候選腫瘤抑制基因RASSF1A在鼻咽癌中的遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究.pdf

1、中山大學(xué)博士學(xué)位論文候選腫瘤抑制基因RASSFlA在鼻咽癌中的遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究GeneticandEpigeneticStudiesonCandidateTumorSuppressorGeneRASSFlAinNasopharyngealCarcinoma博士生：潘志剛導(dǎo)師：曾益新教授專業(yè)：腫瘤學(xué)2004年11月廣州妖選腫瘸抑制蛙肉RASSFIA辦鼻珥q癌中的遺傳學(xué)和表艦遺傳掌研究2個(gè)以上位點(diǎn)的改變，3例在RASSFlA基因僅發(fā)現(xiàn)

2、～個(gè)核苷酸位點(diǎn)的變異。在35個(gè)變異位點(diǎn)中，GCTl33TCT(AIal33Se0的改變?cè)?例組織和匹配外周血中檢測(cè)到，說明在此位點(diǎn)可能發(fā)生種系細(xì)胞的改變或是個(gè)少見的多態(tài)：其余的34個(gè)改變位點(diǎn)均只在萍響癌組織中發(fā)現(xiàn)，而在匹配的外周血樣本中沒有發(fā)現(xiàn)，洗明這些改變都為體細(xì)胞突變。在檢測(cè)到的35個(gè)突變中，3個(gè)為無義突變(即終止密碼子突變)，26個(gè)為錯(cuò)義突變，2個(gè)發(fā)生單堿基缺失造成移碼突變，其余的四個(gè)為同義突變(沉默突變)而不改變氨基酸序列。3個(gè)

3、無義突變分別位于密碼子145(CAG—TAG)、253(CAATAA)和293(TGG—TGA)，并且分布在3、l1和17號(hào)鼻咽癌組織標(biāo)本中。而2個(gè)發(fā)生單堿基缺失的移碼突變分別位于密碼予238(GACdeI(C))和294(GACdeI(G))，兩個(gè)突變卻分布在同一個(gè)鼻咽癌樣本(3號(hào)樣本)中。在35個(gè)不同位點(diǎn)的變異中，14個(gè)改變發(fā)生在外顯子2a口內(nèi)，lO個(gè)改變發(fā)生在RASSFIA的第四個(gè)外顯子內(nèi)，其余11個(gè)變異分別位于外顯子1n(1個(gè))

4、、外顯子3(4個(gè))、外顯子5(2個(gè))和外顯子6(4個(gè))中。其中43％(15／35)的突變發(fā)生在3個(gè)假定的功能結(jié)構(gòu)域中，DAG結(jié)構(gòu)域和RA結(jié)構(gòu)域中分別分布有七個(gè)不同的變異位點(diǎn)ATM結(jié)構(gòu)域中也有一個(gè)變異位點(diǎn)。在檢測(cè)到的35個(gè)變異中，密碼子117的錯(cuò)義突變(ACGll7GCG(ThrAla))發(fā)生頻率最高，為17，39／(4／23)，分別在四個(gè)不同的鼻咽癌組織樣本中檢測(cè)到有同樣的改變。而三個(gè)無義突變和兩個(gè)單堿基缺失造成的移碼突變，分別只在一個(gè)

5、鼻咽癌組織中檢測(cè)到，其突變頻率為435％(1／23)。在這些檢測(cè)到的突變中，除Alal33Ser變異有其它文獻(xiàn)報(bào)道外，細(xì)胞株的Leu279Val變異和其它的34個(gè)突變均沒有被報(bào)道過，這些突變?yōu)榈谝淮卧趶V東人群的鼻咽癌組織中新發(fā)現(xiàn)的突變。這些高頻的體細(xì)胞突變，提示突交是RASSFlA基因失活的原因之一，并可能參與了鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展。再利用甲基化特異性PCR(MSP)對(duì)23例散發(fā)性鼻咽癌組織進(jìn)行了RASSFlA基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島的甲基化檢