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1、數(shù)據(jù)挖掘聚類問題(Plants Data Set)實驗報告1. 1.數(shù)據(jù)源描述 數(shù)據(jù)源描述1.1 1.1 數(shù)據(jù)特征 數(shù)據(jù)特征本實驗用到的是關(guān)于植物信息的數(shù)據(jù)集,其中包含了每一種植物(種類和科屬)以及它們生長的地區(qū)。數(shù)據(jù)集中總共有 68 個地區(qū),主要分布在美國和加拿大。一條數(shù)據(jù)(對應(yīng)于文件中的一行)包含一種植物(或者某一科屬)及其在上述 68 個地區(qū)中的分布情況??梢赃@樣理解,該數(shù)據(jù)集中每一條數(shù)據(jù)包含兩部分內(nèi)容,如下圖所示。圖 1 數(shù)據(jù)格
2、式例如一條數(shù)據(jù):abronia fragrans,az,co,ks,mt,ne,nm,nd,ok,sd,tx,ut,wa,wy。其中 abronia fragrans 是植物名稱(abronia 是科屬,fragrans 是名稱),從 az 一直到 wy 是該植物的分布區(qū)域,采用縮寫形式表示,如 az 代表的是美國 Arizona 州。植物名稱和分布地區(qū)用逗號隔開,各地區(qū)之間也用逗號隔開。1.2 1.2 任務(wù)要求 任務(wù)要求聚類。采用聚類
3、算法根據(jù)某種特征對所給數(shù)據(jù)集進行聚類分析,對于聚類形成的簇要使得簇內(nèi)數(shù)據(jù)對象之間的差異盡可能小,簇之間的差距盡可能大。2. 2.數(shù)據(jù)預(yù)處理 數(shù)據(jù)預(yù)處理2.1 2.1 數(shù)據(jù)清理 數(shù)據(jù)清理所給數(shù)據(jù)集中包含一些對聚類過程無用的冗余數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)集中全部數(shù)據(jù)的組織結(jié)構(gòu)是:先給出某一科屬的植物及其所有分布地區(qū),然后給出該科屬下的具體植物及其分布地區(qū)。例如:?abelmoschus,ct,dc,fl,hi,il,ky,la,md,mi,ms,nc,sc
4、,va,pr,vi?abelmoschus esculentus,ct,dc,fl,il,ky,la,md,mi,ms,nc,sc,va,pr,vi?abelmoschus moschatus,hi,pr上述數(shù)據(jù)中第?行給出了所有屬于 abelmoschus 這一科屬的植物的分布地區(qū),接下來的??兩行分別列出了屬于 abelmoschus 科屬的兩種具體植物及其分布地區(qū)。從中可以看出后兩行給出的所有地區(qū)的并集正是第一行給出的地區(qū)植物名稱
5、 植物名稱(科屬 科屬+名稱 名稱) 分布區(qū)域 分布區(qū)域}} elsethis.isFileExit = false;return raw_dataSet;}// getRaw_DataSet,從本地 txt 文件獲取數(shù)據(jù)集public ArrayList getFinished_DataSet() {// 獲取經(jīng)過預(yù)處理,用來進行聚類的數(shù)據(jù)ArrayList finished_DataSet = new ArrayList()
6、;ArrayList temp_DataSet = this.getRaw_DataSet();for (int i = 0; i eachRomItem = null;eachRomItem = this.spilt(temp_DataSet.get(i), ',');// 除去“,“后的每一行數(shù)據(jù)DataItem data_Item = new DataItem(eachRomItem, true);fin
7、ished_DataSet.add(data_Item);}// forreturn finished_DataSet;}public boolean isRightData(String data) {// 篩選出合適的數(shù)據(jù)ArrayList tempArrayList = new ArrayList();tempArrayList = spilt(data, ' ');if (tempArrayList.size()
8、 spilt(String str, char ch) {ArrayList words = new ArrayList();// 用來存放找到的單詞int beginIndex = 0;for (int i = 0; i < str.length(); i++) {if (str.charAt(i) != ch) {if (i != str.length() - 1)continue;else {words.add(str.s
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