南海海域11種常見笛鯛屬魚類的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)對(duì)笛鯛屬的11個(gè)習(xí)見種：勒氏笛鯛(Lutjanus.russellii)、紅鰭笛鯛(Lutjanus.erythropterus)、紫紅笛鯛(Lutjanus.argentimaculatus)、星點(diǎn)笛鯛(Lutjanus.stellatus)、約氏笛鯛(Lutjanus.johnii)、千年笛鯛(Lutjanus.sebae)、金帶笛鯛(Lutjanus.fulvus)、金焰笛鯛(Lutjanus.fu

2、lviflamma)、畫眉笛鯛(Lutjanus.vitta)、奧氏笛鯛(Lutjanus.ophuysenii)和馬拉巴笛鯛(Lutjanus.malabaricus)的mtDNA的CO I基因與核糖體DNA的ITS區(qū)全序列進(jìn)行了擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物純化后經(jīng)T載體連接進(jìn)行克隆、測(cè)序，序列結(jié)果對(duì)比拼接后提交GenBank并獲得序列登錄號(hào)(EU502667-EU502710)。CO I基因序列全長1551bp，A、T、G、C的含量平均為28.

3、7％、28.7％、19.0％和27.9％，AT含量稍高于GC含量，11種笛鯛中堿基組成差異不大。利用MEGA4.0軟件檢測(cè)到簡約信息位點(diǎn)(parsimony informative sites)371個(gè)，轉(zhuǎn)換和顛換比為2.0。Tamura-Nei平均遺傳距離為0.125。利用測(cè)得序列分別構(gòu)建了NJ和ME分子系統(tǒng)樹，選用諧魚(Emmelichtys truhsakeri GenBank登錄號(hào)AP004446)為外群，發(fā)現(xiàn)兩種方法構(gòu)建的系統(tǒng)

4、樹基本一致：畫眉笛鯛、奧氏笛鯛和金帶笛鯛聚為一支；馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛聚為一支；盒焰笛鯛、約氏笛鯛和勒氏笛鯛聚為一支；紫紅笛鯛和星點(diǎn)笛鯛聚為一支。種間關(guān)系在應(yīng)用這兩種方法分析時(shí)都得到了高于50％的支持率，其中馬拉巴笛鯛和紅鰭笛鯛有著最為緊密的親緣關(guān)系，奧氏笛鯛和畫眉笛鯛有著較為緊密的親緣關(guān)系。總體來看各個(gè)種之間均保持了一定的遺傳距離，沒有出現(xiàn)種間個(gè)體相互混雜的現(xiàn)象，這也說明了在南海海域的這11種笛鯛仍保持了自己的遺傳特性。對(duì)核

5、糖體DNA ITS區(qū)比對(duì)后發(fā)現(xiàn)各物種序列長度有一定差異，但是其堿基組成比例卻沒有很大的差別。A、T、G、C含量平均為17.0％、19.4％、30.3％和33.4％，GC含量遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過AT含量。經(jīng)過比對(duì)后發(fā)現(xiàn)變異位點(diǎn)753個(gè)，其中包括簡約信息位點(diǎn)620個(gè)。核酸轉(zhuǎn)換值和顛換值分別為140和221，轉(zhuǎn)換/顛換比值平均為0.6，這一比值遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于正常DNA序列的比值。根據(jù)Kimura-2雙參數(shù)和Jukes-Cantor單參數(shù)兩種模型計(jì)算的11種笛鯛