RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測.pdf

1、RNA-蛋白質(zhì)相互作用在許多生命活動中有著至關(guān)重要的作用，如基因調(diào)控，RNA剪切和蛋白質(zhì)合成。高精度的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)能夠幫助深入的理解這些生命過程。但是，實驗方法來解析RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)十分繁瑣，而且需要耗費大量的時間和金錢。因此，通過理論的方法來預(yù)測RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)就變得尤為重要。目前，基于理論的RNA-蛋白質(zhì)預(yù)測方法還比較少。針對上述問題，提出了一套RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法3dRPC，其中包括RNA

2、-蛋白質(zhì)對接方法RPDOCK和RNA-蛋白質(zhì)打分方法DECK-RP。
　　本文的主要內(nèi)容如下：
　　1，RNA-蛋白質(zhì)對接方法的研究。本文提出了一個基于快速傅里葉變換的RNA-蛋白質(zhì)對接方法RPDOCK。在對接中充分考慮了RNA-蛋白質(zhì)相互作用的幾個特征：首先，RNA-蛋白質(zhì)相互作用界面與蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用界面在原子堆積上不同；其次，靜電在RNA-蛋白質(zhì)相互作用中有非常重要的作用；最后，堿基和芳香族側(cè)鏈之間的堆積效應(yīng)在R