東亞部分馬群體線粒體Cytb基因序列及分子系統(tǒng)學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文通過對馬的線粒體細胞色素b(cytb)基因全序列的遺傳變異分析,來探討中國家馬8個群體、普氏野馬、韓國cheju馬和日本家馬之間的親緣關(guān)系和遺傳多樣性。 運用分子生物學軟件分析本研究測定蒙古馬、普氏野馬A系和B系線粒體cytb基因全序列和從Genbank中獲得的9個群體37條序列,總共12個群體的DNA多態(tài)性,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。Cytb基因序列變異分析表明:1)馬的cytb基因全序列長度一致為1,140bp,無插入和缺失;2

2、)Cytb全序列含52個核苷酸變異位點,33個簡約信息位點,其中處于密碼子第三位的變異最大,第一位和第二位堿基的變異相對較?。?)Cytb基因全序列中堿基組成富含A,T,A+T含量為54.6﹪,且第二位點A,T偏向性更加明顯,達到61.5﹪。所有群體在第三位點上堿基G的含量極少,平均僅為5.2﹪,且在種間表現(xiàn)出4.7﹪~5.5﹪的差異。Cytb基因在密碼子使用上具有明顯的偏向性。4)核苷酸轉(zhuǎn)換遠遠高于顛換(轉(zhuǎn)換/顛換=14.2),轉(zhuǎn)換主

3、要為C→T、T→C、A→G、G→A,顛換很少發(fā)生,堿基替換大都發(fā)生在密碼子第三位,基因序列中的轉(zhuǎn)換與顛換都未飽和;5)按照cytb蛋白結(jié)構(gòu)模型,cytb基因全序列可分為三個功能區(qū),核苷酸變異多發(fā)生在跨膜區(qū)。Cytb基因的3'末端比5'末端攜帶有更多的系統(tǒng)學信息。對東亞的12個馬群體進行系統(tǒng)發(fā)育分析,使用3種常用的建樹方法NJ法、UPGMA法和MP法,所構(gòu)建的分子樹的拓撲結(jié)構(gòu)基本一致。分析表明:1)中國家馬具有多個起源或經(jīng)過多次馴化。2)

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