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    • 簡介:Y989070分類號密曩⑨研究生學(xué)位論文玉筋魚群體形態(tài)學(xué)、遺傳學(xué)比較研究咄紀(jì)篁鵬黼懶直丟翅教授申髀蝴瑚國簦堂力史靖碾堂僮剁,秣漁業(yè)瓷蘧蝴日期墊鰻生墨且墊旦蝴日甥生且中國海洋大學(xué)玉筋魚群體形態(tài)學(xué)、遺傳學(xué)比較研究親緣關(guān)系,它們與其它4個群體之間的遺傳距離在00122~00161之間,相對稍遠(yuǎn),但仍處于種內(nèi)水平,進(jìn)一步確定這6個群體皆屬玉筋魚的結(jié)論。根據(jù)COI基因片段分析結(jié)果,北方玉筋魚和玉筋魚二者間堿基差異率達(dá)504~556%,種內(nèi)遺傳距離明顯小于種間遺傳距離,兩種玉筋魚在線粒體INACOI基因片段有明顯差異,可以作為兩個種的鑒定標(biāo)記?!瓣P(guān)鍵詞玉筋魚;形態(tài)學(xué);遺傳學(xué);種群H
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    • 簡介:復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文云南野生稻資源的保護(hù)生物學(xué)與遺傳性狀研究姓名吳成軍申請學(xué)位級別博士專業(yè)植物學(xué)指導(dǎo)教師孫崇榮黃興奇20040428在細(xì)胞水平上,分別利用云南三種野生稻花藥、種胚和莖葉為材料,進(jìn)行了愈傷組織誘導(dǎo)、分化和低溫保存研究。結(jié)果表明,疣粒野生稻最容易誘導(dǎo)分化,普通野生稻其次,藥用野生稻最難。在植株個體水平上,分別在西雙版納和昆明建立了野外和溫室內(nèi)保護(hù)苗圃,對來自云南不同地區(qū),具有代表性的居群個體材料進(jìn)行易地保護(hù)。在居群水平上,爭取了政府的立項(xiàng)投資,已經(jīng)開始實(shí)施了對元江普通野生稻、孟定藥用野,土稻和景洪疣粒野生稻三個自然居群的原位保護(hù)。疣粒野生稻由于生存環(huán)境的特殊性,瀕?,F(xiàn)狀相對較輕,然而居群受到的干擾破壞也很嚴(yán)重。如何合理有效地保護(hù)好疣粒野生稻居群,使其避免象普通野生稻和藥用野生稻一樣處于滅絕的邊緣,是非常重要的。本文以具有代表性的14個疣粒野生稻居群樣品為材料,用RAPD和ISSR分子標(biāo)記研究了云南疣粒野生稻居群陽J和居群內(nèi)的遺傳多樣性。結(jié)果顯示,居群間的遺傳多樣性水平較高,多態(tài)率分別為59%和64%。居群內(nèi)的遺傳多樣性水平則較低,平均多態(tài)率分別為25%和21%。據(jù)此,我們對云南疣粒野生稻提出一個科學(xué)的保護(hù)策略即進(jìn)行易地保護(hù)時對同一居群內(nèi)的采樣相對較少,而應(yīng)該對更多的居群采樣保存。進(jìn)行原位保護(hù)時,應(yīng)該多選一些遺傳變異大的居群加以保護(hù)。長期以來,許多研究表明云南具有豐富的栽培稻品種和野生稻物種,是亞洲栽培稻的起源演化中心和野生稻遺傳多樣性中心之一。本研究以云南尚存的4種不同表型的普通野生稻、主要栽培的本地品種和國際上典型的秈稻和粳稻品種為樣品,用RAPD和ISSR分子標(biāo)記研究了它們之間的遺傳多樣性和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明,云南不同表型的普通野生稻之間具有高水平的遺傳變異,元江普通野生稻作為海拔分布最高780M,隔絕狀態(tài)較好周圍沒有發(fā)現(xiàn)種植栽培稻的原始型普通野生稻,其居群內(nèi)也具有豐富的遺傳多樣性,應(yīng)該進(jìn)行原位保護(hù)。此外研究也揭示,云南普通野生稻和栽培稻的系統(tǒng)演化和分化途徑符合傳統(tǒng)的“一元論”學(xué)說。在普通野生稻先演化成秈稻,然后分化出粳稻的過程中,由于水稻品種單一的栽培馴化而丟失了大量的遺傳多樣性,使得栽培稻的遺傳基礎(chǔ)變的越來越狹窄。對野生稻遺傳資源的有效保護(hù)和保存,目的就是為了發(fā)掘利用這一寶貴的天然基因庫。而對野生稻的遺傳性狀進(jìn)行系統(tǒng)的鑒定評價,是十分必要的前期基礎(chǔ)工作。本文作為項(xiàng)目系統(tǒng)鑒定評價工作的一部分,對云南野生稻的品質(zhì)性狀和抗白葉枯病性狀進(jìn)行了鑒定研究,發(fā)現(xiàn)疣粒野生稻對白葉枯病高抗甚至免疫,藥用野生稻中抗白葉枯病。進(jìn)~步用形憊學(xué)觀察和分子水平檢測等方法,發(fā)現(xiàn)疣粒野生稻、藥用野生稻具有目前尚未分離的抗白葉枯病基因。同時用國家標(biāo)準(zhǔn)測定方法對野生稻品質(zhì)性狀進(jìn)行了系統(tǒng)和全面分析,發(fā)現(xiàn)普通野生稻、疣粒野生稻、藥用野生稻稻米蛋白質(zhì)含量平均為15%,個別材料達(dá)到19%,極顯著高于栽培稻2
