AdaBoost在基因表達(dá)數(shù)據(jù)分類中的應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、基因表達(dá)數(shù)據(jù)和腫瘤的關(guān)系已經(jīng)被廣泛地研究,無監(jiān)督學(xué)習(xí)方法如聚類算法一般被用在功能基因組學(xué),但是監(jiān)督學(xué)習(xí)方法能夠直接作用于有分類屬性的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。基因微陣列分析和分類已經(jīng)變成診斷腫瘤和癌癥的有效方式。但是早先的研究表明,在基因分類和癌癥診斷上,基礎(chǔ)的簡單分類模型有自己的缺點(diǎn),同時(shí)在數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域,分類器的集成技術(shù)受到了人們越來越多的關(guān)注。
  在本文中主要選用AdaBoost算法創(chuàng)建分類器,來處理基因分類問題,這一算法是原始的Boo

2、sting思想的一個(gè)擴(kuò)展實(shí)現(xiàn)。為了選擇合理的最有分類信息的基因子集,采用了BeliefF,F(xiàn)CBF,PCA等三種特征選擇算法。也應(yīng)用了其他分類算法包括決策樹,支持向量機(jī)和Bagging以評估AdaBoost算法的效果。為了更好地分析迭代次數(shù)對結(jié)果的影響,通過解析WEKA中該算法的toString方法得到了算法的實(shí)際迭代次數(shù)。在兩個(gè)真實(shí)基因表達(dá)數(shù)據(jù)集上采取10折交叉驗(yàn)證的方式進(jìn)行試驗(yàn)。
  通過調(diào)整特征選擇算法、選取不同的特征個(gè)數(shù)、

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