graphpad-prism-6.0的基礎(chǔ)應(yīng)用

1、張妮妮2016-5-31 19:00圖書(shū)館二樓多媒體培訓(xùn)教室,醫(yī)學(xué)繪圖與分析軟件,GraphPad Prism 6.05基礎(chǔ)應(yīng)用,GraphPad Prism是一款集數(shù)據(jù)分析和作圖為一體的數(shù)據(jù)處理軟件，尤其適合生物醫(yī)學(xué)類(lèi)，可以直接輸入原始數(shù)據(jù)獲得高質(zhì)量的科學(xué)圖表。它在統(tǒng)計(jì)分析上劣于SPSS 等統(tǒng)計(jì)軟件。不需要輸入程序語(yǔ)言，只需輸入原始數(shù)據(jù)。容易操作，繪圖美觀。可與ppt，word相鏈接。Graphpad與origin的比

2、較,簡(jiǎn)介,大綱,統(tǒng)計(jì)圖基本知識(shí)GraphPad Prism6繪圖界面案例分析統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出,統(tǒng)計(jì)圖的基本知識(shí),統(tǒng)計(jì)圖基本要素常見(jiàn)統(tǒng)計(jì)方法的圖形表達(dá),統(tǒng)計(jì)圖的基本要素,1.標(biāo)題：一般位于圖的正下方，簡(jiǎn)明扼要說(shuō)明主要內(nèi)容2.X軸：有兩種 分類(lèi)軸：表示兩種不同的類(lèi)別 數(shù)據(jù)軸：表示一個(gè)數(shù)值概念3.Y軸：一般為數(shù)值軸4.圖形區(qū)：二維平面內(nèi)點(diǎn)、線(xiàn)、條表達(dá)數(shù)據(jù),From www.drheart.cn,常見(jiàn)統(tǒng)計(jì)方法的圖形表達(dá)

3、,1.獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)2.配對(duì)t檢驗(yàn),3.完全隨機(jī)設(shè)計(jì)資料的方差分析4.析因設(shè)計(jì)資料的方差分析5.重復(fù)測(cè)量資料的方差分析,6.兩組獨(dú)立樣本的秩和檢驗(yàn)7.多組獨(dú)立樣本的秩和檢驗(yàn),GraphPad Prism6繪圖界面,一、歡迎界面二、軟件主界面三、目錄樹(shù)四、快捷菜單欄五、圖像模塊詳解六、坐標(biāo)軸調(diào)整七、圖形設(shè)定界面,歡迎界面,歡迎界面要對(duì)統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行選擇特定的統(tǒng)計(jì)方法→對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)錄入格式和圖

4、像類(lèi)型,設(shè)定統(tǒng)計(jì)類(lèi)別、圖像類(lèi)型和數(shù)據(jù)輸入格式后，進(jìn)入軟件主界面,1.統(tǒng)計(jì)類(lèi)型,2.數(shù)據(jù)輸入格式,3.示例數(shù)據(jù)，也是統(tǒng)計(jì)方法的提示,,,二、軟件主界面,,,,,三、目錄樹(shù),數(shù)據(jù)集；點(diǎn)擊，進(jìn)入數(shù)據(jù)錄入窗口，在歡迎界面選擇不同的統(tǒng)計(jì)類(lèi)型，數(shù)據(jù)集的表格會(huì)有所不同,圖形；當(dāng)完成數(shù)據(jù)錄入，點(diǎn)擊該圖標(biāo)，則自動(dòng)生成圖像,布局,文檔操作模塊，如打開(kāi)、新建、保存、前進(jìn)、后退、復(fù)制和粘貼。該模塊與office軟件操作一致。,分析模塊。,圖形模塊，將對(duì)圖形類(lèi)

5、型、坐標(biāo)軸和圖形本身進(jìn)行分析，將重點(diǎn)解釋。,文字修飾模塊，可以繪制線(xiàn)條、添加文字，并對(duì)文字進(jìn)行調(diào)整。,圖形輸出模塊，包括圖形導(dǎo)出，打印和一鍵輸入至word，ppt中。,四、快捷菜單欄,,,五、圖形模塊詳解,相當(dāng)于統(tǒng)計(jì)方法和圖形類(lèi)型選擇項(xiàng)，可以對(duì)統(tǒng)計(jì)方法重新選擇，但一般只對(duì)圖形類(lèi)型進(jìn)行選擇。,對(duì)坐標(biāo)軸進(jìn)行具體設(shè)定，包括原點(diǎn)、X軸和Y軸。,對(duì)圖形進(jìn)行具體調(diào)整。,圖表的配色方案，默認(rèn)為黑白圖表。,六、坐標(biāo)軸調(diào)整,1.坐標(biāo)框與原點(diǎn),（1）Ori

