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簡介:分類號UDC密級編號中南大學L737728CENTRALSOUTHUNIVERSITY碩士學位論文論文題目學科專業(yè)研究生姓名導師姓名及其專業(yè)技術職稱中南大學2010年5月表一復一一簍一分類號VDC碩士學位論文密級/YLLL/LLL/1LLLLLL7/L/LLLL2LLLLLLLLLUL3LLLLL/5/LLLTL5/LLLY1721355人皮膚成纖維細胞衰老過程中表觀遺傳學相關基因表達的初步研究PRELIMINARYSTUDYOFEPIGENETICSGENEEXPRESSIONSOFHUMANSKINFIBROBLASTSDURINGAGING作者姓名學科專業(yè)學院系、所指導教師李斌皮膚病與性病學湘雅醫(yī)院謝紅付教授答辯委員會主中南大學2010年5月
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簡介:932678J交弓I1’南京醫(yī)科大學崮熟學位論文星性煎麴照自魚痘墨變塑監(jiān)危蓬塞型丑塑照董佳堂盟窺逝指導教師圭建耍圭堡垂蚯型墊擯壹童基盤筮生蔓二型復堡監(jiān)生莖生冬&匿墮壘遮丑一一一一申請學位級制一亟一一專業(yè)名稱壘盤由£蘭一論文提交目期2魚。魚生臼論文答辯日期上。雌王且一學恬授了,臼期一一地生2旦一答辯委員會主霄評閱人一2006年5月15日南京醫(yī)科大學碩士學位論文AⅣ【LPO05。除標準T9;22Q34;Q“易位外MFISH共檢出56種結構異常,其中5種平衡易位、51種不平衡易位,不平衡易位包括了2種插入、6種缺失及43種易位及衍生染色體;另外還檢出23種數目異常。22例CMLBC中所有染色體均涉及異常,除標準T9;22易位外異常最多涉及的染色體是9號409%9/22、8號364%8/22、17號364%8/22、22號364%8/22。1例M。FISH未檢出CCAS核型的克隆,4例標本檢出了傳統(tǒng)細胞遺傳學CC未發(fā)現的異常核型的克隆。MFISH明確了14種CC未確定的異常、糾正了4種CC識別錯誤的異常,還發(fā)現了CC未檢出的26種染色體易位,其中DER9T1;9;1、DER9T16;6;9;22、IDER9Q10T8;9、DER18T16;18;19為既往文獻未見報道的易位。結論1CMLBC免疫表型復雜、多系表達常見。CMLBC中干/祖細胞階
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簡介:華中科技大學博士學位論文眼科遺傳疾病的分子遺傳學分析姓名柯鐵申請學位級別博士專業(yè)生物化學與分子生物學指導教師王擎劉木根20060714II(4)我們對一個LHON家系進行臨床分析,發(fā)現家系內患者整體預后良好,實屬罕見;對家系成員進行了線粒體DNA的3個原發(fā)突變位點檢測,發(fā)現病人攜帶MTG11778A位點突變,而且多名病人和突變攜帶者呈現出異質性突變;對相關繼發(fā)突變位點的檢測沒有發(fā)現次級突變的存在。該結果表明可能存在其它因子對該家系的表型起調節(jié)作用。所有這些分子遺傳學研究為闡明先天性白內障和視神經疾病的病理學,以及提供更好的遺傳咨詢和最終發(fā)展有效疾病治療策略提供了有益的幫助。關鍵詞先天性白內障常染色體視神經萎縮LEBER’S視神經萎縮基因突變HSF4CRYABOPA1
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簡介:自1992年首次被報道后,BRUGADA綜合征已得到醫(yī)學界的普遍認同,根據2002年及2003年兩次歐洲心律失常工作組會議達成的共識,BRUGADA綜合征被定義為一種“疾病”。本病屬常染色體顯性遺傳病,好發(fā)于東南亞、日本等國家地區(qū),而在美國、北歐發(fā)病率相對較低,臨床特征主要包括多以心因性猝死或頻發(fā)暈厥為首發(fā)癥狀,發(fā)病時心電圖記錄到極短配對間期室性期前收縮、多形性室性心動過速、心室顫動,但常規(guī)的臨床檢查,包括體格檢查,影像學、超聲學、冠狀動脈造影等均無心臟器質性病變的證據;靜息常規(guī)12導聯(lián)心電圖有特征性改變右心前區(qū)V1~V3導聯(lián)J點抬高≥2MM02MV而形成明顯的J波,繼而ST段呈斗篷狀或鞍形抬高,T波可繼發(fā)倒置,QT間期一般正常,這種特征性心電圖表現也被稱作“BRUGADA心電圖征”,并且根據JSTT的不同形態(tài)可區(qū)分為3型1,2,3型;JST可呈動態(tài)變化,3型之間可互相轉變,甚至一過性正常,但在IC類抗心律失常藥物如氟卡尼等的作用下,可被重新暴露或加重;目前尚無普遍認同的有效藥物治療方案,內置式植入除顫轉復器IMPLANTABLECARDIOVERTERDEFIBRILLAT,ICD是唯一能夠預防BRUGADA綜合征猝死發(fā)生的治療措施。BRUGADA綜合征發(fā)病機制的研究近年來在分子遺傳學及電生理領域取得了較大的進展,心臟電壓門控NA通道蛋白Α亞單位NA通道基因SCN5A的遺傳缺陷,被認為是BRUGADA綜合征的基本病因;目前已有近100個SCN5A基因突變被發(fā)現與該病有關,但也有證據表明另有致病基因,此外,已知鉀通道基因HERG的遺傳變異以及一些基因多態(tài)性現象可促使BRUGADA綜合征的發(fā)病或加重病情。關于BRUGADA綜合征發(fā)病的細胞電生理及病理生理機制尚未完全闡明,目前較普遍認同的觀點認為SCN5A突變導致NA通道結構功能缺陷或是NA通道蛋白表達、轉運障礙,功能下降,導致心肌細胞總NA內流減弱,在動作電位1相末,跨細胞膜離子流失衡,動作電位平臺期2相喪失,而不同離子通道在心臟的不均一分布使這種平臺期的消失并不一致,最終在右室流出道RIGHTVENTRICULAROUTFLOWTRACT,RVOT的心內膜與心外膜之間形成跨室壁電壓差,形成右心導聯(lián)J波、ST段抬高的基礎,并在動作電位平臺期2相形成復極的不均一,在RVOT的心肌細胞之間誘發(fā)2相折返性,導致室速、室顫的發(fā)生。