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    • 簡介:929233專J~,博士學(xué)位論文⑧論文題目墨庭堡控遑佳堂班童作者姓名吳海龍指導(dǎo)教師方盛國教授學(xué)科、專業(yè)動物學(xué)所在學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院提交日期2006年1月12月浙江大學(xué)博士學(xué)位論文黑麂保護(hù)遺傳學(xué)研究4線粒體控制區(qū)序列分析結(jié)果表明,遂昌種群與黃山和天目山種群之間,已產(chǎn)生了顯著的遺傳分化遂昌和黃山之間GSV016772,P0001遂昌和天目山之間乃STO20022,P0001,提示遂昌種群在母系遺傳上,與另外兩個種群發(fā)生了隔離。黃山和天目山種群之間沒有顯著的遺傳分化GST005628,P0125,表明這兩個種群之間,歷史上曾存在較強(qiáng)的雌性基因流。然而,這兩個種群又各自擁有不少特有單倍型,表明在歷史上著這兩個種群之間,也出現(xiàn)了基因流障礙。5基于簡約法MP和鄰接法NJ構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹,以及最簡約網(wǎng)絡(luò)跨度圖,都支持黑麂線粒體單倍型分化成CLADEIANDCLADEII兩個進(jìn)化枝。但種群間線粒體單倍型在系統(tǒng)發(fā)生上,尚未形成互為獨(dú)立的單系群。特別指出的是,遂昌種群中有兩個迥然不同的單倍型系共存。6嵌套枝進(jìn)化分析NCA表明,黑麂線粒體單倍型分布與地理區(qū)域存在顯著的相關(guān)性。推測種群在發(fā)生區(qū)域膨脹之前,曾經(jīng)經(jīng)歷了棲息地片斷化效應(yīng)PASTFRAGMENTFOLLOWEDBYRANGEEXPASION。堿基錯配檢驗(yàn)MISMATCHDISTRIBUTION和中性檢驗(yàn)NEUTRALTEST結(jié)果,都表明黑麂種群歷史上曾經(jīng)發(fā)生過膨脹現(xiàn)象。綜合上述結(jié)果,本文對黑麂線粒體單倍型系統(tǒng)地理發(fā)生模式的解釋是1歷史上黑麂因遭受冰河作用而被隔離,被隔離的種群各自獨(dú)立進(jìn)化;2當(dāng)冰河作用消退后,孑遺種群發(fā)生了區(qū)域膨脹,致使不同單倍型系的種群發(fā)生了二次接觸;3近代人類活動,可能是黑麂現(xiàn)存種群基因流減小的主要原因。766對跨物種微衛(wèi)星引物???9對,鹿科17對對黑麂樣品的擴(kuò)增率為70%,具有多態(tài)性引物的比例為30%。本文最終篩選獲得的11對多態(tài)性微衛(wèi)星引物的多態(tài)信息含量POLYMORPHICINFORMATIONCONTENT,PIC值,最低為O645,平均為0794,遠(yuǎn)大于05的高多態(tài)性臨界值。表明作者通過跨物種篩選的多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn),包含了非常豐富的遺傳信息。11對多態(tài)性微衛(wèi)星引物的累積個體識別率達(dá)到100%,其非父累積排除概率CUMULATEPATERNITYEXCLUSION,CPE在雙親信息都是未知情況下為09993,而在得知任一親本信息的情況下達(dá)到100%。表明本文通過跨物種篩選的方法,所選的黑麂的微
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    • 簡介:浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士學(xué)位論文藏羚羊保護(hù)遺傳學(xué)研究姓名阮向東申請學(xué)位級別博士專業(yè)動物學(xué)指導(dǎo)教師方盛國20070701學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解濫姿態(tài)堂有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)J盞鎏盤鱟可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書學(xué)位論文作者簽名導(dǎo)師簽名簽字日期年月日簽字日期年月日學(xué)位論文作者畢業(yè)后去向工作單位通訊地址116電話郵編
