南豐蜜橘SSR指紋圖譜構(gòu)建及遺傳多樣性分析.pdf

1、本研究選用22份南豐蜜橘、6份其他南豐地方柑橘品種和4份近緣種為試材，對(duì)其基因組DNA進(jìn)行了提取。通過SSR引物篩選和SSR-PCR擴(kuò)增，構(gòu)建了南豐蜜橘SSR指紋圖譜，并對(duì)其遺傳多樣性進(jìn)行了分析，主要研究結(jié)果如下:
　　 (1)采用改良CTAB法和微量提取法提取供試樣品的基因組DNA，均得到高質(zhì)量DNA，并可以用于SSR-PCR擴(kuò)增。其中微量法有著需樣少，用時(shí)短，省時(shí)省力的特點(diǎn)。
　　 (2)從91對(duì)柑橘SSR引物中篩選

2、出13對(duì)多態(tài)性高的引物，共擴(kuò)增得到67個(gè)等位基因，等位位點(diǎn)數(shù)量在3～8之間，每對(duì)引物平均可以檢測(cè)到5.15個(gè)等位基因位點(diǎn)。多態(tài)信息含量PIC值的變化范圍為0.326～0.680，平均的多態(tài)信息含量為0.482，PCR擴(kuò)增得到的基因片段長度變化范圍在90～400bp之間。
　　 (3)利用篩選得到的13對(duì)SSR特征引物構(gòu)建了南豐蜜橘SSR指紋圖譜。除不能將SS-2，SS-7，SS-12與QB-8區(qū)分外，其余種質(zhì)資源均能區(qū)分。

3、>　　 (4)以遺傳相似系數(shù)0.59為界，能夠?qū)?2份供試樣品分為八大類，其中南豐蜜橘小果系楊小26、SS-1、SS-2、SS-7、SS-9、SS-12、SS-14、SS-28、LX-10、LX-17、LX-21、ST-3、QB-5、QB-8、QW-3、97-1、97-2，桂花蒂，早熟系LS-1，早熟系97-1，大果系LS-1，大果系97-1，蜜廣聚為一類，記為A，說明蜜廣與南豐蜜橘有較近的親緣關(guān)系;小葉廣、火廣、火橘聚為一類，記為B

4、;紅廣、溫州蜜柑、椏柑、紅橘、本地早、金柑各為一類，分別記為C、D、E、F、G、H，親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。在遺傳相似系數(shù)為0.70時(shí)，A類可以分為2個(gè)亞類:a亞類為小果系楊小26、SS-1、SS-2、SS-7、SS-9、SS-12、SS-14、SS-28、LX-10、LX-17、LX-21、ST-3、QB-5、QB-8、QW-3、97-1，桂花蒂，早熟系LS-1;b亞類為小果系97-2，早熟系97-1、大果系LS-1、大果系97-1和蜜廣。各南