因此,類似BRUGADA綜合征、先天性長QT綜合征等這些因為離子通道先天缺陷而導致的原發(fā)性心律失常性疾病,又被稱為“離子通道心肌病”IONCHANNELOPATHIES。關于發(fā)病機制,另一種觀點認為NA內流減弱可導致直接使心肌細胞的傳導功能受損,或者NA通道缺陷通過影響心肌細胞內的離子平衡,繼而影響心肌細胞的代謝,導致心肌細胞出現慢性病理損害而減慢傳導,心臟傳導在RVOT處從心內膜向心外膜的傳導過程減慢,形成跨室壁電壓差,導致心電圖ST段抬高,并構成折返途徑,傳導速度不同的心肌細胞交界處產生異位起搏點并誘發(fā)折返性室性心律失常。近年的研究表明BRUGADA綜合征的臨床表現、病理生理學特征、分子、電生理機制遠比我們所了解的要復雜,尚有諸多問題仍未闡明。在國內,對BRUGADA綜合征的認識正逐漸深入,已經意識到中國人的BRUGADA綜合征發(fā)病率可能并不低,但目前缺乏更多的臨床及流行病學資料,而在分子、細胞電生理方面的研究更是滯后。中國擁有眾多人口與民族,也意味著病人數量會十分龐大,臨床表現及遺傳多樣性會更加復雜,這對于國人BRUGADA綜合征的研究是一項艱巨的工作。在本研究中,我們收集了10例BRUGADA綜合征病人以及9例無癥狀的BRUGADA心電圖征個人以及其家系成員的臨床資料及外周血標本,并進行分子遺傳學的突變檢測,研究中國人BRUGADA綜合征與SCN5A基因的遺傳缺陷是否相關,若發(fā)現基因突變,則進一步進行細胞電生理學的功能表達研究,深入分析BRUGADA綜合征發(fā)病的分子遺傳學,細胞電生理、病理生理學機制以及與臨床特征的關系。
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簡介:中國協(xié)和醫(yī)科大學碩士學位論文兒童急性淋巴細胞白血病細胞遺傳學改變與預后相關性分析姓名張平申請學位級別碩士專業(yè)內科學指導教師竺曉凡20060601中闞協(xié)和醫(yī)科大學中網醫(yī)學科學院碩士研競生畢業(yè)論文核型異常組中,超二倍體23例、亞二倍體13例、假二倍體17例,CR率分別為95%、83%、73%,DFS超過1年的患兒分別為20例、8例、11例,DFS超過3年的患兒分別為4例、1例、3例。3超二倍體預后較好;E2APBXL融合基因陽性,T119Q23P13預后較差;BCR腳L融合基因陽性/T922Q34Q11者預后極差。4檢出3例未見文獻報道的異常核型1例核型為46,XY,T412Q28P13,TDEL6Q239P22Q34,DEL8P22,DEL20Q1110/46,1『5,治療后DFS為24個月,停療后復發(fā)。1例核型為46,XY,T18Q41Q243/46,XY,ADD9P24,DEL12Q211,治療后早期復發(fā),DFS為2個月另1例核型為47,XX,T912PLOQ10,DEL9QLLQ222/46,XX10,現已無事件生存19個月。結論急性淋巴細胞白血病患兒的細胞遺傳學表現與國內外報道的ALL患兒細胞遺傳學表現基本相似,細胞遺傳學表現可有效地用于評估ALL患兒的預后。檢出三種未見文獻報道的核型,其與疾病預后的關系尚需進一步研究。關鍵詞急性淋巴細胞白血病兒童;細胞遺傳學;預后
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簡介:中山大學博士學位論文四種眼球形態(tài)或結構異常及其分子遺傳學研究姓名王攀峰申請學位級別博士專業(yè)眼科學指導教師張清炯20070510中山大學博士學位論文四種眼球形態(tài)或結構異常及其分子遺傳學研究位于進化上高度保守的蘇氨酸變成天門冬氨酸。眼部檢查發(fā)現,小角膜眼伴有球后囊腫,對側眼具有先天性眼組織缺損。眼外檢查發(fā)現先天性蛛網膜囊腫和尿道下裂。對其家系成員的分析發(fā)現,其父攜帶相同突變,并表現出單側的先天性眼組織缺損伴先天性白內障。該突變未在其母及96例正常對照中出現。結論發(fā)現SOX2基因突變及相關眼部異常在兩代家系中存在,臨床表現以先天性眼組織缺損為共有特征,合并球后囊腫和先天性蛛網膜下腔囊腫,這些特點此前未見報道。第2部分常染色體顯性LEBER先天性黑噱與CRX基因突變目的常染色體顯性遺傳LEBER先天性黑朦LCA的分予遺傳學證據不足,目前的證據有一定缺陷。本研究的目的是尋找一個常染色體顯性遺傳LCA家系的致病基因。材料方法收集一個常染色體顯性遺傳LCA三代大家系的臨床資料,抽取靜脈血制備基因組DNA。直接測序分析CR基因。結果家系中全部6名患者具有I臨床典型的LCA特征,呈常染色體顯性遺傳。所有患者攜帶相同的CRX基因雜和突變C458DELCPR0153GINFSX34。單體型分析提示C458DELC突變與LCA共分離。正常家系成員及96例正常對照者中沒有發(fā)現該突變。結論結果提供了確切的證據,表明CRX基因突變可以導致常染色體顯性LCA。結果已發(fā)表GRAEFE’SARCHCLINEXPOPHTHALMOL2007第3部分先天性無虹膜和PAX6基因突變目的研究中國人群先天性無虹膜患者PAX6基因突變特點及其相關表型。材料方法收集11個先天性無虹膜家系的先證者及其家族成員,和96例無親緣關系正常對照,抽取靜脈血制備基因組DNA。直接測序分析PAX6基因。結果在5個先天性無虹膜家系中發(fā)現PAX6基因突變,其中C1411GA,C1843CG,C542CASERL81X和C562CTGINL88X為新突變,C120CACYS40X為已知突變。96例正常對照中未發(fā)現以上5種突變。5個11
