豹貓種群遺傳結構及地理分化研究.pdf

1、豹貓(Prionailurusbengalensis)是世界分布廣泛的瀕危物種之一，分布于孟加拉、印度和泰國的指名亞種(P.b.bengnnesis)種群被《瀕危野生動植物種國際貿(mào)易公約》(ConventionsonInternationalTradeofEndageredSpeciesofWildFaunaandFlora，CITES)列為附錄Ⅰ物種，其余各地種群均被列為附錄Ⅱ物種。中國瀕危動物紅皮書將其列為易危種。為探討豹貓種群的遺

2、傳結構與地理分布的關系，本研究對豹貓的線粒體細胞色素b基因和控制區(qū)序列進行了分析。獲得了來自5個地區(qū)的25只豹貓的線粒體細胞色素b基因全序列，均長1140bp。分為12個單倍型，共有24個位點呈現(xiàn)變異，其中12個簡約信息位點。4個A-G轉換，20個T-C轉換，沒有顛換發(fā)生，表現(xiàn)出高的轉換偏倚。沒有缺失或插入。單倍型間的序列差異為0.09％～0.89％，種群間核苷酸歧異度Dxy為0.94％～7.64％。 另獲得了41只豹貓的線粒體

3、DNA控制區(qū)全序列，發(fā)現(xiàn)該序列具有長度多態(tài)性，大小1493～1630bp。整個控制區(qū)序列中存在2個重復序列，5'端重復序列為80～82bp的2～4個串聯(lián)重復；3'端重復序列為8bp(TACACGTA或CACACGTA)的33～43個串聯(lián)重復。各保留第一個重復單元后序列分析顯示，共存在37種單倍型，具有168個多態(tài)性核苷酸位點，簡約信息位點104個。117個轉換和45個顛換，6個插入/缺失。南北種群特異變異點10個。單倍型多態(tài)性Hd為0.

4、9905，核苷酸多樣性π為0.0255，核苷酸差異平均數(shù)k為28.647。黑龍江種群與南方各種群間的核苷酸歧異度Dxy介于2.524％～2.768％之間。 綜合分析不同地理種群的兩組DNA數(shù)據(jù)，結果顯示，所研究5個地理區(qū)域的豹貓先分為2個進化支，正好分別對應于南北兩大種群。南方種群內部又分為兩支。北方種群與南方各種群分化顯著，但序列差異分析顯示還沒有達到種的分化水平。北方種群同南方各種群之間沒有基因流，出現(xiàn)了地理隔離。南方各種群