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    • 簡介:遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文我國斑點(diǎn)叉尾鮰種質(zhì)資源的分子遺傳學(xué)研究姓名陳姝君申請學(xué)位級別碩士專業(yè)海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師赫崇波20080501P2004、P1984SSRP2004、P1997、P8497、P1984。其中P1984群體的遺傳多樣性各參數(shù)在所有群體中都是最低的。利用AFLP分析的群體間的遺傳分化度GST為0.0957,各群體間的GST分布在0.0798“0.1192之間;SSR測得的群體間總的近交系數(shù)FST為0.0196,說明群體內(nèi)總的遺傳分化中有1.96%是來自群體間的遺傳變異。同時利用GST和風(fēng)T得出的群體內(nèi)總的NM分別為4.8404AFLP和23.3290SSR,證明各群體間基因流動性很好。利用兩種方法計(jì)算的4個群體的遺傳距離分布在0.0079“0.0158AFLP之間和0.0066“~0.0632SSR之間。基于遺傳距離所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹表明,4個群體共分為了三個組P1997和P2004首先聚為一類,再與P8497聚為一支,而P1984單獨(dú)成為一支。通過對斑點(diǎn)叉尾鲴的遺傳變異和遺傳結(jié)構(gòu)的分析,比較了兩種分子標(biāo)記在研究群體遺傳多樣性中的優(yōu)越性。結(jié)果表明,SSR技術(shù)的多態(tài)信息含量以及有效等位基因數(shù)等遺傳變異參數(shù)明顯高于AFLP技術(shù),但是,AFLP能夠獲得L匕SSR技術(shù)更高效的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)檢出率。AFLP標(biāo)記主要檢測的是核基因組編碼區(qū)與非編碼區(qū)DNA序列上的差異,而SSR標(biāo)記主要檢測的是基因組DNA非編碼區(qū)重復(fù)數(shù)上的差異,實(shí)驗(yàn)的結(jié)果表明,兩種分子標(biāo)記都是研究斑點(diǎn)叉尾鲴種群多樣性的有力工具。關(guān)鍵詞斑點(diǎn)叉尾蛔;AFLP;SSR;分子標(biāo)記;遺傳多樣性
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    • 簡介:浙江大學(xué)博士學(xué)位論文華南虎保護(hù)遺傳學(xué)研究姓名張志和申請學(xué)位級別博士專業(yè)遺傳學(xué)指導(dǎo)教師朱睦元20060101浙江大學(xué)博士學(xué)位論文因座TIGER6和基因座TIGERL9不符合HW平衡外,其余的基因座都符合H_W平衡。20個微衛(wèi)星座位的多態(tài)信息含量PIC最低為0359,最高為0859,平均值為0684,除TIGER7和TIGERL9為中度多態(tài)外,其余座位都具有高度多態(tài)性。應(yīng)用午Ⅱ關(guān)數(shù)摒對圈養(yǎng)華南虎群體進(jìn)行遺傳分析,發(fā)現(xiàn)圈養(yǎng)華南虎維持了相對較高的等位基因多樣性和雜合度,但是其保持非常困難,原因在于很多稀有等位基因只在一個或兩個個體中存有,很易因攜帶個體的死亡而從華南虎群體中消失。4應(yīng)用20個華南虎微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行圈養(yǎng)華南虎親子鑒定,根據(jù)CERVUS軟件的SIMULATION程序,在95%的置信水平可得到100%的成功鑒定率。目前己鑒別8只圈養(yǎng)華南虎的父一子母關(guān)系,這對于華南虎圈養(yǎng)種群的譜系管理具有十分重要的意義。5采用線粒體DLOOP和ND5標(biāo)記進(jìn)行華南虎、東北虎和孟加拉虎之間的遺傳變異研究。結(jié)果表明現(xiàn)存虎亞種間的遺傳分化很小從ND5來看,華南虎與孟加拉虎的序列完全一樣,而與東北虎只有一個位點(diǎn)的差異;從DLOOP來看,華南虎與東北虎問的遺傳距離為O01411,華南虎與孟加拉虎間的遺傳距離為O00801,而東北虎與孟加拉虎間的遺傳距離為O00937。因此在這三個虎亞種中,華南虎與孟加拉虎問的距離晟近,而華南虎與東北虎問的距離最遠(yuǎn)。在D100P上,華南虎存在兩個特有位點(diǎn)418的C和433的T,從而據(jù)此可以把這華南虎與其他兩個虎亞種分開。此外,研究還發(fā)現(xiàn)了虎細(xì)胞核中的一個似DLOOP的序列NUMT,該序列在華南虎、東北虎和孟加拉虎上完全一致,估計(jì)其轉(zhuǎn)移到核中的時問大約為167百萬年。根據(jù)上述研究結(jié)果可見,隨繁殖代數(shù)增加,一部分華南虎稀有等位基因逐漸消失,進(jìn)而使群體遺傳多樣性降低。