Organization for Information Science ＆Technology)地球模擬器(Earth

2、 simulator-ES)項目的軟件成果之一，其在網(wǎng)格生成和解方程組方面有著十分突出的功能，能對多種地球現(xiàn)象進行數(shù)值模擬。本文側重介紹GeoFEM的移植、測試與應用。 本文的主要工作及成果如下： (1)在榮瑩的研究基礎<'[9]>之上，重新架構并改進其所構建的COW型PC集群。新集群架設過程中，完善了。NFS、NIS、RSH的架構與測試方法，并采用SSH替代RSH作為外部用戶登陸本地集群時的Shell；架設了常用的服務

3、器工具：用autofs實現(xiàn)NFS和常用外設的自動掛載，開放遠程Windows用戶使用Putty登陸時的端口，配置Samba服務器使得各結點無論在Linux還是在Windows下都能即時通信，架構Vsfipd使得各節(jié)點機能夠方便地共享文件。新集群文件共享的便宜性、系統(tǒng)的健壯性都有提高。 (2)安裝調(diào)試了Intel Fortran/CC/C++compiler，和MPI，移植并測試了GeoFEM的多個模塊：IV_constru~，S

4、T，cubmesh，dynamic_linear，gdlcomp，partGeoFEM， static_linear，thermal， ucdl_pvr_module， surfurce_module，thermal_fluid，基本弄清楚了GeoFEM的處理流程與使用方法，并整理成文(由于GeoFEM非商業(yè)化軟件，沒有詳細的使用說明，原Manual非常粗糙，使用起來很不方便)。 (3)在新移植的GeoFEM系統(tǒng)中，利用其已經(jīng)開