大白菜DH系遺傳多樣性分析.pdf

1、本研究首先優(yōu)化了非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)，在此基礎(chǔ)上，利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)標(biāo)記了268份大白菜DH材料(3個DH系群體和125份DH材料)，分別構(gòu)建了3個DH系群體以及125份DH材料的聚類圖。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)的檢測效果受到凝膠聚合速度、片段遷移率等多種因素影響。研究比較了凝膠聚合速度及PCR產(chǎn)物在不同濃度凝膠上的檢測效果，不同濃度的凝膠是由40％(19:1)和30％(29:1)2

2、種貯存液分別配制4種濃度(5％，7％，9％，11％)。結(jié)果表明，在4℃-30℃范圍內(nèi)，凝膠聚合速度隨溫度的升高而加快；APS保持不變，不同溫度下TEMED：APS合適配比也不同：4℃(冬)時，TEMED：APS的合適配比是1:10，25℃(春秋)、30℃(夏)，選擇1:20的配比為宜；2種不同貯存液配制的相同濃度凝膠檢測效果不同，30％(29:1)優(yōu)于40％(19:1)。本試驗中，由前者配制7％的凝膠上DNA片段分離效果好，帶型清晰，分

3、辨率高。
　　 2.選取4份形態(tài)學(xué)差異大的大白菜DH材料對122對SSR引物進(jìn)行篩選，共選出12對多態(tài)性強(qiáng)的引物。應(yīng)用所選的12對引物，對所有供試樣品進(jìn)行擴(kuò)增，然后用30％(29:1)7％非變性聚丙烯酰胺凝膠檢測。觀察結(jié)果，發(fā)現(xiàn)SSR引物對不同大白菜DH系群體擴(kuò)增效率不同。Y360(60份)總共擴(kuò)增出37條電泳條帶，其中29條多態(tài)帶，多態(tài)性比率為78％；Y531(48份)總共擴(kuò)增出43條帶，24條多態(tài)帶，多態(tài)性比率為55.8％；

4、YF05(44份)總共擴(kuò)增出41條帶，36條多態(tài)帶，多態(tài)性比率為87.8％；另外的125份材料總共擴(kuò)出61條帶，53條多態(tài)性條帶，多態(tài)性比率為86.9％。
　　 3.對3個DH系群體分別進(jìn)行了聚類分析，結(jié)果表明：大白菜DH系Y360群體在遺傳距離為0.43處分為9個類群，遺傳距離范圍在0-0.71內(nèi)；大白菜DH系YF05群體的聚類圖上，遺傳距離在0.7處分為2個類群，遺傳距離范圍在0.08-0.81內(nèi)。第一類群群材料葉面都有茸毛