為最大限度地保護(hù)華南虎的遺傳多樣性,在圈養(yǎng)繁殖過程中,必須控制各種限制性因素,盡量使每只個體都得到有效的繁殖。根據(jù)研究結(jié)果,在華南虎遷地保護(hù)遺傳管理方面建議開展和采取以下措施1通過親子鑒定編制譜系2按照種群結(jié)構(gòu)和親緣系數(shù)安排配對,減少基因丟失;3增加數(shù)量,擴(kuò)大種群規(guī)模;4適當(dāng)延長世代間隔5充分利用各種繁殖技術(shù),加強(qiáng)營養(yǎng)和行為訓(xùn)練;6加強(qiáng)協(xié)調(diào),統(tǒng)一管理各分散飼養(yǎng)的華南虎個體。關(guān)鍵詞華南虎;基因資源庫;微衛(wèi)星;富集法;基兇分型;遺傳多樣性基因克隆NUMTS;DLOOPND5;親子鑒定種群管理;遷地保護(hù)。
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      上傳時間:2024-03-02
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    • 簡介:、習(xí)杏叮習(xí)〕一到貶丁了單位代碼學(xué)號丟了聲縈六了博士學(xué)位論文論文題目蜂猴屬的分子系統(tǒng)發(fā)育及分子群體遺傳學(xué)研究作者姓名」途一靛塵學(xué)科專業(yè)發(fā)直生物堂申請學(xué)位理學(xué)博士指導(dǎo)教師張紅衛(wèi)教授張亞平院士年月日山東大學(xué)博士學(xué)位論文目錄乃中文摘要英文摘要縮略語第一章蜂猴屬仰‘研究進(jìn)展第一節(jié)蜂猴屬研究背景蜂猴的形態(tài)習(xí)性樓蜂猴的形態(tài)習(xí)性蜂猴屬傳統(tǒng)生物學(xué)研究方法的困難第二節(jié)蜂猴屬研究的進(jìn)展蜂猴屬的系統(tǒng)學(xué)研究形態(tài)學(xué)和分類學(xué)蜂猴屬頭骨差異的綜合研究蜂猴屬分類研究,蜂猴屬的細(xì)胞學(xué)研究,二蜂猴屬的叫聲、生殖與行為,,,,,蜂猴的叫聲與行為蜂猴的生殖與行為樓蜂猴的生殖與行為蜂猴屬的母一嬰行為,蜂猴屬物種的個體發(fā)育研究八
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      上傳時間:2024-03-01
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    • 簡介:東方白鸛是分布于亞洲的大型涉禽,IUCN紅色物種名錄的瀕危EN物種。近年來由于自然棲息地面積驟減、種群數(shù)量下降、分布區(qū)片段化且日益萎縮目前東方白鸛的全球野生種群數(shù)量僅3000只左右且呈下降趨勢對該物種的保護(hù)刻不容緩。目前東方白鸛的遺傳學(xué)研究進(jìn)行得較少尚不能搞清其遺傳背景。微衛(wèi)星是一種高靈敏度的分子標(biāo)記由于在信息量、實(shí)驗(yàn)操作、分析方法等方面的明顯優(yōu)勢微衛(wèi)星標(biāo)記已經(jīng)成為保護(hù)遺傳學(xué)研究領(lǐng)域最有力的分子標(biāo)記手段但對于東方白鸛來講目前尚沒有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)無法應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記來進(jìn)行遺傳學(xué)研究因此本研究首先利用兩種不同的方法篩選得到東方白鸛的微衛(wèi)星位點(diǎn)繼而利用篩選出的微衛(wèi)星位點(diǎn)對我國東方白鸛的遺傳多樣性進(jìn)行分析為東方白鸛保護(hù)策略的制定提供科學(xué)依據(jù)。1本研究利用交叉擴(kuò)增法篩選東方白鸛的微衛(wèi)星位點(diǎn)采用近緣種黑頭鹮鸛的11個微衛(wèi)星位點(diǎn)做引物經(jīng)過對PCR體系的優(yōu)化在11個位點(diǎn)中有6個得到清晰的擴(kuò)增條帶其余5個位點(diǎn)得不到確切的擴(kuò)增產(chǎn)物。對上述6個位點(diǎn)的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行克隆測序分析發(fā)現(xiàn)其中4個位點(diǎn)上的擴(kuò)增產(chǎn)物含有微衛(wèi)星重復(fù)序列而另外2個位點(diǎn)中無重復(fù)單元。2利用鏈霉親和素與生物素之間有強(qiáng)親和性的原理首次采用FIO法直接篩選東方白鸛微衛(wèi)星位點(diǎn)。經(jīng)過酶切連接探針雜交磁珠富集雙鏈恢復(fù)藍(lán)白斑篩選最后得到120個陽性克隆其中55個含有微衛(wèi)星序列重復(fù)序列。經(jīng)過分析21條為完美型重復(fù)20條為不完全重復(fù)序列14條為混合重復(fù)序列。