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1、PartIPartI生化名解生化名解1.肽單元(peptideunit):參與肽鍵的6個(gè)原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面Ca1和Ca2在平面上所處的位置為反式構(gòu)型,此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成了肽單元,它是蛋白質(zhì)分子構(gòu)象的結(jié)構(gòu)單元。Ca是兩個(gè)肽平面的連接點(diǎn),兩個(gè)肽平面可經(jīng)Ca的單鍵進(jìn)行旋轉(zhuǎn),N—Ca、Ca—C是單鍵,可自由旋轉(zhuǎn)。2.結(jié)構(gòu)域(domain):分子量大的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)??煞指畛?個(gè)和數(shù)個(gè)球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得
2、較為緊密,具有獨(dú)立的生物學(xué)功能,大多數(shù)結(jié)構(gòu)域含有序列上連續(xù)的100—200個(gè)氨基酸殘基,若用限制性蛋白酶水解,含多個(gè)結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)常分成數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)域,但各結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象基本不變。3.模體(motif):在許多蛋白質(zhì)分子中,二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象。一個(gè)模序總有其特征性的氨基酸序列,并發(fā)揮特殊功能,如鋅指結(jié)構(gòu)。4.蛋白質(zhì)變性(denaturation):在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象
3、被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú)序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失。主要發(fā)生二硫鍵與非共價(jià)鍵的破壞,不涉及一級(jí)結(jié)構(gòu)中氨基酸序列的改變,變性的蛋白質(zhì)易沉淀,沉淀的蛋白質(zhì)不一定變性。5.蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(isoelectricpointpI):當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,蛋白質(zhì)所帶的正負(fù)電荷相等,凈電荷為零,此時(shí)溶液的pH稱(chēng)為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。6.酶(enzyme):酶是一類(lèi)
4、對(duì)其特異底物具有高效催化作用的蛋白質(zhì)或核酸,通過(guò)降低反應(yīng)的活化能催化反應(yīng)進(jìn)行。酶的不同形式有單體酶,寡聚酶,多酶體系和多功能酶,酶的分子組成可分為單純酶和結(jié)合酶。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是通過(guò)降低活化能加快反應(yīng)的速度。(不考)7.酶的活性中心(activecenterofenzymes):酶分子中與酶活性密切相關(guān)的基團(tuán)在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能與底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。參與酶活性中心的必需基團(tuán)有結(jié)合底物,
5、使底物與酶形成一定構(gòu)象復(fù)合物的結(jié)合基團(tuán)和影響底物中某些化學(xué)鍵穩(wěn)定性,催化底物發(fā)生化學(xué)反應(yīng)并將其轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的催化基團(tuán)?;钚灾行耐膺€有維持酶活性中心應(yīng)有的空間構(gòu)象的必需基團(tuán)。8.酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulationofenzymes):一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆地結(jié)合,使構(gòu)象改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)方式稱(chēng)酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)。被調(diào)節(jié)的酶稱(chēng)為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶,使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱(chēng)為變構(gòu)效應(yīng)劑,包括
6、變構(gòu)激活劑和變構(gòu)抑制劑。9.酶的共價(jià)修飾(covalentmodificationofenzymes):在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)結(jié)合,從而改變酶的活性,此過(guò)程稱(chēng)為共價(jià)修飾。主要包括:磷酸化—去磷酸化;乙?;撘阴;?;甲基化—去甲基化;腺苷化—脫腺苷化;—SH與—S—S—互變等;磷酸化與脫磷酸是最常見(jiàn)的方式。10.酶原和酶原激活(zymogenzymogenactivation):有