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簡介:溫州醫(yī)學院碩士學位論文LEBER遺傳性視神經病變家系的臨床和分子遺傳學研究姓名趙福新申請學位級別碩士專業(yè)遺傳學指導教師管敏鑫瞿佳20070501溫州醫(yī)學院碩士學位論文NC7NDLND2ND3ND4ND4LND5ND6NDNA0XPHOSPCRPHEPRORFLPRNARRNATRNASERSSCPTTERTHRTRNALEUTAMTRNACYSTRNAGLYNONCODINGNUCLEOTIDESNADHDEHYDROGENASESUBUNIT1NADHDEHYDROGENASESUBUNIT2NADHDEHYDROGENASESUBUNIT3NADHDEHYDROGENASESUBUNIT4NADHDEHYDROGENASESUBUNIT4LNADHDEHYDROGENASESUBUNIT5NADHDEHYDROGENASESUBUNIT6NUCLEARDNAOXIDATIVEPHOSPHORYLATIONPOLYMERASECHAINREACTIONPHENYLALANINEPROLINERESTRICTIONFRAGMENTLENGTHPOLYMORPHISMRIBONUCLEICACIDRIBOSOMALRIBONUCLEICACIDTRANSFCRRIBONUCLEICACIDSERINESINGLESTRANDCONFORMATIONALPOLYMORPHISMTHYMINETERMINATORTHREONINETRNALEUCINETRNACYSTEINETRNAGLYCINE位于細胞色素C氧化酶亞單位II和攜帶賴氨酸的TRNA的非編碼區(qū)還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位L還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位2還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位3還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位4還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位4L還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位5還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位6核脫氧核糖核酸氧化磷酸化聚合酶鏈式反應苯丙氨酸脯氨酸限制性片段長度多態(tài)性核糖核酸核蛋白體核糖核酸轉移核糖核酸絲氨酸單鏈構象多態(tài)性分析胸腺嘧啶終止子蘇氨酸攜帶亮氨酸的TRNA攜帶半胱氨酸的TRNA攜帶甘氨酸的TRNATYRTYROSINE酪氨酸VALVALINE纈氨酸翌堡型盟P堡坐塑堂亟壟皇垡
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簡介:北京中醫(yī)藥大學碩士學位論文LEBER遺傳性視神經病變14484位點突變的中醫(yī)體質學研究姓名孫艷紅申請學位級別碩士專業(yè)中西醫(yī)結合臨床指導教師韋企平20070501中文摘要中文摘要LEBER遺傳性視神經病變LHON是一種由線粒體DNA突變引起的母系遺傳的線粒體疾病。因其視力損害嚴重,不僅給患者心理上造成極大的痛苦和障礙,也給家庭和社會帶來沉重的負擔。本課題在中醫(yī)體質理論指導下,從流行病學角度研究LHONL4484點突變的臨床特征和中醫(yī)體質分型,進一步探討LHON發(fā)病與體質類型的相關性,希望從更深層次認識LHON,為進一步研究LHON的預防和治療奠定理論基礎。論文主要包括文獻綜述和臨床觀察兩部分。文獻綜述主要包括LEBER遺傳性視神經病變和LEBER遺傳性視神經病變中醫(yī)基礎理論研究兩部分。在LEBER遺傳性視神經病變中,對LEBER遺傳視神經病變的生化基礎,基因檢測,組織病理學,臨床特征,診斷與鑒別診斷,治療,預后及遺傳咨詢等方面進行了簡要評述。在LEBER遺傳性視神經病變中醫(yī)基礎理論研究中,則對LHON的中醫(yī)學病名、病因病機、辯證分型及中醫(yī)眼科各學說的認識進行簡要回顧。臨床觀察部分日的從流行病學角度研究LHONL4484點突變的臨床特征和中醫(yī)體質分型,進一步探討LHON發(fā)病與體質類型的關系。方法對2003年7月至2006年4月間LO例來自不同家系的14484點突變患者進行追蹤隨訪。收集169例母系親屬的相關臨床和病史資料,繪制家系圖。同時采用中醫(yī)體質調查表,對135例母系家族成員進行體質類型調查。結果LO家系169位母系親屬LHON外顯率為278%47/169。所有患者均為急性或亞急性發(fā)病,雙眼受累。經過平均23581月的隨訪,714%30/42患者視力恢復,女性視力恢復率783%高于男性50%。135例母系親屬接受體質調查,各種體質類型的發(fā)病率由高至低依次為氣郁質5556%、氣虛質40%、濕熱質3333%、陰虛質3182%、瘀血質20%、痰濕質1667%、正常質125%。對九種體質類型發(fā)病率整體比較有統(tǒng)計學差異P005。剔除樣本量小于10的四種體質類型后,其余五種體質類型兩兩比較,正常質一氣郁質的發(fā)病率差異顯著P001,其余體質類型間發(fā)病率無統(tǒng)計學意義。結論LHONL4484位點突變的臨床特征與其他位點突變相似。體質類型與LHON發(fā)病相關。氣郁質對LHON的發(fā)病影響顯著。主題詞LEBER遺傳性視神經病變;14484位點突變;分子生物學;流行病學;中醫(yī)體質