此外除二堿基和三堿基序列外我們還得到了4條六堿基1條七堿基2條五堿基1條四堿基的重復(fù)序列。3在55個位點(diǎn)中選取13個適合的位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物并將之與交叉擴(kuò)增法獲得的4對微衛(wèi)星引物一起進(jìn)行高效液相色譜分析成功篩選出了能夠應(yīng)用于東方白鸛的保護(hù)遺傳學(xué)研究的10個位點(diǎn)這10個位點(diǎn)分別為CBO133、CBO151、CBO102、CBO108、CBO109、CBO121、CBO168、CBO235、WSU13、WSU17。
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    • 簡介:本文以中間球海膽STRONGYLOCENTROTUSINTERMEDIUS、光棘球海膽SNUDUS及其雜交的F代為材料,通過分子標(biāo)記、構(gòu)建遺傳連鎖圖譜及基因表達(dá)差異等分子遺傳學(xué)技術(shù)對兩種海膽雜交產(chǎn)生的包括雜交優(yōu)勢在內(nèi)的遺傳變異進(jìn)行了相關(guān)的研究,為海膽雜交育種提供了遺傳學(xué)依據(jù)。主要內(nèi)容包括1雜交海膽的分子鑒定及生物學(xué)性狀特征。11從24對SSR引物中篩選出一對,能對父母本和雜交種的基因組DNA進(jìn)行有效擴(kuò)增,并且擴(kuò)增條帶清晰穩(wěn)定。利用雜交海膽中同時擁有父母本的互補(bǔ)帶型,對雜交海膽進(jìn)行了分子鑒定。12雜交海膽的外部形態(tài)特征介于雙親之間,正反交的F代殼色、棘色等形態(tài)特征接近,都有兩種表型一種殼為紫褐色,棘發(fā)白、尖部略紫;另一種殼和棘均為紫色,并且兩種表型所占比例不同,殼徑在LCM左右時正交F代中間球海膽♂光棘球海膽♂中為74O%和260%,反交F代光棘球海膽♀中間球海膽♂中各占681%和319%;殼徑3CM左右時正交F代為772%和228%,反交F代各占705%和295%。交F1代的生殖腺重、殼徑、體重等平均值都比母本具有不同程度的優(yōu)勢,有的時間達(dá)到顯著水平。有近10%的雜種生殖腺顏色不如母本鮮艷。2雜交海膽中間球海膽♀光棘球海膽♂群體多樣性的AFLP分析及AFLP標(biāo)記與數(shù)量性狀的相關(guān)性分析。21對光棘球海膽NU、中間球海膽IN及其雜交的F代中間球海膽♀光棘球海膽♂HYB,HYC兩種表型3個群體進(jìn)行了AFLP分析,并根據(jù)遺傳距離進(jìn)行了個體聚類分析。結(jié)果表明3個群體的多態(tài)位點(diǎn)比例分別是8199%,8051%和9595%。香農(nóng)多樣性指數(shù)分別為02331±01273,02005±01385和02625±01067。遺傳相似度分別為O6876±00523,06501±00548和06552±00553。分子方差分析AMOVA分析結(jié)果表明,變異來源有2539%來自群體間,有746L%來自群體內(nèi)。盡管雜交海膽在表型上可以明顯分成兩種類型,但是通過AFLP統(tǒng)計(jì)的遺傳距離進(jìn)行的個體聚類卻聚在一起,不能分成兩個群體。22對雜交海膽的生殖腺、殼徑、體重、棘長等數(shù)量性狀與AFLP標(biāo)汜進(jìn)行的相關(guān)性分析結(jié)果表明在4對引物產(chǎn)生的標(biāo)記中,18個標(biāo)記與生殖腺重量相關(guān)顯著,3個相關(guān)極顯著,最高貢獻(xiàn)率為1716%;21個標(biāo)記與殼徑相關(guān)顯著,5個相關(guān)極顯著,最高貢獻(xiàn)率達(dá)到1982%;17個標(biāo)記與體重相關(guān)顯著,6個相關(guān)極顯著,最高貢獻(xiàn)率達(dá)到1831%;9個標(biāo)記與棘長相關(guān)顯著。其中有多個標(biāo)記與同一性狀相關(guān),標(biāo)記中的多數(shù)也同時與幾個性狀相關(guān)。3初步構(gòu)建了光棘球海膽與中間球海膽的遺傳連鎖圖譜。利用42對引物組合及1對單對雜交的父母本個體和F代的60個個體通過“雙假測交”策略,構(gòu)建了光棘球海膽♀和中間球海膽♂的遺傳連鎖圖譜。光棘球海膽包括24個連鎖群,194個AFLP標(biāo)記,標(biāo)記間平均間隔171CM,覆蓋基因組總長度29883CM;中間球海膽包括23個連鎖群,199個AFLP標(biāo)記,平均問隔154CM,總長度26148CM。4光棘球海膽的主要卵黃蛋白MYPMAJYOLKPROTEINCDNA全序列的克隆和分析及MYP基因在中間球海膽和雜交F1,代中間球海膽♀光棘球海膽♂生殖腺不同發(fā)育時期的轉(zhuǎn)錄表達(dá)差異。