7、些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)只是酶的無(wú)活性前體,必須在一定的條件下水解開(kāi)一個(gè)或幾個(gè)特定的肽鍵,使構(gòu)象發(fā)生改變,表現(xiàn)出酶的活性,此前體物質(zhì)稱(chēng)為酶原。由無(wú)活性的酶原向有活性酶轉(zhuǎn)化的過(guò)程稱(chēng)為酶原激活。酶原的激活,實(shí)際是酶的活性中心形成或暴露的過(guò)程。11.同工酶(isoenzymeisozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu),理化性質(zhì),以及免疫學(xué)性質(zhì)都不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。由同一基因或不同基因
8、編碼,同工酶存在于同一種屬或同一個(gè)體的不同組織或同一細(xì)磷酸二羥丙酮和FADH2。磷酸二羥丙酮可傳出線(xiàn)粒體外膜至胞液繼續(xù)進(jìn)行穿梭,而FADH2則進(jìn)入琥珀酸氧化呼吸鏈同時(shí)生成1.5molATP。(1、存在于腦和骨骼??;2、過(guò)程可用圖示;3、NADH被轉(zhuǎn)運(yùn)入線(xiàn)粒體進(jìn)行氧化磷酸化;4、最終生成1.5molATP)24.蘋(píng)果酸天冬氨酸穿梭(malateasparateshuttle):該穿梭機(jī)制存在于心肌和肝中,胞液中的NADH在蘋(píng)果酸脫氫酶的作
9、用下,使草酰乙酸還原生成蘋(píng)果酸,后者通過(guò)線(xiàn)粒體內(nèi)膜上的α酮戊二酸載體進(jìn)入線(xiàn)粒體,又在線(xiàn)粒體內(nèi)蘋(píng)果酸脫氫酶的作用下重新生成草酰乙酸和NADH。NADH進(jìn)入NADH氧化呼吸鏈,生成2.5molATP。線(xiàn)粒體內(nèi)的草酰乙酸經(jīng)谷草轉(zhuǎn)氨酶的作用生成天冬氨酸,后者經(jīng)酸性氨基酸載體轉(zhuǎn)運(yùn)出線(xiàn)粒體,再轉(zhuǎn)變成草酰乙酸,繼續(xù)進(jìn)行穿梭。(1、存在于肝和心??;2、過(guò)程可用圖示;3、NADH被轉(zhuǎn)運(yùn)入線(xiàn)粒體進(jìn)行氧化磷酸化;4、最終生成2.5molATP)25.一碳單位
10、(onecarbonunit):某些氨基酸代謝過(guò)程中產(chǎn)生的只含有一個(gè)碳原子的基團(tuán)稱(chēng)為一碳單位,其代謝的輔基是四氫葉酸。一碳單位參與嘌呤、胸腺嘧啶的合成,主要的一碳單位有甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基和亞氨甲基,一碳單位主要來(lái)自絲氨酸,甘氨酸,組氨酸及色氨酸的分解代謝。26.甲硫氨酸循環(huán)(methioninecycle):甲硫氨酸和ATP作用轉(zhuǎn)變成S腺苷甲硫氨酸(SAM),SAM是甲基的直接供體,參與許多甲基化反應(yīng),與此同時(shí)產(chǎn)生S腺苷同型半
11、胱氨酸進(jìn)一步轉(zhuǎn)變成同型半胱氨酸,后者可接受N5—CH3—FH4的甲基重新生成甲硫氨酸,形成一個(gè)循環(huán)過(guò)程稱(chēng)作甲硫氨酸循環(huán)。其生理意義是:①SAM提供甲基以進(jìn)行體內(nèi)廣泛存在的甲基化反應(yīng);②N5—CH3—FH4提供甲基合成甲硫氨酸,同時(shí)使N5—CH3—FH4的FH4釋放,再參與一碳單位的代謝。27.聯(lián)合脫氨基作用(transdeamination):兩種脫氨基方式的聯(lián)合作用,使氨基酸脫下α氨基生成α酮酸的過(guò)程,包括轉(zhuǎn)氨基偶聯(lián)氧化脫氨基作用和轉(zhuǎn)
12、氨基偶聯(lián)嘌呤核苷酸循環(huán),既是氨基酸脫氨基的主要方式,也是體內(nèi)合成非必需氨基酸的重要方式。28.嘌呤核苷酸循環(huán)(purinenucleotidecycle):骨骼肌和心肌主要通過(guò)嘌呤核苷酸循環(huán)進(jìn)行脫氨基作用。氨基酸首先通過(guò)連續(xù)的轉(zhuǎn)氨基作用將氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移給草酰乙酸,生成天冬氨酸;天冬氨酸與次黃嘌呤核苷酸生成腺苷酸代琥珀酸,經(jīng)裂解生成AMP,AMP在腺苷酸脫氫酶催化下脫去氨基。由此可見(jiàn),嘌呤核苷酸循環(huán)實(shí)際上也可以看成是另一種形式的聯(lián)合脫氨
13、基作用。29.變構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation):小分子化合物與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性,這種調(diào)節(jié)稱(chēng)為酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)或別構(gòu)調(diào)節(jié)。被調(diào)節(jié)的酶稱(chēng)為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶,使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱(chēng)為變構(gòu)效應(yīng)劑,包括變構(gòu)激活劑和變構(gòu)抑制劑。30.化學(xué)修飾調(diào)節(jié):(chemicalmodification)酶蛋白肽鏈上某些殘基在酶的催化下發(fā)生可逆的共價(jià)修飾,從而引起酶活性改變,這種調(diào)節(jié)
14、稱(chēng)為酶的化學(xué)修飾。主要包括:磷酸化—去磷酸化;乙酰化—脫乙?;患谆ゼ谆?;腺苷化—脫腺苷化;—SH與—S—S—互變等;磷酸化與脫磷酸是最常見(jiàn)的方式。31.變構(gòu)酶(allostericenzyme):指代謝途徑中參與變構(gòu)調(diào)節(jié)的關(guān)鍵酶稱(chēng)為變構(gòu)酶,變構(gòu)酶常為多個(gè)亞基構(gòu)成的寡聚體,有催化亞基含結(jié)合底物催化反應(yīng)的活化中心及調(diào)節(jié)亞基含與變構(gòu)效應(yīng)劑結(jié)合引起調(diào)節(jié)作用的調(diào)節(jié)部位,對(duì)酶催化活性調(diào)節(jié)的方式稱(chēng)為變構(gòu)效應(yīng),具有協(xié)同效應(yīng)。32.變構(gòu)效應(yīng)劑(
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