對不同的G四聯(lián)體的可折疊原理的理論研究.pdf

1、DNA的G四聯(lián)體結構是一種核酸的非經典二級結構，它被發(fā)現(xiàn)與上世紀六十年代，但是有關G四聯(lián)體的研究興起于上世紀九十年代后。很多研究證明發(fā)現(xiàn)，G四聯(lián)體存在于生物體內的DNA和RNA中，具有很大的重要生物學的意義。由于科學技術的不斷提高，許多生物大分子模擬的方法被大量研發(fā)了出來，其中利用最為廣泛的模擬方法是分子動力學模擬。但是在本文中為了計算的便捷，本文采用了全原子Go模型進行分子動力學的模擬實驗。
　　DNA的G四聯(lián)體折疊的研究在最近

2、幾年中有了很大的發(fā)展，研究折疊原理的主要問題是研究G四聯(lián)體的折疊機制。文章介紹的全原子Go模型是一個先進的粒子模型研究體系，因為本文研究的是不同的DNA的G四聯(lián)體的折疊，在人體的端粒序列中，通過鳥嘌呤堆積起來的G四聯(lián)體是一個很有希望的抗癌的目標。在本文的研究中，使用的是以能量為背景的折疊原理來說明凝血酶適體和兩種人工的DNA的G四聯(lián)體的折疊過程的原理。本文通過三種DNA的折疊過程的圖像研究，在恒定的溫度狀態(tài)下，通過不同時間段的折疊過程，

3、在折疊態(tài)、變性態(tài)和過渡態(tài)產生不同的能量圖像，然后進行分析研究。本文運用全原子Go模型對三種不同的G四聯(lián)體進行理論分析計算，產生自由能圖像后，對均方根偏差、徑向分布函數(shù)、距離以及相對接觸距離和兩個G三聯(lián)體自然接觸函數(shù)圖進行了分析與比較。得到的圖像與實驗的研究相差不是很大，比較符合實際。
　　雖然本文運用的全原子Go模型進行研究后得到的成果比較符合實際，但是通過和實驗所產生的數(shù)據(jù)相比還是有一定的差距，全原子Go模型的運用和研究與其他的