6、gin原點(diǎn)的設(shè)定,（2）繪圖區(qū)的形狀、大小和位置進(jìn)行設(shè)定，一般不需要設(shè)定。,繪圖區(qū)的顏色,背景顏色,（3）坐標(biāo)軸的顏色,（4）對(duì)圖形框和網(wǎng)格線(xiàn)進(jìn)行設(shè)定,X axis(X軸),Gaps and Direction：只有XY圖形，才能進(jìn)行設(shè)定,X軸是否分段和方向,一般為線(xiàn)性，濃度選擇logo刻度,對(duì)刻度圖示進(jìn)行調(diào)整,添加輔助線(xiàn)，還可對(duì)兩條輔助線(xiàn)內(nèi)區(qū)域進(jìn)行填色,3. Left Y axis(左Y軸),4. Right Y axis(右Y

7、軸),軟件默認(rèn)無(wú)右Y軸,與X軸設(shè)定方法類(lèi)似,Note：添加右Y后，所有圖像仍跟隨左Y,如果某些數(shù)據(jù)需要按照右Y,需要在Format Graph對(duì)話(huà)框中實(shí)現(xiàn)。,5. Titles & Fonts(標(biāo)題和字體),七、圖像設(shè)定界面,Data Set,Style:樣式，不同的圖形,Additional options,可以選擇數(shù)據(jù)集是否依據(jù)左Y還是右Y進(jìn)行顯示，如果出現(xiàn)第二Y軸，此處應(yīng)進(jìn)行設(shè)定。,,,案例分析,配對(duì)t檢驗(yàn),適用情況（

8、4種）：配對(duì)的兩組受試對(duì)象分別接受兩種處理同一受試對(duì)象處理前后的比較同一受試對(duì)象兩個(gè)不同部位的比較同一樣品用兩種方法（儀器等）檢索結(jié)果的比較,*,實(shí)例1,抽取15名某大學(xué)的學(xué)生進(jìn)行了為期3個(gè)月的發(fā)展腿部爆發(fā)力的訓(xùn)練，運(yùn)用實(shí)驗(yàn)的方法在訓(xùn)練前后分別測(cè)試了每一人的立定跳遠(yuǎn)成績(jī)。統(tǒng)計(jì)15名學(xué)生訓(xùn)練前后的數(shù)據(jù)。,該實(shí)例的圖像表達(dá),應(yīng)該采用單一研究對(duì)象前后值連線(xiàn)的方式表達(dá)與獨(dú)立t檢驗(yàn)區(qū)別開(kāi)來(lái)若數(shù)據(jù)太多，則不適合用圖形表達(dá),圖形繪制,S

9、tep 1：圖形類(lèi)型選擇1.Column → 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn)…2.新建數(shù)據(jù)集,進(jìn)入主界面,圖形繪制,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹(shù)中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,初始圖形,Step 3：坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整1. 點(diǎn)擊快捷菜單欄change模塊中 彈出坐標(biāo)軸對(duì)話(huà)框2.選擇左Y軸，對(duì)Y軸進(jìn)行調(diào)整,,,,

10、,,,修改前后對(duì)比,3.選擇標(biāo)題和字體，對(duì)其進(jìn)行調(diào)整,,,Note：不論中文還是英文，一旦亂碼，就要對(duì)“字體”進(jìn)行調(diào)整。,4.選擇X軸，對(duì)X軸進(jìn)行調(diào)整,5.對(duì)圖形的Symbols（符號(hào)）進(jìn)行修改,,,,圖形繪制,Step 4：文字修飾1. 不需要的文字點(diǎn)擊刪除即可2.可通過(guò)Write插入文字3.在Text菜單欄對(duì)字體進(jìn)行調(diào)整,分析數(shù)據(jù),圖形繪制,最后圖形如下：,*,成組t檢驗(yàn),實(shí)例2,該實(shí)例的圖形表達(dá),1.散點(diǎn)圖（圖1）：清晰描述