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簡介:第一部分非綜合征性圓錐動脈干畸形中染色體22Q112缺失調查目的調查中國人非綜合征性圓錐動脈干畸形患者染色體22Q112微缺失發(fā)生情況。方法運用熒光原位雜交方法對36名非綜合征性圓錐動脈干畸形患兒血液標本染色體22Q112微缺失進行檢查,其中男性23例、女性13例,年齡274±250歲,病種為法樂氏四聯(lián)征21例、右室雙出口9例、先天性校正性大動脈轉位1例、肺動脈閉鎖合并室間隔缺損1例、完全性大動脈轉位4例。探針為N25N85A3探針。結論染色體22Q112微缺失為部分非綜合征性圓錐動脈干畸形患者的致病原因。第二部分短串聯(lián)重復序列基因分型行22Q112缺失調查的方法學研究目的研究短串聯(lián)重復序列基因分型染色體22Q112微缺失篩查方法的可行性。方法研究對象同第一部分。選取22Q112中D22S1638、D22S1648、D22S941、D22S944、D22S1623、D22S264、D22S311、D22S1709等8個短串聯(lián)重復序列,通過PCR方法對該8個短串聯(lián)重復序列進行基因分型。計算各短串聯(lián)重復序列雜合度和純合度以及按雜合度大小依次引入短串聯(lián)重復序列后不同短串聯(lián)重復序列組合純合狀態(tài)發(fā)生率和與FISH相比染色體22Q112微缺失診斷特異性。結論短串聯(lián)重復序列基因分型可以作為檢測染色體22Q112微缺失的篩查方法,短串聯(lián)重復序列組合純合發(fā)生率小于005作為選擇短串聯(lián)重復序列組合的標準具有較高的診斷特異性。第三部分圓錐動脈干畸形22Q112缺失遺傳嵌合研究目的研究遺傳嵌合現象在非綜合征性圓錐動脈干畸形發(fā)病機制中的作用。方法第一部分研究對象中,除4例完全性大動脈轉位患兒無法取得心肌標本排除在本次研究之外,其余32名患兒納入本次研究,其中男性20例、女性12例,年齡270±208歲。收集患者血液和心肌標本,通過PCR方法對血液和心肌標本染色體22Q112及附近D22S420、D22S427、D22S1638、D22S1648、D22S941、D22S944、D22S1623、D22S264、D22S311、D22S1709、D22S306、D22S425、D22S257、D22S301、D22S1144等15個短串聯(lián)重復序列進行基因分型,比較血液和心肌標本短串聯(lián)重復序列基因型的異同。結論遺傳嵌合現象可能不是非綜合征性圓錐動脈干畸形的發(fā)病機制。第四部分圓錐動脈干畸形候選致病基因TBX1單核苷酸多態(tài)性調查目的掃描無染色體22Q112微缺失圓錐動脈干畸形患者血細胞TBX1基因外顯子,以期發(fā)現突變位點或單核苷酸多態(tài)性位點。方法第一部分中所有33名無染色體22Q112微缺失的患者為本部分研究對象,其中男性21例、女性12例,年齡29391±25157歲,病種為法樂氏四聯(lián)征19例、右室雙出口8例、先天性校正性大動脈轉位1例、肺動脈閉鎖合并室間隔缺損1例、完全性大動脈轉位4例;對照組為66名健康人血樣,其中男性42例、女性24例,年齡258158±50450歲。對患者血細胞TBX1基因外顯子進行測序,對所發(fā)現的突變位點或單核苷酸多態(tài)性位點在患者和健康人中的分布進行比較。結論TBX1外顯子4CDNA549位單核苷酸多態(tài)性與圓錐動脈干畸形的發(fā)生存在關聯(lián)關系。
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簡介:Y1218955分類號泰山匿學院碩士研究生學位論文論文題目腦卒中的遺傳流行病學病例對照研究系醫(yī)院、所泰山醫(yī)學院附屬醫(yī)院研究生姓名柴永宏學科、專業(yè)老年醫(yī)學研究方向神經內科指導教師張敬軍教授入學時間2004年9月論文工作起止時間2005年8月~2007年5月腦卒中的遺傳流行病學病例對照研究碩士研究生柴永宏導師張敬軍教授專業(yè)老年醫(yī)學摘’要目的研究腦卒中發(fā)病過程中的遺傳因素和環(huán)境因素,初步定義腦梗死和腦出血家族,并提出腦卒中一、二級預防的新策略。方法按照第四屆全國腦血管病會議腦卒中診斷標準,收集泰山醫(yī)學院附屬醫(yī)院神經內科260例住院及門診患者,其中腦梗死不包括腦栓塞和腦出血患者各130例,對照組260例,并經CT或MRI證實。使用統(tǒng)一的腦卒中家系調查表對所有研究對象進行調查,內容包括年齡、性別、民族、職業(yè)、生活習慣、過去史、家族史、輔助檢查等;家系調查范圍包括先征者非血緣親屬配偶、一級親屬子女、同胞、父母、二級親屬孫子J孫女、外孫子、外孫女、叔、伯、姑、舅、姨、祖父母、外祖父母,內容包括各自年齡、病史、患病年齡等。采用病例對照研究的方法及遺傳流行病學家系調查的研究方法分析多種因素對腦卒中的影響。結果單因素LOGISTIC回歸分析,發(fā)現與腦梗死發(fā)病相關的危險因素分別是高血壓病史、糖尿病史、吸煙史、飲酒年限、卒中家族史、空腹血糖、LDLC、TC、TG和HDLC,后者為保護性因素,其它為危險因素;與腦出血發(fā)病相關的危險因素分別是高血壓病史、糖尿病史、吸煙史、飲酒史、飲酒年限、卒中家族史、高鹽飲食、高脂飲食、TO和空腹血糖。經多因素LOGISTIC回歸分析,發(fā)現腦梗死組有7個因素引入最終回歸模型,分別是高血壓病史、糖尿病病史、卒中家族史、LDLC、TC、TG、玎LC;腦出血組有3個因素引入最終回歸模型,分別是高血壓病史、糖尿病病史、卒中家族史。一、二級親屬患病率腦梗死先證者親屬腦梗死患病率為577%,與對照組的240%相比,差異有統(tǒng)計學意義F30914,P0OOO,病例先證者一、二級親屬和對照組親屬的腦梗死患病率分別為669%、428%和177%、337%;腦出血先征者親屬腦出血患病率為386%,與對照組的155%相比,差異有統(tǒng)計學意義0720785,PQOOO,病例先證者一、二級親屬和對照組親屬的腦出血患病率分別為521%、175/0和161%、146%。腦梗死病例組配偶腦梗死患病率為462“/5/130,
