豬分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的建立及其初步應(yīng)用.pdf

1、該研究的主要內(nèi)容及結(jié)果如下:⒈建立了專門化的豬分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫.序列數(shù)據(jù)庫中以EST數(shù)據(jù)庫和HTGS數(shù)據(jù)庫為主.其中,豬的EST數(shù)據(jù)庫中的記錄量超過了10萬.⒉建立了核酸序列電子自動延伸系統(tǒng).對于豬cDNA序列可以進(jìn)行有效、迅速的延伸.對于給定的psme1和psme2兩條驗(yàn)證序列,該系統(tǒng)都進(jìn)行了有效的延伸,得到了與RACE一致的延伸結(jié)果.⒊建立了基于Web的本地化BLAST同源比對程序.檢索方式、參數(shù)選擇、結(jié)果格式均與NCBI類似,便于

2、進(jìn)行交流.檢索用數(shù)據(jù)庫均由該研究建立.⒋建立了中國地方品種資源數(shù)據(jù)庫.包括豬、馬、牛、羊、禽在內(nèi)的200多個(gè)中國地方品種被收入了數(shù)據(jù)庫,涉及到地方品種的外貌、類型、典型特征等多個(gè)性狀,為從事中國地方品種遺傳資源的利用與保護(hù)提供了參考.⒌建立了以人為主的參照數(shù)據(jù)庫.人基因注釋數(shù)據(jù)庫和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息數(shù)據(jù)庫是進(jìn)行比較生物學(xué)研究不可缺少的部分,同時(shí),蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息數(shù)據(jù)庫將為豬基因的深入研究提供重要參考信息.⒍建立了豬生物信息學(xué)研究平臺.可以對基