graphpad-prism-6.0的基礎應用

1、張妮妮2016-5-31 19:00圖書館二樓多媒體培訓教室,醫(yī)學繪圖與分析軟件,GraphPad Prism 6.05基礎應用,GraphPad Prism是一款集數據分析和作圖為一體的數據處理軟件，尤其適合生物醫(yī)學類，可以直接輸入原始數據獲得高質量的科學圖表。它在統(tǒng)計分析上劣于SPSS 等統(tǒng)計軟件。不需要輸入程序語言，只需輸入原始數據。容易操作，繪圖美觀?？膳cppt，word相鏈接。Graphpad與origin的比

2、較,簡介,大綱,統(tǒng)計圖基本知識GraphPad Prism6繪圖界面案例分析統(tǒng)計圖的排版與導出,統(tǒng)計圖的基本知識,統(tǒng)計圖基本要素常見統(tǒng)計方法的圖形表達,統(tǒng)計圖的基本要素,1.標題：一般位于圖的正下方，簡明扼要說明主要內容2.X軸：有兩種 分類軸：表示兩種不同的類別 數據軸：表示一個數值概念3.Y軸：一般為數值軸4.圖形區(qū)：二維平面內點、線、條表達數據,From www.drheart.cn,常見統(tǒng)計方法的圖形表達

3、,1.獨立樣本t檢驗2.配對t檢驗,3.完全隨機設計資料的方差分析4.析因設計資料的方差分析5.重復測量資料的方差分析,6.兩組獨立樣本的秩和檢驗7.多組獨立樣本的秩和檢驗,GraphPad Prism6繪圖界面,一、歡迎界面二、軟件主界面三、目錄樹四、快捷菜單欄五、圖像模塊詳解六、坐標軸調整七、圖形設定界面,歡迎界面,歡迎界面要對統(tǒng)計方法進行選擇特定的統(tǒng)計方法→對應的數據錄入格式和圖

4、像類型,設定統(tǒng)計類別、圖像類型和數據輸入格式后，進入軟件主界面,1.統(tǒng)計類型,2.數據輸入格式,3.示例數據，也是統(tǒng)計方法的提示,,,二、軟件主界面,,,,,三、目錄樹,數據集；點擊，進入數據錄入窗口，在歡迎界面選擇不同的統(tǒng)計類型，數據集的表格會有所不同,圖形；當完成數據錄入，點擊該圖標，則自動生成圖像,布局,文檔操作模塊，如打開、新建、保存、前進、后退、復制和粘貼。該模塊與office軟件操作一致。,分析模塊。,圖形模塊，將對圖形類

5、型、坐標軸和圖形本身進行分析，將重點解釋。,文字修飾模塊，可以繪制線條、添加文字，并對文字進行調整。,圖形輸出模塊，包括圖形導出，打印和一鍵輸入至word，ppt中。,四、快捷菜單欄,,,五、圖形模塊詳解,相當于統(tǒng)計方法和圖形類型選擇項，可以對統(tǒng)計方法重新選擇，但一般只對圖形類型進行選擇。,對坐標軸進行具體設定，包括原點、X軸和Y軸。,對圖形進行具體調整。,圖表的配色方案，默認為黑白圖表。,六、坐標軸調整,1.坐標框與原點,（1）Ori

6、gin原點的設定,（2）繪圖區(qū)的形狀、大小和位置進行設定，一般不需要設定。,繪圖區(qū)的顏色,背景顏色,（3）坐標軸的顏色,（4）對圖形框和網格線進行設定,X axis(X軸),Gaps and Direction：只有XY圖形，才能進行設定,X軸是否分段和方向,一般為線性，濃度選擇logo刻度,對刻度圖示進行調整,添加輔助線，還可對兩條輔助線內區(qū)域進行填色,3. Left Y axis(左Y軸),4. Right Y axis(右Y

7、軸),軟件默認無右Y軸,與X軸設定方法類似,Note：添加右Y后，所有圖像仍跟隨左Y,如果某些數據需要按照右Y,需要在Format Graph對話框中實現(xiàn)。,5. Titles & Fonts(標題和字體),七、圖像設定界面,Data Set,Style:樣式，不同的圖形,Additional options,可以選擇數據集是否依據左Y還是右Y進行顯示，如果出現(xiàn)第二Y軸，此處應進行設定。,,,案例分析,配對t檢驗,適用情況（

