富營(yíng)養(yǎng)化淺水湖泊聚球藍(lán)細(xì)菌屬群落結(jié)構(gòu)和基因多樣性研究.pdf

1、目錄目錄mm|AbstractI“ii.i研究背景1l.i.i湖泊富營(yíng)養(yǎng)化i1.1.2聚球藍(lán)細(xì)菌簡(jiǎn)介21.1.3聚球藍(lán)細(xì)菌的生態(tài)學(xué)意義31.1.3.1聚球藍(lán)細(xì)菌在微食物網(wǎng)（MicrobialFoodWebMFW)中重要的意義...31.1.3.2聚球藍(lán)細(xì)菌是海洋初級(jí)生產(chǎn)力的重要貢獻(xiàn)者31.1.4湖泊富營(yíng)養(yǎng)化與聚球藍(lán)細(xì)菌關(guān)系31.2聚球藍(lán)細(xì)菌基因多樣性的研究方法41.2.1聚球藍(lán)細(xì)菌研究方法進(jìn)展41.2.2聚球藍(lán)細(xì)菌

2、分子生態(tài)學(xué)研究方法51.2.3本研究主要釆用的分子生物學(xué)研究方法51.2.3.1末端限制酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析（TRFLP)51.2.3.2宏基因組學(xué)71.2.4其他分子生物學(xué)研究方法簡(jiǎn)介81.2.4.1單鏈構(gòu)象多態(tài)性（SSCP)81.2.4.2變形梯度凝膠電泳法（DGGE)81.2.4.3實(shí)時(shí)定量PCR(realtimePCR)91.2.4.4不同分子生物學(xué)方法的聯(lián)合運(yùn)用91.3采樣點(diǎn)的選擇和樣品的采集91.3.1

3、采樣點(diǎn)的選擇91.3.2樣品的釆集111.4本論文的主要研究?jī)?nèi)容、技術(shù)路線和研究意義121.4.1研究?jī)?nèi)容121.4.2研究意義12第二章TRFLP方法研究聚球藍(lán)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性132.1前言132.2材料與方法132.2.1基因組DNA提取132.2.2聚球藍(lán)細(xì)菌的TRFLP分析142.23統(tǒng)計(jì)分析162.2.3.1TRFIP數(shù)據(jù)分析處理162.2.3.2表征聚球藍(lán)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性的參數(shù)162.

4、2.3.3聚球藍(lán)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似性分析172.3TRFLP結(jié)果與分析172.3.1TRFLP結(jié)果172.3.1.1基因組DNA提取結(jié)果172.3.1.2PCR擴(kuò)增結(jié)果18a南京師范大學(xué)大學(xué)2012屆碩士研究生學(xué)位論文縮略語(yǔ)表Abbreviations:Ampampicillin氣辛青霧素Cy5indodicarbocyanine卩引哚二碳菁染料DGGEdenaturinggradientgelelectrophesis變性梯

5、度凝膠電泳DNAdesoxynucleicacid脫氧核糖核酸EMBLEuropeanMolecularBiologyLabaty歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù)IPTGisopropylthiopDgalactoside異丙基硫代P_D半乳糖昔ITS16S23SrRNA基因間隔序列NCBITheNationalCenterfBiotechnologyInfmation美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心〇TU—operationaltaxonom

6、icunit操作分類單位PGRpolymerasechainreaction聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RDA~redundancyanalysis冗余分析rDNAribsomaldesoxynucleicacid核糖體脫氧核糖核酸RDPII一RibosomalDatabaseProjectII核糖體數(shù)據(jù)庫(kù)IIrRNAribosomalRNA核糖體核糖核酸SSCP一singlestrconfmationpolymphism單鏈構(gòu)象多態(tài)個(gè)生TGGEte