11、各點(diǎn)數(shù)據(jù)，易發(fā)現(xiàn)離群點(diǎn)，橫線(xiàn)為均值，適合數(shù)據(jù)較少時(shí)。2.誤差圖（圖2）：箱頂為均數(shù)，觸須線(xiàn)表示SD，也可表示SE,適合數(shù)據(jù)較多時(shí)。3.誤差圖（圖3）：點(diǎn)表示均數(shù)，直線(xiàn)表示兩側(cè)SD。,圖形繪制,Step 1：圖形類(lèi)型選擇1.Column → 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn)…2.新建數(shù)據(jù)集,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹(shù)中的Graphs。3.選擇圖形。4.圖形生成。,圖形繪制

12、,圖形繪制,添加P值的bar,,圖形繪制,最后圖形如下：,實(shí)例3,為了探討雌激素預(yù)防骨質(zhì)疏松癥的作用，研究者將30只10月齡SD雌性大鼠隨機(jī)等分到假手術(shù)組（組1）、卵巢切除組（組2）和卵巢切除后補(bǔ)充17β-雌二醇組（組3），12周后處死大鼠，取其股骨，測(cè)量股骨重量。,定量資料----統(tǒng)計(jì)方法選擇,定量資料正態(tài)：均值的比較 兩組：t檢驗(yàn) 多組：方差分析非正態(tài)：中位數(shù)的比較 兩組：非參（Mean-Whitney

13、 U檢驗(yàn)） 多組：非參（Cruskal-Wallis H檢驗(yàn)）,圖形繪制,Step 1：圖形類(lèi)型選擇1.Column → 適合t檢驗(yàn)、ANOVA、秩和檢驗(yàn)…2.新建數(shù)據(jù)集3.選擇圖形類(lèi)型 ---垂直柱狀圖,圖形繪制,圖形繪制,,,最終的圖形,實(shí)例4,某醫(yī)生將病人隨機(jī)分為兩組，分別以新療法和傳統(tǒng)療法治療。比較兩種療法的退熱時(shí)間有無(wú)差別。,兩組獨(dú)立樣本資料比較的秩和檢驗(yàn),兩組獨(dú)立樣本資料比較的檢

14、驗(yàn)方法 --- 滿(mǎn)足正態(tài)分布和方差齊性 -----可用t檢驗(yàn)或完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的方差分析--- 不滿(mǎn)足正態(tài)分布或方差齊性 -----可采用Wilcoxn秩和檢驗(yàn)（rank sum test） -----推斷兩獨(dú)立樣本分別代表總體分布位置是否不同。,二、圖形繪制,Step 1：圖形類(lèi)型選擇1.Column → 適合t檢驗(yàn)、A

15、NOVA、秩和檢驗(yàn)…,圖形繪制,Step 2：數(shù)據(jù)錄入1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù)2.點(diǎn)擊左側(cè)目錄樹(shù)中的Graphs—Data4，自動(dòng)生成圖形。3. 選擇Median，用橫線(xiàn)表示中位數(shù)。,圖形區(qū)：均值與中位數(shù)的修改,,最終的圖形,實(shí)例5—折線(xiàn)圖,研究進(jìn)食量與體重增加的關(guān)系,二、圖形繪制,Step 1：圖形類(lèi)型選擇1.XY → 線(xiàn)性回歸，非線(xiàn)性回歸，相關(guān)分析2.新建數(shù)據(jù)集3.選擇圖形類(lèi)型 ---散點(diǎn)圖,

16、,,兩變量的關(guān)聯(lián)性分析,二、圖形繪制,圖形繪制---添加擬合直線(xiàn),,圖形繪制---坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整,,,圖形繪制---坐標(biāo)軸和圖形調(diào)整,,,統(tǒng)計(jì)分析--自動(dòng)生成,,,Y=0.06479X＋1.997,R2＝0.899,,最后的圖形,統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出,統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出,,統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出,,,,統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出--投稿圖片,,,,,,導(dǎo)出后的圖片,統(tǒng)計(jì)圖的排版與導(dǎo)出—ppt、word,,雙擊圖片，返回到GraphPad程序,致謝,