脊椎動物Hoxall基因進化分析與研究.pdf

1、浙江大學(xué)博士學(xué)位論文脊椎動物Hoxall基因進化分析與研究姓名：薛良義申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：細(xì)胞生物學(xué)指導(dǎo)教師：錢凱先20060401基因的編碼序列與非編碼序列的內(nèi)含子是獨立進化的。使用Z檢驗和Fisher精確檢驗法，都證明Hoxall基因編碼區(qū)存在達爾文正選擇，而且這種選擇已經(jīng)導(dǎo)致Hoxall蛋白在N端序列出現(xiàn)較大的變化。根據(jù)ClustalW排列，Hoxall可分為三個部分：N端保守區(qū)、C端保守區(qū)和中間可變區(qū)。在N端保守區(qū)和C端保守

2、區(qū)，不同動物間氨基酸序列的相似性程度非常高，且氨基酸數(shù)量從鯊魚到人幾乎相等；而在可變區(qū)，不同動物間氨基酸的數(shù)目差異較大，相似性程度非常低。因此，不同區(qū)段氨基酸序列的進化模式是不一樣的。首次發(fā)現(xiàn)在鱸形總目魚類中，Hoxall可變區(qū)內(nèi)存在緊密相連的丙氨酸同聚物和組氨酸同聚物。Hoxall蛋白疏水性分析結(jié)果表明所有動物Hoxall蛋白都存在一個非常明顯的親水區(qū)，且位置相對穩(wěn)定，包含可變區(qū)的大部分和C端保守區(qū)的一小部分。在該親水區(qū)內(nèi)，隨著動物分