基于多種dna序列和cpssr的梨屬(pyrusl.)植物分子系統(tǒng)關(guān)系研究

1、浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院博士學(xué)位論文基于多種DNA序列和cpSSR的梨屬（Pyrus L.）植物分子系統(tǒng)關(guān)系研究姓名：鄭小艷申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：果樹學(xué)指導(dǎo)教師：滕元文20080701浙江大學(xué)博士學(xué)位論文( 2 0 0 8 ) 摘要能序列和I T S 假基因序列的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)中，西方梨都為單源，與東方梨顯著分開，支持東西方梨為獨(dú)立分化的觀點(diǎn)．2 梨屬植物A d h 基因中存在長(zhǎng)度各異的6 個(gè)內(nèi)含子區(qū)，我們僅對(duì)包括內(nèi)含子l 和內(nèi)含子2 區(qū)

2、的5 ’端6 5 0 b p 長(zhǎng)的序列進(jìn)行了分析．經(jīng)大量克隆測(cè)序發(fā)現(xiàn)，梨屬植物中至少存在4 種主要的A d h 位點(diǎn)：A d f i l ，A d h 2 、A d h 3 及A d h 4 和一種可疑的A d h 5 ．A d h 內(nèi)含子1 區(qū)長(zhǎng)度變異較大，各A d h 位點(diǎn)在此區(qū)分別共享了其特有的長(zhǎng)度變異．不同A d h 位點(diǎn)間的序列分化度較高，為8 ％．2 0 ％，而各位點(diǎn)內(nèi)的序列分化度也較低( Q ％) ．在大多數(shù)樣本個(gè)體內(nèi)，每

3、個(gè)不同A d h 位點(diǎn)都存在序列多態(tài)性，即存在多個(gè)同類A d h 拷貝。其中屬于A d h l 、A d h 2 和A d h 3 的差異拷貝大多為單源；而來(lái)自A d h 4 ( 拷貝數(shù)最多) 的個(gè)體內(nèi)差異拷貝大多數(shù)為多源，因此導(dǎo)出的系統(tǒng)樹結(jié)構(gòu)與功能I T S 序列相似，關(guān)系復(fù)雜，可能存在譜系篩選及基源拷貝未鑒定準(zhǔn)確的原因。四個(gè)位點(diǎn)中A d h 2 因起源較晚，拷貝數(shù)較單純，顯示了較好的應(yīng)用價(jià)值。從系統(tǒng)樹結(jié)構(gòu)和支持率看，低拷貝核基因初步

4、顯示了比功能性I T S 序列更好的系統(tǒng)學(xué)潛力3 兩個(gè)葉綠體非編碼區(qū)，t r n L 內(nèi)含子及t r n L ．F ，在梨屬植物中高度保守，未能預(yù)期解決梨屬內(nèi)系統(tǒng)關(guān)系．從系統(tǒng)樹結(jié)構(gòu)看，東西方梨兩大組再次顯著分開，而西方梨樣本僅存在一種t r n L - F 序列的長(zhǎng)度類型，多樣性簡(jiǎn)單且與蘋果屬關(guān)系更近．而東方梨存在三種序列長(zhǎng)度類型，多樣性較豐富．這兩個(gè)葉綠體非編碼區(qū)的長(zhǎng)度突變和核苷酸突變?yōu)橐恍╇s種的母系提供了依據(jù)，如‘庫(kù)爾勒香梨’的母本

5、非西洋梨；褐梨、河北梨及部分秋子梨問(wèn)關(guān)系密切；中國(guó)白梨品種并非起源于尸b r e t e s c h n e i d e r i l ( 罐梨) ，兩者不存在直接聯(lián)系．在東方梨中秋子梨顯示了最豐富的多樣性．4 應(yīng)用1 2 對(duì)c p S S R 引物對(duì)供試?yán)鏄颖具M(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)僅4 對(duì)引物的P C R 產(chǎn)物在梨屬中存在多態(tài)性。最后共獲得1 4 個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，基于這些位點(diǎn)構(gòu)建的U P G M A 系統(tǒng)樹結(jié)構(gòu)與兩種葉綠體非編碼區(qū)序列的系統(tǒng)結(jié)果基本相