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簡介:類風濕關節(jié)炎(RHEUMATOIDARTHRITISRA)和強直性脊柱炎(ANKYLOSINGSPONDYLITISAS)是我國最常見的炎性關節(jié)炎疾病,其患病率高,致殘率高。這兩種疾病的發(fā)病機制仍不清,但已知其發(fā)病與遺傳密切相關,且遺傳模式存在種族差異。本課題以RA和AS的易感基因位點入手,圍繞挖掘其致病機理這一核心環(huán)節(jié),通過各種高通量基因分型、深度測序手段,結合遺傳流行病學分析方法,進行原創(chuàng)性、以及跨種族遺傳分析比較,對漢族人群RA和AS的遺傳模式、遺傳特點進行研究,從而揭示中國漢族人AS和RA的遺傳免疫學發(fā)病機制(一)鑒于在RA研究領域尚無中國人群大規(guī)模的遺傳流行病學研究成果,進行了首次漢族人RA大規(guī)模的全基因組關聯(lián)研究,鑒定了漢族人RA的特有基因DPP4,同時進行了CCP陽性與CCP陰性RA病人易感基因的比較分析,以及白種人與漢族人RA遺傳基因的比較分析。豐富了研究者對RA發(fā)病易感基因及遺傳模式的認識。(二)在AS研究領域,基于歐洲人、漢族人大規(guī)模全基因組關聯(lián)研究的工作基礎,針對發(fā)病核心易感基因IL23R在不同種族中存在較明顯的遺傳差異的情況,利用進行深度測序研究手段,發(fā)現了IL23R基因存在罕見變異與發(fā)病風險相關,使得對AS致病機理的研究有了更新認識。(三)以優(yōu)化漢族人全基因組關聯(lián)研究的平臺為目的,比較在常用全基因分析的兩個平臺ILLUMINA和AFFYMETRIX中檢測漢族人遺傳變異的性能,從而為漢族人中進行大規(guī)模遺傳研究提供了方法學參考。目的進行漢族RA患者的大規(guī)模全基因組關聯(lián)研究,比較與歐洲RA患者遺傳模式的差異;篩選漢族強直性脊柱炎(ANKYLOSINGSPONDYLITISAS)AS患者與AS相關的白介素23受體(IL23RECEPT,IL23R)基因罕見突變。比較GWAS分型平臺ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60差異;方法研究對象為來自中國上海和北京等省級城市醫(yī)院的無關聯(lián)門診病人,AS或RA由風濕病??漆t(yī)生進行診斷確定,對照為來自上海血庫的相應的健康獻血人群。應用GWAS技術從2132個病例和2553個對照中篩選了952個病例、943個對照和32個變異。應用MACH通過兩步法應用1000基因組計劃推算SNP數據,其中原始數據作為第一步,然后再推算頻率信息中。應用GRAIL技術探尋新基因之間以及與已知基因之間的關聯(lián)關系。應用GCTA技術估算RA易感突變的比例??缛巳篗ETA分析技術用于比較兩個遠距離遺傳隔離的漢族人和歐洲人的RA遺傳結構差異。AS研究中,應用靶向高通量測序技術進行測序。應用TAQMANOPENARRAY平臺進行基因分型,用APPLIEDBIOSYSTEMSOPENARRAYSNP基因分型軟件驗證。對50個AS病例和59個種族匹配的健康漢族人的包含IL23R基因區(qū)和鄰近區(qū)域的170KB進行測序。另外,對650個AS病例和1300個健康對照的,在歐洲人中高相關的30KB區(qū)域也進行測序。用846個病例和1308個健康對照進行基因分型驗證。應用ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺對非HAPMAP(NONHAPMAP)漢族人N396進行基因分型,用IMMUNOCHIP對子集進行基因分型。ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺獲得的基因型標記用于基于HAPMAP2JPT日本東京的日本人)CHB(中國北京的漢族人基因數據庫的基因推算。應用ILLUMINASBEADSTUDIO軟件進行基因型聚類。從樣本中分析得出SNPS,其中的低質量樣本被剔除。得到的SNPS類集進行手工檢索和驗證。PLINKVERSION107軟件的合并模式7的合并功能用于基因分析的符合性分析,它可以比較不計缺失基因型時的符合性。結果全基因組水平篩選到3個有統(tǒng)計學差異的NONMHC(NONMAJHISTOCOMPATIBILITYCOMPLEX,非主要組織相容性復合體)位點,且抗瓜氨酸蛋白抗體(ANTICITRULLINATEDPEPTIDEANTIBODY,ACPA)陽性病例(ACPA)中的該位點比ACPA陰性病例(ACPA)效應值要大。其中,有2個是新的突變子,RS12617656,位于二肽基肽酶(DIPEPTIDYLPEPTIDASE4,4DPP4)基因內含子區(qū),優(yōu)勢比(ODDSRATIO,)156,P161021;RS12379034,位于CDK5調節(jié)亞基相關蛋白2(CDK5REGULATYSUBUNITASSOCIATEDPROTEIN2,CDK5RAP2)基因編碼區(qū),149,P111016;另一個是已知的人趨化因子受體6(HUMANCHEMOKINERECEPT6,CCR6)位點(RS1854853,071,P651015)。ACPA病例與ACPA對照研究顯示,RS12617656與APCA強關聯(lián)P531018,與主要組織相容性復合體(MAJHISTOCOMPATIBILITYCOMPLEX,MHC)位點關聯(lián)性也很強RS7748270P59108??缛巳篗ETA分析顯示關聯(lián)信號區(qū)的重疊和富集。對3個分型平臺進行比較,AFFYMETRIX和ILLUMINA平臺包括IMMUNOCHIP的符合性很高。OMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60的推算能力有差異,而且MACH的推算效率與先前的報道相比總體偏低很多,但OMNIEXPRESS平臺可推算更多的SNPS,其最小等位基因頻率(MINALLELEFREQUENCY,MAF)是5%。OMNIEXPRESS平臺比AFFYMETRIX60平臺有更高的HAPMAPSNPS覆蓋率(各為736和659,MAF5)。AFFYMETRIX60芯片的推算數據與OMNIEXPRESS或ILLUMINO芯片的比較時的錯誤率比OMNIEXPRESS的基因型推算與直接分型的AFFYMETRIX60或ILLUMINO芯片SNPS比較時的錯誤率略大。低MAF幾乎對R2評估的推算質量或符合性沒有影響,說明這些GWAS芯片雖然不是特異設計用來捕獲罕見變異,但是實際上也可以捕獲有意義的部分低頻變異的遺傳突變。本研究鑒別了1047個突變,其中729個未出現在DBSNPGENOMICBUILD130數據庫中。鑒別了若干有潛在功能的罕見IL23R基因突變,包括1非同義替換SNP(NONSYNONOMOUSSINGLENUCLEOTIDEPOLYMPHISM,NSSNP),GLY149ARG(1號染色體,位置67421184GA)。驗證基因分型顯示GLY149ARG與AS相關(061,P00054),且預測算法發(fā)現這個氨基酸的變化會破壞蛋白的功能。與AS相關的IL23RGLY149ARG突變參與了漢族人AS易感的IL23信號通路,IL23R與先前發(fā)現的STAT3結合構成IL23的新的信號通路。結論本研究拓展了RA的風險等位基因列表,證實DPP4和CDK5RAP2與RA存在遺傳關聯(lián),且CDK5RAP2是一個與RA相關的重要的不同于TRAF1C5的新的基因位點,提示不同人群中新型多基因復雜性狀變異的本質實際上都是由常見的偶發(fā)變驅動的,這為研究RA發(fā)病機理提供了新的途徑,為常見基因變異驅動的新型多基因復雜特性增加了實踐證據。首次提出與AS發(fā)病機理相關的IL23R基因突變,并鑒定了一個低頻的NSSNP,該突變可能導致IL23R失能,從而對漢族人AS具有保護效應。這提示功能下降的IL23R可預防AS。這個發(fā)現進而支持IL23信號在AS發(fā)病過程中中起重要作用,這提示IL23信號通路這條通路可作為AS潛在的治療靶點。本研究還發(fā)現進行深度測序有助于鑒別與復雜疾病易感性相關的罕見或低頻突變,同時這種技術方法也有助于候選基因偶發(fā)突變的精確定位。ILLUMINAOMNIEXPRESS和AFFYMETRIX60平臺有相似的基因分型準確性和相似的推算SNPS準確性。雖然OMNIEXPRESS平臺的HAPMAPSNPS覆蓋率中等,但是對亞洲人來說,它能提供覆蓋率更好一些。研究也提示只要有適當的質量控制,不管是AFFYMETRIX60或OMNIEXPRESS芯片,研究中聯(lián)合推算SNPS或分型SNPS都是可行的。
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簡介:目的慢性炎癥與腫瘤關系密切,血管內皮細胞在炎癥和腫瘤的病理過程中發(fā)揮重要作用。本研究以內毒素(LPS)激活血管內皮細胞,釋放炎癥介質和粘附分子,探索內皮細胞NFΚBJMJD3信號軸在內皮細胞炎癥反應過程的的作用,并分析其可能的表觀遺傳學調控機制,為有效抑制血管炎癥反應,尋找相關疾病治療靶點,提供實驗依據。方法1細胞培養(yǎng)及分組復蘇并常規(guī)培養(yǎng)原代人臍靜脈內皮細胞(HUVECS),隨機分為對照組與LPS實驗組,實驗組按照不同檢測指標要求,予LPS刺激不同時間段后取樣待測。2、LPS誘導內皮細胞炎性介質和粘附分子的表達釋放ELISA試劑盒檢測細胞上清液中IL6、MMP9和ICAM1與表達變化;3、NFΚBP65、JMJD3的表達與定位免疫熒光實驗觀察NFΚBP65、JMJD3的表達與定位變化;RTPCR檢測JMJD3RNA水平的表達變化;蛋白質免疫印跡法驗證NFΚBP65,IΚBΑ和JMJD3的表達變化;4、NFΚBP65轉錄因子活性測定MILLIPE轉錄因子試劑盒檢測胞核NFΚBP65蛋白活性;5、染色質免疫共沉淀技術分析目標基因的轉錄起始結合位點區(qū)域NFΚBP65、JMJD3、H3K27ME3的募集關系應用MILLIPE染色質免疫共沉淀試劑盒建立目標DNA文庫,CHIPQPCR分析在目標基因IL6、MMP9和ICAM1轉錄起始結合位點NFΚBP65、JMJD3、H3K27ME3的募集關系。結果1、LPS誘導內皮細胞炎性介質和粘附分子的表達釋放細胞上清液中IL6、MMP9和ICAM1分別與相應的對照組相比表達顯著升高,差異均具有統(tǒng)計學意義(P2、NFΚBJMJD3信號通路的活化(1)NFΚBP65免疫熒光實驗中LPS各組與空白對照組(0H組)相比,隨著刺激時間增加整體熒光強度逐漸增加,NFΚBP65表達上調,并逐漸向轉胞核內聚集,核轉位高峰為2H。(2)NFΚBP65轉錄因子活性測定LPS刺激2H組中NFΚBP65蛋白相對活性顯著高于對照組(0H組)(P005。(3)RTPCR檢測JMJD3RNA水平變化LPS2H組RNA水平顯著高于對照組(0H組),差異有統(tǒng)計學意義P005。(4)JMJD3免疫熒光實驗中LPS各組與對照組(0H組)相比JMJD3的表達均上調,其中于1H和2H上調明顯。(5)蛋白質免疫印跡法驗證總NFΚBP65蛋白隨著LPS刺激時間增加表達逐漸上調;胞核NFΚBP65蛋白于2H和6H表達明顯上調;IΚBΑ蛋白于LPS2H和4H組表達明顯下調;JMJD3表達亦上調,于1H和2H上調明顯。(6)染色質免疫共沉淀技術分析目標基因轉錄起始結合位點NFΚBP65、JMJD3和H3K27ME3的募集關系NFΚBP65關聯(lián)DNA文庫中IL6、MMP9的相對擴增量與相應的對照組相比顯著升高(P005);JMJD3關聯(lián)DNA文庫、H3K27ME3關聯(lián)DNA文庫中目標基因擴增結果與NFΚBP65關聯(lián)DNA文庫擴增結果一致。結論LPS誘導內皮細胞中NFΚBJMJD3信號通路激活,活化高峰時間為2HNFΚB信號通路活化后釋放轉錄因子入核結合到JMJD3相應啟動子區(qū)域,調控JMJD3表達,上調的JMJD3入核作用于目標基因區(qū)域組蛋白H3K27ME3使其去甲基化、改變構象,從而暴露目標基因轉錄起始序列,NFΚB通路的活化時也調控轉錄因子本身表達,上調的核因子ΚB結合到暴露的轉錄起始序列上調控目標基因的轉錄,引起炎癥介質和粘附分子的表達影響內皮細胞微環(huán)境,導致炎癥相關病理過程。