41光棘球海膽的MYPCDNA全長4047BP,編碼1349個氨基酸。序列比對結(jié)果表明,MYP的3個區(qū)域133474;490658;941一1089表現(xiàn)出與脊椎動物鐵傳遞蛋白的保守結(jié)構(gòu)域同源。MYP中的半胱氨酸在20個位置與鐵傳遞蛋白相一致。說明MYP是鐵輸送蛋白,這與其它動物的卵黃蛋白是不同的。同時通過MYPCDNA序列分析了8種海膽的進(jìn)化關(guān)系,光棘球海膽與紅海膽的遺傳距離最近,為0069±001,與同科的馬糞海膽、紫球海膽、中間球海膽的遺傳距離分別是0095±0012、0098±0011和010L±0012。與白棘三列海膽、擬球海膽及綠海膽的遺傳距離分別為0216±0017、0218±0018和0535±0028。42REALTIMERTFCR結(jié)果表明MYP基因在海膽雌雄個體生殖腺中轉(zhuǎn)錄水平上的表達(dá)差異不明顯。MYP基因在中間球海膽生殖腺發(fā)育的4個時期的表達(dá)呈快速的下降趨勢,而在雜交海膽呈緩慢下降的趨勢。在生殖腺的4個發(fā)育期中,中間球海膽的雌雄個體的MYP基因的表達(dá)量以18SRRNA為標(biāo)準(zhǔn)分別從4455%和4117%下降到959%和183%;雜交海膽的雌雄個體分別從3766%和3666%下降到1922%和1255%。說明MYP基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)量可能與雜交后生殖腺產(chǎn)生的變異密切相關(guān)。
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    • 簡介:中國海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文青鱗小沙丁魚(SARDINELLAZUNASI)種群形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)研究姓名楊天燕申請學(xué)位級別碩士專業(yè)漁業(yè)資源指導(dǎo)教師高天翔20080601青鱗小沙丁魚SARDINECZUNASI種群形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)研究魚類同源序列堿基特點(diǎn)相似。利用KIMURA2模型分析得到種間遺傳距離在O161642653之間,基于C”B基因片段序列,構(gòu)建的NJ樹顯示青鱗小沙丁魚與裘氏小沙丁魚親緣關(guān)系較近,而短體小沙丁魚與金色小沙丁魚親緣關(guān)系較近。依據(jù)分子進(jìn)化速率推測四種小沙丁魚發(fā)生分歧的時間約為800萬年到1300萬年前的中新世中、晚期,略早于其他魚類,表明小沙丁魚類在進(jìn)化上處于較低等水平。四、利用引物成功擴(kuò)增了金色小沙丁魚和青鱗小沙丁魚線粒體細(xì)胞色素氧化酶I亞基C01基因序列。與GENBANK中另外2種小沙丁魚的同源序列比對,去除部分端部序列后得到599BP同源序列,其中包括445個簡約信息位點(diǎn),154個變異位點(diǎn),沒有發(fā)現(xiàn)堿基的插入缺失。經(jīng)過測定,堿基T、C、A、G平均含量分別為284%、287%、225%和203%,其中堿基G的含量明顯較低。所測定4種小沙丁魚599BP核苷酸序列編碼的氨基酸完全一致。計(jì)算得出4種小沙丁魚遺傳距離在O158√205之間。NJ系統(tǒng)樹揭示出黑尾小沙丁魚和裘氏小沙丁魚親緣關(guān)系較近,青鱗小沙丁魚和金色小沙丁魚關(guān)系較近。關(guān)鍵詞小沙丁魚;形態(tài)學(xué);控制區(qū)序列;CYTB基因序列;C01基因序列H
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    • 簡介:東北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文吉林省六種蟋蟀細(xì)胞遺傳學(xué)研究姓名游聚霞申請學(xué)位級別碩士專業(yè)動物學(xué)指導(dǎo)教師任炳忠20061201關(guān)鍵詞蟋蟀總科;細(xì)胞分類核型;C一帶;聚類分析Ⅱ
