金藻類部分類群的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、　　金藻因為營養(yǎng)價值豐富和能形成赤潮或水華,而廣受學(xué)術(shù)界和政府部門的關(guān)注。目前我國的金藻分類一直沿用20世紀70~80年代的分類標準,以形態(tài)特征為主。由于傳統(tǒng)的分類方法的局限,金藻分類系統(tǒng)較混亂。為此,本論文對我國常見的包括等鞭金藻屬、棕囊藻屬和巴夫藻屬在內(nèi)的8株金藻的18S rRNA基因序列進行了測定,并對相關(guān)屬種進行了系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的分析。
　　首先,就玻璃粉法、CTAB法、PVP法和高鹽法4種DNA提取方法對棕囊藻和綠色巴夫藻

2、的DNA提取進行了比較研究。結(jié)果顯示,對于次生物質(zhì)含量較多的棕囊藻而言,玻璃粉法是4種方法中最好的DNA提取方法。對于無細胞壁的綠色巴夫藻而言,高鹽法較好。
　　其次,利用NJ法構(gòu)建了包括等鞭金藻屬、棕囊藻屬和巴夫藻屬在內(nèi)的48株金藻的18S rRNA基因序列的系統(tǒng)樹。結(jié)果顯示,金藻類分為3個大的分支：(1) 巴夫藻屬；(2) 棕囊藻屬；(3) 定鞭金藻屬、顆石藻屬和等鞭金藻屬共同組成一支。在球等鞭金藻和顆石藻屬形成的Clade

3、2支上,大溪地金藻、3011、8701和湛江等鞭金藻與球等鞭金藻聚類；ST2單獨形成一支。在巴夫藻屬支上,金藻J1處于Pa.gyrans分支內(nèi)；綠色巴夫藻與Pa.virescens和Pa.lutheri聚類成一支。棕囊藻屬由5個小分支組成：P.pouchetii、P.antarctica、P.globosa、P.cordata、P.jahnii,P2位于P.globosa分支內(nèi)。結(jié)論：1、支持金藻類分巴夫藻綱和定鞭金藻綱兩個綱,同時支持

4、建立棕囊藻目。2、ST2可能為獨立于球等鞭金藻之外的一個新種,甚至新屬；大溪地金藻、3011、8701和湛江等鞭金藻同屬于等鞭金藻屬,與球等鞭金藻親緣關(guān)系較近。3、P2應(yīng)為P.globosa。4、金藻J1應(yīng)為Pa.gyrans：綠色巴夫藻與Pa.virescens和Pa.lutheri的親緣關(guān)系較近。
　　最后,對棕囊藻P2和南極棕囊藻psaA和psbA基因序列和RNA二級結(jié)構(gòu)進行了對比分析。結(jié)果顯示,兩個基因的RNA二級結(jié)構(gòu)能夠