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簡介:1962年NEEL提出了“節(jié)儉基因”假說并于1982年進行了修正,該假說認為引發(fā)糖尿病的易感基因有一定遺傳優(yōu)勢,并能使具有這種遺傳基因的個體產生某些生存優(yōu)勢,即“節(jié)儉基因”可以使人類在進食期間盡量儲備能量,以備饑餓期間消耗,而在饑荒年代又能夠盡可能減少能量消耗的基因。具有這種基因的人群具有相對的生存優(yōu)勢,即可以通過飽餐期或營養(yǎng)豐盛期盡量將多余的能量以脂肪的形式儲備起來,為饑荒期提供能量供應,抵抗食物短缺。但隨著社會經濟迅速發(fā)展,在原來經常出現食物短缺的地區(qū),食物突然可以長期穩(wěn)定豐富供應后,人們在開始接受高熱量食物同時擺脫了繁重的體力勞動,采用少動的生活方式,節(jié)儉基因作用就從有益于人類變成了人類的負擔,促使了肥胖及Ⅱ型糖尿病的發(fā)生率顯著增加。然而,節(jié)儉基因不應僅包括能量代謝相關基因,水鹽代謝等相關基因只要受到特定選擇壓力的影響均可成為節(jié)儉基因。本研究基于水鹽代謝通路腎素血管緊張素醛固酮系統(tǒng)RAAS中的幾個關鍵基因,提出如下假設“人類走出非洲前,為適應干旱高溫環(huán)境在RAAS通路中存在優(yōu)勢基因,走出非洲后,離開干旱高溫環(huán)境,優(yōu)勢基因將成為劣勢基因(節(jié)儉基因學說),帶有該基因的人將處于生存劣勢,部分被淘汰。因此,相關基因突變頻率應以非洲為中心沿人類遷移路線呈明顯的地理遺傳梯度分布,世界人群的RAAS通路關鍵基因突變頻率的地理遺傳梯度應與全球氣候變化梯度存在空間依賴性”。本研究在空間遺傳學、空間統(tǒng)計學和空間生態(tài)學的框架內,應用探索性和驗證性因子分析提取全球氣候地理因素的潛變量因子,在此基礎上進行了氣候因子和等位基因基因頻率的空間自相關分析、空間克里格插值分析、空間疊加分析、多元線性回歸分析以及地理權重回歸分析,以此探索“基因節(jié)儉學說”的進化生態(tài)學證據。結果如下⑴全球地理氣候指標可提取2個潛變量因子溫度因子,支配著年均平均大氣氣溫(標準化因子載荷095),溫度氣候帶(標準化因子載荷096)和地理緯度帶(標準化因子載荷094)這三個變量,溫度因子得分越高,表示溫度越高;濕度因子,支配著年均降雨量(標準化因子載荷084)和地理氣候帶(標準化因子載荷083)這兩個變量,濕度因子得分越高,表示濕度越大。⑵空間自相關分析顯示,溫度因子、濕度因子、ACED等位基因、AGT235T等位基因和AT1RC等位基因的空間自相關系數分別為061、033、059、057和07,且均有統(tǒng)計學意義,氣候潛在因子和腎素血管緊張素醛固酮系統(tǒng)關鍵基因基因頻率具有空間正相關關系。⑶ACED等位基因、AGT235T等位基因、AT1RC等位基因、溫度因子和濕度因子均存在二階趨勢,分析比較平均誤差、均方根誤差、標準平均值、標準化平均誤差和標準化均方根誤差,分別選取SPHERICAL模型作為ACED等位基因、溫度因子和濕度因子、GAUSSIAN模型作為AGT235T等位基因、AT1RC等位基因的半方差函數進行空間克里格插值分析。⑷氣候潛在因子(溫度因子和濕度因子)與腎素血管緊張素醛固酮通路內關鍵基因突變位點基因頻率之間的全局回歸模型表明,溫度因子、濕度因子與ACE基因D等位基因基因頻率、AGT基因235T等位基因基因頻率、AT1R基因C等位基因基因頻率有關,并且溫度因子、濕度因子分別正向和負向影響著D等位基因基因頻率;溫度因子、濕度因子均正向影響著235T等位基因基因頻率;溫度因子、濕度因子均負向影響著C等位基因基因頻率。⑸氣候潛在因子(溫度因子和濕度因子)與腎素血管緊張素醛固酮通路內關鍵基因突變位點基因頻率之間的局域回歸模型表明,溫度越高,D等位基因地理權重回歸模型的溫度因子系數越大,即溫度越高,D等位基因基因頻率越高;濕度越大,D等位基因地理權重回歸模型的濕度因子系數越小,即濕度越大,D等位基因基因頻率越低。并且,溫度因子與ACE基因D等位基因的這種空間依賴關系與人類走出非洲的遷移路線之間也呈現出明顯的空間依賴關系。本研究表明①全球地理氣候指標可提取2個潛變量因子溫度因子,支配著年均平均大氣氣溫,溫度氣候帶和地理緯度帶這三個變量,溫度因子得分越高,表示溫度越高;濕度因子,支配著年均降雨量和地理氣候帶這兩個變量,濕度因子得分越高,表示濕度越大。通過因子分析,避免了后續(xù)回歸分析中存在的多重共線性問題。②ACE基因D等位基因的地理遺傳梯度以非洲為中心沿人類遷移路線呈現明顯的地理遺傳梯度分布。③綜合氣候潛在因子對ACE基因D等位基因的空間依賴關系呈現出明顯的空間結構性和空間異質性特征,且這種空間依賴關系與人類走出非洲的遷移路線基本吻合。表明其受到氣候因素的自然選擇作用。④通過本研究證明了ACE基因D等位基因是一個“節(jié)儉”基因,這為“節(jié)儉”學說提供了新的進化生態(tài)學證據。本研究的創(chuàng)新點⑴擴展了“節(jié)儉”基因概念,認為與水鈉平衡調節(jié)有關的基因也應該作為節(jié)儉基因的很好的候選者。這為從非能量代謝途徑證明“節(jié)儉”基因的存在提供了新思路。⑵采用空間遺傳學新方法,證明了ACE基因D等位基因是一個“節(jié)儉”基因,這為“節(jié)儉”基因學說提供了新的進化生態(tài)學證據。⑶將空間遺傳學、空間統(tǒng)計學、空間流行病學、進化生態(tài)學和氣候學等學科的理論方法交叉融合,為探索“節(jié)儉”基因提供了新的進化生態(tài)學分析方法。不足之處對于AGT基因和AT1R基因的研究,因其樣本含量不足和樣本點空間分布不均勻,尚未發(fā)現AGT基因和AT1R基因能夠作為“節(jié)儉”基因的進化生態(tài)學證據。進一步的研究尚需繼續(xù)搜集數據并優(yōu)化分布格局,以證明二者是否為“節(jié)儉”基因。