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    • 簡介:西北大學(xué)碩士學(xué)位論文漆樹種質(zhì)資源遺傳學(xué)評價基于植物形態(tài)學(xué)、植物解剖學(xué)和AFLP分子標(biāo)記姓名趙喜萍申請學(xué)位級別碩士專業(yè)植物學(xué)指導(dǎo)教師魏朔南20080521漆樹種質(zhì)資源遺傳學(xué)評價一基于植物形態(tài)學(xué)、植物解剖學(xué)和AFLP分子標(biāo)記趙喜萍指導(dǎo)教師魏朔南教授西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,西安,710069摘要漆樹TOXICODENDRONVERNICIFLUUMSTOKESF.A.BARKLEY是隸屬于漆樹科ANACARDIACEAE漆樹屬TOXICODENDRON的重要經(jīng)濟(jì)樹種。漆樹的主要產(chǎn)品生漆,是一種優(yōu)良的天然涂料,生漆中的漆酶和生漆多糖也被近來研究發(fā)現(xiàn)具有重要的應(yīng)用價值。漆樹在長期栽培過程中形成了許多農(nóng)家品種,它們具有一定的形態(tài)特點(diǎn),適應(yīng)一定的生長環(huán)境。本文利用植物形態(tài)學(xué)、植物形態(tài)解剖學(xué)和AFLP分子標(biāo)記的方法,從外部形態(tài)、顯微結(jié)構(gòu)和DNA水平上綜合對陜西省的漆樹種質(zhì)資源進(jìn)行評價。目的是1確定鑒別漆樹栽培品種及大木漆樹的指標(biāo),并探討科學(xué)的品種鑒定方法,2表征漆樹種內(nèi)遺傳變異。通過以上的系統(tǒng)研究,取得的主要結(jié)果如下1.應(yīng)用多元統(tǒng)計(jì)分析方法,對14個漆樹樣本的2個器官葉子和花的26個性狀指標(biāo)進(jìn)行分析,從中篩選出3個主成分10個性狀作為主要分析指標(biāo)。第1個主成分指標(biāo)為花的性狀即花瓣的長度、花瓣的寬度、花絲的長度、花絲的直徑、花藥的長度和第5小葉長與寬之比,其貢獻(xiàn)率為30.383%;第2個主成分指標(biāo)為葉子的性狀,即復(fù)葉上的小葉數(shù)、復(fù)葉的長度、復(fù)葉柄的長度、第5小葉柄的長度和頂端小葉柄的長度。第3個主成指標(biāo)為第5小葉和頂端小葉項(xiàng)角的度數(shù)。依據(jù)多元統(tǒng)計(jì)篩選出的前3個主成分獲得三維分組圖。此圖把14個漆樹樣本分為2個大組。第L組包括栽培品種茄棵頭、金州黃、火焰子、大紅袍、黃茸高八尺、紅皮高八尺、金州紅、白皮高八尺和石泉大木、南鄭大木、寶雞大木3個大木漆樹,第2個大組由佛坪漆樹和韓城大木兩個大木漆樹組成,而隴縣大木單獨(dú)從這兩組中分出。依據(jù)多元統(tǒng)計(jì)篩選出的前2個主成分所獲得的二維分組圖與三
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    • 簡介:浙江大學(xué)博士學(xué)位論文梅花鹿保護(hù)遺傳學(xué)研究姓名吳華申請學(xué)位級別博士專業(yè)動物學(xué)指導(dǎo)教師方盛國張建龍20040501吳華梅花鹿保護(hù)遺傳學(xué)研究鹿具有最多的等位基因數(shù)量14個,而東北梅花鹿次之,四川梅花鹿居第三,江西梅花鹿最少。6.利用文獻(xiàn)上的引物,本文成功擴(kuò)增到了|ⅥHCII類基因DQAL座位的外顯子2區(qū)域,并發(fā)現(xiàn)和命名了12個新的等位基因。在這些新的等位基因中,浙江梅花鹿和東北梅花鹿具有最多的等位基因數(shù)量4個,而四川梅花鹿和江西梅花鹿次之。7.利用文獻(xiàn)上的引物,本文成功擴(kuò)增到了MHCII類基因DQA2座位的外顯子2區(qū)域,并發(fā)現(xiàn)和命名了16個新的等位基因。在這些新的等位基因中,浙江梅花鹿具有最多的等位基因數(shù)量7個,而東北梅花鹿次之,四川梅花鹿居第三,江西梅花鹿最少。8.在MHCI類基因的A、B、C座位和MHCII類基因的DRB、DQB座位,抗原結(jié)合位點(diǎn)的異義突變要明顯多于同義突變。這表明,平衡選擇在維持梅花鹿MHC基因多態(tài)性中起著重要的作用。9.線粒體DNA控制區(qū)序列變異分析表明,我國梅花鹿現(xiàn)有兩個單系,即單系I浙江梅花鹿和單系II東北一四川一江西梅花鹿。浙江梅花鹿與東北、四川和江西梅花鹿3個種群之間的遺傳分化顯著,沒有基因流存在。而在單系II中,東北、四川和江西梅花鹿3個種群之間,存在著豐富的基因流。10.微衛(wèi)星和MHC基因多態(tài)性分析表明,浙江、東北、四川和江西梅花賡4個種群之間的遺傳分化都達(dá)到極顯著水平。傳統(tǒng)分類上屬于同一亞種的浙江和江西梅花鹿之間,已發(fā)生了極顯著的遺傳分化。11.依據(jù)保護(hù)遺傳學(xué)的原理,本文將我國的梅花鹿定義為2個進(jìn)化顯著單元;①單元I浙江梅花鹿②單元II東北一四川一江西梅花鹿。在單元II中,由于東北、四川和江西梅花鹿之間,微衛(wèi)星和MHC基因的分析結(jié)果均表明,其發(fā)生了顯著的遺傳分化,因此,本文將東北梅花鹿、四川梅花鹿和江西梅花鹿分別定義為單獨(dú)的管理單元。在浙江梅花鹿這個進(jìn)化顯著單元內(nèi)部,由于只有一個種群,因此,它即是一個進(jìn)化顯著單元,也是一個管理單元。12.依據(jù)上述分析結(jié)果,本文提出如下保護(hù)建議●浙江梅花鹿為一獨(dú)立的進(jìn)化顯著單元,種群數(shù)量最小。且該種群中抗病相關(guān)的心C基因的多態(tài)性最為豐富,因此,從保護(hù)物種基因多態(tài)性,特別是2