8、4種）：配對的兩組受試對象分別接受兩種處理同一受試對象處理前后的比較同一受試對象兩個不同部位的比較同一樣品用兩種方法（儀器等）檢索結果的比較,*,實例1,抽取15名某大學的學生進行了為期3個月的發(fā)展腿部爆發(fā)力的訓練，運用實驗的方法在訓練前后分別測試了每一人的立定跳遠成績。統(tǒng)計15名學生訓練前后的數據。,該實例的圖像表達,應該采用單一研究對象前后值連線的方式表達與獨立t檢驗區(qū)別開來若數據太多，則不適合用圖形表達,圖形繪制,S

9、tep 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數據集,進入主界面,圖形繪制,圖形繪制,Step 2：數據錄入1.在data窗口，錄入數據2.點擊左側目錄樹中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,初始圖形,Step 3：坐標軸和圖形調整1. 點擊快捷菜單欄change模塊中 彈出坐標軸對話框2.選擇左Y軸，對Y軸進行調整,,,,

10、,,,修改前后對比,3.選擇標題和字體，對其進行調整,,,Note：不論中文還是英文，一旦亂碼，就要對“字體”進行調整。,4.選擇X軸，對X軸進行調整,5.對圖形的Symbols（符號）進行修改,,,,圖形繪制,Step 4：文字修飾1. 不需要的文字點擊刪除即可2.可通過Write插入文字3.在Text菜單欄對字體進行調整,分析數據,圖形繪制,最后圖形如下：,*,成組t檢驗,實例2,該實例的圖形表達,1.散點圖（圖1）：清晰描述

11、各點數據，易發(fā)現(xiàn)離群點，橫線為均值，適合數據較少時。2.誤差圖（圖2）：箱頂為均數，觸須線表示SD，也可表示SE,適合數據較多時。3.誤差圖（圖3）：點表示均數，直線表示兩側SD。,圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數據集,圖形繪制,Step 2：數據錄入1.在data窗口，錄入數據2.點擊左側目錄樹中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,圖形繪制

12、,圖形繪制,添加P值的bar,,圖形繪制,最后圖形如下：,實例3,為了探討雌激素預防骨質疏松癥的作用，研究者將30只10月齡SD雌性大鼠隨機等分到假手術組（組1）、卵巢切除組（組2）和卵巢切除后補充17β-雌二醇組（組3），12周后處死大鼠，取其股骨，測量股骨重量。,定量資料----統(tǒng)計方法選擇,定量資料正態(tài)：均值的比較 兩組：t檢驗 多組：方差分析非正態(tài)：中位數的比較 兩組：非參（Mean-Whitney

13、 U檢驗） 多組：非參（Cruskal-Wallis H檢驗）,圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗…2.新建數據集3.選擇圖形類型 ---垂直柱狀圖,圖形繪制,圖形繪制,,,最終的圖形,實例4,某醫(yī)生將病人隨機分為兩組，分別以新療法和傳統(tǒng)療法治療。比較兩種療法的退熱時間有無差別。,兩組獨立樣本資料比較的秩和檢驗,兩組獨立樣本資料比較的檢

14、驗方法 --- 滿足正態(tài)分布和方差齊性 -----可用t檢驗或完全隨機設計的方差分析--- 不滿足正態(tài)分布或方差齊性 -----可采用Wilcoxn秩和檢驗（rank sum test） -----推斷兩獨立樣本分別代表總體分布位置是否不同。,二、圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.Column → 適合t檢驗、A

15、NOVA、秩和檢驗…,圖形繪制,Step 2：數據錄入1.在data窗口，錄入數據2.點擊左側目錄樹中的Graphs—Data4，自動生成圖形。3. 選擇Median，用橫線表示中位數。,圖形區(qū)：均值與中位數的修改,,最終的圖形,實例5—折線圖,研究進食量與體重增加的關系,二、圖形繪制,Step 1：圖形類型選擇1.XY → 線性回歸，非線性回歸，相關分析2.新建數據集3.選擇圖形類型 ---散點圖,

16、,,兩變量的關聯(lián)性分析,二、圖形繪制,圖形繪制---添加擬合直線,,圖形繪制---坐標軸和圖形調整,,,圖形繪制---坐標軸和圖形調整,,,統(tǒng)計分析--自動生成,,,Y=0.06479X＋1.997,R2＝0.899,,最后的圖形,統(tǒng)計圖的排版與導出,統(tǒng)計圖的排版與導出,,統(tǒng)計圖的排版與導出,,,,統(tǒng)計圖的排版與導出--投稿圖片,,,,,,導出后的圖片,統(tǒng)計圖的排版與導出—ppt、word,,雙擊圖片，返回到GraphPad程序,致謝,