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文檔簡介
1、大腸埃氏菌(Escherichia coli)是一種常見的革蘭氏陰性菌。某些特別的血清型的大腸桿菌具有致病性。大腸桿菌主要的表面多糖結(jié)構(gòu)包括 O抗原與 K抗原,它們是大腸桿菌血清分型的基礎(chǔ)。目前,大腸桿菌所具有的180多種 O抗原基因決定簇已經(jīng)接近全部被破譯；而80種 K抗原基因決定簇的破譯工作遠尚未完全完成。本文對14種 K血清型的大腸桿菌菌株進行二代高通量測序，通過生物信息學方法成功破譯了它們的 K抗原基因決定簇。大腸桿菌 K抗原基
2、因決定簇主要可以分為四種類型(I、II、II、IV),其中 I型和 IV型的基因簇位于 galF與 gnd之間,通過 wzx/wzy通徑合成 K抗原；而 II型和 III型基因簇兩端沒有保守基因,通過 ABC-transporter通徑合成 K抗原。基因簇內(nèi)的基因主要分為三種,寡糖單位處理基因、單糖合成基因、糖基轉(zhuǎn)移酶基因。其中寡糖單位處理基因(wzx、wzy)與糖基轉(zhuǎn)移酶基因的特異性較強,是特異性探針設(shè)計的候選基因。特異性探針和引物設(shè)
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