棉花SSCP標(biāo)記的開發(fā)及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀的QTL定位.pdf

1、陸地棉和海島棉作為栽培種，分別占全世界產(chǎn)量的95%和2%左右。陸地棉具有高產(chǎn)和環(huán)境適應(yīng)性強(qiáng)的特點，海島棉具有纖維品質(zhì)優(yōu)良的特點，將海島棉中優(yōu)質(zhì)基因轉(zhuǎn)移到陸地棉栽培品種中，培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的棉花品種是目前棉花育種工作的重要目標(biāo)。SNP位點在基因組中普遍存在，大約每1kb就有一個堿基變異，因此SNP標(biāo)記在棉花連鎖圖譜的構(gòu)建和MAS研究中將有重大的影響。
　　 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Single strand conformation poly

2、morphism，SSCP)技術(shù)是一種新型的分子標(biāo)記分析技術(shù)，能夠檢測出單核苷酸的變異，因而被作為一種檢測SNP的方法。SSCP具有豐富的多態(tài)性、強(qiáng)的遺傳穩(wěn)定性和高的覆蓋密度等特點，能夠?qū)υ谝欢ǔ潭壬厦藁ǚ肿訕?biāo)記的多態(tài)性進(jìn)行豐富。本研究是利用纖維發(fā)育相關(guān)基因的contigs設(shè)計引物，開發(fā)SSCP分子標(biāo)記，并進(jìn)行陸海高代回交重組自交系連鎖圖譜的構(gòu)建，挖掘重要農(nóng)藝性狀的QTL，從而為精細(xì)定位及分子標(biāo)記輔助選擇奠定基礎(chǔ)。本研究的主要進(jìn)展有以下

3、幾個方面：
　　 1、根據(jù)纖維發(fā)育相關(guān)基因設(shè)計了137對SSCP引物，其中有65對引物在8個材料間表現(xiàn)出多態(tài)性。對部分SSCP引物的多態(tài)性條帶進(jìn)行測序，結(jié)果表明PCR擴(kuò)增目標(biāo)片段中存在SNP位點。
　　 2、255對SSCP引物在兩個親本和群體間篩選多態(tài)性，其中72對引物在群體中得到多態(tài)性，共得到得到103個標(biāo)記。
　　 3、使用Joinmap4.0對579個標(biāo)記位點進(jìn)行遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建。最后得到包含409個標(biāo)

4、記位點，總長為2054.33cM，平均長度為5.02cM的連鎖圖譜。該圖譜占棉花基因組總長度的41.09%，平均長度為5.02cM。在103個SSCP標(biāo)記中，共有57個標(biāo)記進(jìn)入連鎖群，其中有18個標(biāo)記被定位到染色體上。
　　 4、利用WinQTLCart2.5中的復(fù)合區(qū)間作圖法對衣分、鈴重、籽棉產(chǎn)量、皮棉產(chǎn)量、纖維長度、纖維整齊度、纖維伸長率、馬克隆值、纖維比強(qiáng)度等性狀進(jìn)行QTL位點掃描，在4個環(huán)境中共檢測到81個QTL位點，其

5、中產(chǎn)量性狀定位到35個QTLs，纖維品質(zhì)性狀46個QTLs。
　　 5、6個QTL位點(qFL-28-1，qFL-34-1，qFM-52-2，qFM-52-3，qFE-4-1，qFS-56-1)在兩個環(huán)境下均能檢測到，且均與纖維品質(zhì)有關(guān)。4個QTLs：qFM-52-2，qFM-52-3，qFE-4-1，qFS-56-1不僅表型貢獻(xiàn)率>12%，而且能夠同時在兩個環(huán)境下檢測到，可以用于進(jìn)一步研究分析。
　　 6、得到與5個Q