半紅樹植物黃槿的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究.pdf

1、中山大學(xué)博士學(xué)位論文半紅樹植物黃槿的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究姓名：唐恬申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：植物學(xué)指導(dǎo)教師：施蘇華20040529中山大學(xué)博士學(xué)位論文半缸樹植物黃槿的遺傳多樣性廈遺傳結(jié)構(gòu)研究唐恬不相關(guān)(，=0117，P=0683)。利用m”問接估計(jì)的基因流中等(Nm=1395)。通過漂流的種子導(dǎo)致的長(zhǎng)距離基因流和當(dāng)?shù)剡m應(yīng)對(duì)觀察到的遺傳多樣性及結(jié)構(gòu)起到重要作用。利用RNaseH基因特定的簡(jiǎn)并引物擴(kuò)增并克隆了黃槿基因組中黟J—copia類

2、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的RNaseHLTR區(qū)域。三個(gè)黟J—copia元件被用于對(duì)上述8個(gè)黃槿種群的SSAP分析。對(duì)轉(zhuǎn)座子插入位點(diǎn)檢測(cè)到高水平的遺傳變異，表明反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子在黃槿基因組中曾有頻繁的活動(dòng)。紅樹林種群較陸生種群表現(xiàn)出更高的插入多態(tài)性，可能暗示環(huán)境壓力會(huì)激活反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。AMOVA表明總遺傳變異中有886％是由生境分化造成，僅4。86％是由采樣點(diǎn)間地理差異造成。紅樹林種群間的遺傳分化(msT；o115)小于陸生種群間分化(msT=O152)

3、，表明紅樹林種群間通過漂浮的種子所進(jìn)行的基因交流比陸生種群更頻繁。與AFLP標(biāo)記相比，SSAP標(biāo)記的多態(tài)帶百分率和對(duì)個(gè)體的分辨率更高，表明以轉(zhuǎn)座子為基礎(chǔ)的分子標(biāo)記在基因型分析中有巨大的應(yīng)用潛力。AFLP也被用于分析印度洋一西太平洋地區(qū)35個(gè)黃槿種群的遺傳結(jié)構(gòu)。4對(duì)引物對(duì)所有450個(gè)個(gè)體擴(kuò)增出185條帶(150475bp)，其中多態(tài)性條帶數(shù)為178(9622％)?；贏FLP變化，黃槿基因組的核苷酸多樣性為O03247。不同種群的核苷酸多

4、樣性水平變化很大，但總的說來，馬來半島的種群核苷酸多樣性水平最高，而琉球群島的種群核苷酸多樣性水平最低。大多數(shù)種群兩兩間遺傳分化水平低，表明種子通過洋流有著顯著的長(zhǎng)距離傳播。Ranong和Lu—un這兩個(gè)泰國西海岸的種群與澳大利亞而不是泰國其他種群間有更近的親緣關(guān)系，這可能是由更新世時(shí)的地理隔離造成的。AMOVA分析表明琉球群島和中國的種群間存在顯著的遺傳分化(0竹=0140，P0001)而臺(tái)灣島中國大陸種群間分化不顯著(dbcr=O0