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簡介:研究目的通過對男性原發(fā)不育患者的染色體核型以及Y染色體基因微缺失的分析研究,尋找男性原發(fā)不育的遺傳學依據,以及中國男性原發(fā)不育患者AZF基因突變的熱點,為臨床進行男性不育的診斷、治療以及輔助生殖技術提供相應的理論依據和技術支持。方法和材料以2008~2011年于天津市中心婦產科醫(yī)院就診的無精子癥或是少精子癥患者83例為研究對象。所有患者均按照世界衛(wèi)生組織WHO推薦的方法和診斷標準加以確診,并排除內分泌失調、輸精管阻塞、隱睪等因素。對所有研究對象進行外周血染色體核型分析,將83例患者分成染色體核型正常組和染色體核型異常組。抽取患者2MLEDTA抗凝外周血,采用酚一氯仿的方法提取DNA并保存于20℃?zhèn)溆?。與大多數研究通常選用AZF區(qū)612個位點進行檢測不同,在本研究中選取15個位點進行研究,包括AZFΑ區(qū)的SY82、SY84、SY86,AZFB區(qū)的SY124、SY127、SY128、SY133、SY134、SY143,AZFC區(qū)的SY239、SY242、SY254、SY255,AZFD區(qū)的SY145、SY152。將這15個位點組成4套多重PCR系統(tǒng),分別為系統(tǒng)ⅠSRY、SY254、SY143、SY242、SY255,系統(tǒng)ⅡSRY、SY84、SY239、SY152,系統(tǒng)ⅢSRY、SY86、SY127、SY145、SY124,系統(tǒng)ⅣSRY、SY134、SY82、SY128、SY133。為排除假陽性的結果,在每套系統(tǒng)中以SRY基因作為內對照,同時以空白和健康男性作外對照。結果1DNA提取的質量用酚氯仿的方法提取所有研究對象的外周血DNA,DNA的濃度在4461NGΜL~1612NGΜL962±86NGΜL,A260280在165~185之間。213例異常染色體核型分析在83例患者中有13例患者存在染色體核型的異常,其中7例為無精子癥患者,核型分別為3例47,XXY;1例45,XY,ROB13;21P10;Q10;1例45,XY,ROB14;15DELYPTER→Q112;1例48,XXYY;1例46,XY,INV9P11Q12,21PSS,15P。6例為少精子癥患者,核型分別為2例47,XXY;1例46,XY,DELYQ1123;1例46,XY,T622Q15;P11;1例46,XY,T15,22Q112,Q112;還有1例患者染色體核型為46,XY,T4;18Q35;Q112。3微缺失發(fā)生的區(qū)域在染色體核型正常的70例無精子癥及少精子癥患者中共有8例AZF的微缺失,總缺失率為114%870。其中無精子癥患者共32例,有4例有AZF的微缺失,缺失率為125%432;少精子癥患者共38例,有4例有AZF微缺失,缺失率為105%438。在有AZF微缺失的8例患者中,5例有AZFC的微缺失,4例有AZFB的微缺失,3例有AZFΑ的微缺失,1例有AZFD的微缺失。4染色體正?;颊呶⑷笔Оl(fā)生的位點8例有微缺失的病例中包含了14個位點的缺失,其中1例是AZFBAZFCAZFD的微缺失,缺失位點包括SY124、SY127、SY128、SY133、SY134、SY143、SY145、SY152、SY239、SY242、SY254、SY255,占缺失病例的125%18;1例是AZFB4ZFC的微缺失,缺失位點為SY254、SY134,占缺失病例的125%18;1例是AZFΑAZFBAZFC的微缺失,缺失位點為SY254、SY134、SY82,占缺失病例的125%18;2例是AZFΑ的微缺失,缺失位點為SY84,占缺失病例的250%28;1例是AZFB的微缺失,缺失位點為SY127,占缺失病例的125%18;2例是AZFC的微缺失,缺失位點為SY254,占缺失病例的250%28。在8例AZF微缺失的患者中未檢測到SY86的缺失。5對1例46,XY,YQH的檢測該患者的染色體核型為46,XY,DELYQ1123,臨床表現為少精子癥,通過Y染色體基因微缺失的檢測發(fā)現該患者存在SY254AZFC和SY134AZFB的缺失。結論1染色體異常是引起男性原發(fā)不育的一個重要因素,對不育男性常規(guī)進行外周血染色體核型分析既可以幫助病人尋找不育的遺傳因素,也可以減少患者將變異染色體傳給后代的幾率,降低染色體異常患兒出生的機率。2在本研究中男性原發(fā)性無精子癥和少精子癥的患者中AZF基因微缺失率高達114%,說明對于此類患者特別是尋求輔助生殖技術的患者應常規(guī)做Y染色體基因微缺失的檢測;同時也說明本研究選取的15個STSS位點涵蓋了中國人群Y染色體微缺失的熱點,可以作為基因檢測的靶位點。3對有遺傳病家族史的人群,在懷孕前應進行產前咨詢,在懷孕期間應根據個人情況進行絨毛或羊水的產前染色體及基因診斷,降低遺傳病患兒出生的機率。
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