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    • 簡介:廈門大學(xué)博士學(xué)位論文中國南部沿海條紋斑竹鯊和尖頭斜齒鯊種群遺傳學(xué)研究姓名陳驍申請學(xué)位級別博士專業(yè)海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師楊圣云20080701摘要遺傳多樣性水平較低遺傳距離和UPGMA聚類分析結(jié)果顯示條紋斑竹鯊的基因交流模式屬于沿海岸線的距離隔離模式,遺傳差異大小與地理距離遠(yuǎn)近相關(guān)。分子方差分析AMOVA結(jié)果顯示群體間存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu)差異FST004404,PO05,變異主要發(fā)生在群體內(nèi)部956%。2對中國南部沿海5個海域的條紋斑竹鯊群體線粒體控制區(qū)序列多態(tài)性進(jìn)行研究,獲得長度為1094~1096BP的線粒體控制區(qū)完整序列,經(jīng)過序列比對,發(fā)現(xiàn)了6個多態(tài)性核苷酸位點(diǎn),定義了8個單倍型。5個群體的單倍型多樣度JIIO542507448、平均核苷酸差異K06252871073563和核苷酸多樣度萬0000571一0000980均處于較低水平。分子方差分析AMOVA結(jié)果顯示群體間存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu)差異風(fēng)T021626,PO0001,變異主要發(fā)生在群體內(nèi)部784%。遺傳距離分析顯示各群體間的遺傳差異大小與地理距離遠(yuǎn)近相關(guān)。系統(tǒng)地理學(xué)分析顯示閩南群體最古老,其余群體是由閩南群體擴(kuò)張發(fā)育而來。3采用隨機(jī)引物擴(kuò)增多態(tài)性DNARAPD技術(shù)對中國南部沿海閩東霞浦一浙南瑞安海域MD、閩南一臺灣淺灘漁場MN、粵西湛江一陽江海域YX、北部灣海域BBW4個尖頭斜齒鯊地理群體遺傳多樣性進(jìn)行分析,29個隨機(jī)引物在4個群體中共檢測出282個位點(diǎn)。4個群體各自檢測出的位點(diǎn)數(shù)分別為273、274、272、276,其中多態(tài)位點(diǎn)數(shù)分別為54、57、52、45,多態(tài)位點(diǎn)比例分別為1978%、2080%、1912%、1630%。SHANNON多樣性指數(shù)分別為0104、0107、0103、0090,表明尖頭斜齒鯊群體的遺傳多樣性水平較低。遺傳距離和UPGMA聚類分析結(jié)果顯示尖頭斜齒鯊的基因交流模式屬于距離隔離模式,遺傳差異大小與地理距離遠(yuǎn)近相關(guān)。分子方差分析AMOVA結(jié)果顯示群體間存在微弱但顯著的遺傳結(jié)構(gòu)差異FST0019,PO05,變異主要發(fā)生在群體內(nèi)部9806%?!?對中國南部沿海4個海域的尖頭斜齒鯊群體線粒體控制區(qū)序列多態(tài)性進(jìn)行研究,獲得長度為1064BP的線粒體控制區(qū)完整序列,經(jīng)過序列比對,發(fā)現(xiàn)了12個多態(tài)性核苷酸位點(diǎn),定義了19個單倍型。4個群體的單倍型多樣度JJO7829“08301、平均核苷酸差異K1314943““1492473和核苷酸多樣度石0001236“0001403均處于較低水平。分子方差分析AMOVA結(jié)果顯示群體間存在微弱但顯著的遺傳結(jié)構(gòu)差異FST002078,P005,變異主要發(fā)生在群體內(nèi)部9792%。遺傳距離分析顯示各群體問的遺傳差異大小與地理距離遠(yuǎn)近相關(guān)。系統(tǒng)地理學(xué)分析顯示祖先單倍型在各群體中的出現(xiàn)頻率相近,各海域群體都擁有各自獨(dú)特的單倍型分枝。北部灣群體的單倍型進(jìn)I主
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    • 簡介:首都師范大學(xué)碩士學(xué)位論文小麥種子蛋白的MALDITOFMS鑒定及其在遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用姓名張倩申請學(xué)位級別碩士專業(yè)遺傳學(xué)指導(dǎo)教師晏月明馬武軍20070510
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