福建地方鴨品種微衛(wèi)星位點(diǎn)的篩選和多態(tài)性分析.pdf

1、微衛(wèi)星標(biāo)記屬于共顯性的遺傳標(biāo)記，具有高度的多態(tài)性，是中性遺傳的，所以在目前被認(rèn)為是最好的用于群體基因研究的孟德爾分子標(biāo)記。本文利用微衛(wèi)星標(biāo)記，旨在通過構(gòu)建鴨微衛(wèi)星富集文庫克隆一些微衛(wèi)星DNA序列，利用克隆的序列設(shè)計(jì)引物，并通過PCR擴(kuò)增及其擴(kuò)增片段大小的分析，來檢測5個(gè)福建地方鴨品種的基因型，分析了等位基因頻率、多態(tài)信息含量、雜合度、有效等位基因數(shù)、遺傳距離和聚類結(jié)果，并探討了各品種內(nèi)的遺傳變異和品種間的遺傳關(guān)系。 本研究應(yīng)用磁

2、珠富集法構(gòu)建了(GA)n、(CT)n、(CA)n、(TG)n重復(fù)類型的鴨混合型微衛(wèi)星富集文庫。挑選46個(gè)陽性克隆測序獲得到14含有微衛(wèi)星的DNA序列，并設(shè)計(jì)14對微衛(wèi)星引物遞交到了GenBank(GenBank登錄號：FJ599499-FJ599512)。通過PCR優(yōu)化從中獲得5個(gè)具有中度或高度多態(tài)性的基因座，然后用這5個(gè)基因座對5個(gè)福建地方鴨品種作遺傳多樣性分析。 群體遺傳結(jié)構(gòu)的微衛(wèi)星分析表明：①5個(gè)鴨品種在5個(gè)微衛(wèi)星基因座中

3、共檢測到31個(gè)等位基因，平均每個(gè)基因座有6.2個(gè)等位基因。②5個(gè)微衛(wèi)星基因座在5個(gè)鴨品種中的平均多態(tài)信息含量為0.5133，其中微衛(wèi)星FJAU011的多態(tài)信息含量最高(0.5860)。各位點(diǎn)的有效等位基因數(shù)在2.1652-3.9904之間。5個(gè)鴨品種的平均雜合度為0.7480，5個(gè)群體的基因雜合度變化范圍在0.5115-0.7000之間。③哈代-溫伯平衡檢驗(yàn)結(jié)果表明，只有少數(shù)品種的少數(shù)位點(diǎn)處于平衡狀態(tài)，大多數(shù)位點(diǎn)都處于不平衡狀態(tài)。④F-