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文檔簡介
1、淀粉纖維在退行性疾病中扮演著重要的角色,包括老年癡呆癥,II型糖尿病,海綿狀腦組織病,以及阮病毒引起的疾病等。相關蛋白的錯誤折疊將導致淀粉纖維。而目前關于這些纖維的形成機制仍然不是非常清楚。
本論文利用分子動力學模擬(MD)手段分析了八類六肽的六聚體的穩(wěn)定性,尋找淀粉纖維聚集的關鍵因素。MD的結果顯示,八類六聚體中VEALYL和MVGGVV-1的穩(wěn)定性是最高的,然后是SNQNNY,以及LYQLEN, MVGGVV-2, VQI
2、VYK, SSTSAA, GGVVIA。統(tǒng)計學數據顯示,疏水性氨基酸殘基對于穩(wěn)定六聚體內部zipper結構起著重要的作用。MVGGVV-1的單點突變和雙突變實驗發(fā)現1號Met與2號Val是重要的疏水殘基,這與之前的統(tǒng)計分析的結果是一致的。MVGGVV-1的各種低聚體的穩(wěn)定性分析表明,其成纖維的中間狀態(tài)結構可能是三聚體(3-0)或者四聚體(2-2)的形式。
我們還對比較穩(wěn)定的VEALYL進行了單點突變和雙突變實驗研究,證實了一號
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