大倉鼠（Tscherskia triton）種群年際遺傳變異與生態(tài)適應(yīng)研究.pdf

1、以福爾馬林浸泡保存的1984～1988年間大倉鼠肝臟標(biāo)本為實(shí)驗(yàn)材料，通過SNPs檢測(cè)研究大倉鼠不同年際季節(jié)種群間遺傳多樣性的變化規(guī)律。通過優(yōu)化標(biāo)本基因組總DNA的提取方法，獲得高質(zhì)量的足以滿足后續(xù)分子實(shí)驗(yàn)要求的基因組DNA。選取大倉鼠、黑線倉鼠、原倉鼠的2l對(duì)微衛(wèi)星引物及自行設(shè)計(jì)的52對(duì)引物分別對(duì)1984～1988春、秋季個(gè)體進(jìn)行擴(kuò)增，反復(fù)實(shí)驗(yàn)最終從72對(duì)引物中篩選出擴(kuò)增穩(wěn)定、效率高、重復(fù)性好、多態(tài)性豐富的6對(duì)引物對(duì)1984～1988春

2、秋季節(jié)共10個(gè)種群進(jìn)行擴(kuò)增，并回收目的條帶，克隆測(cè)序后進(jìn)行SNPs分析。DAMBE軟件比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)10個(gè)種群中均存在不同數(shù)目的多態(tài)位點(diǎn)，其中又以86、85年較高，88年最低，而且檢測(cè)到的多態(tài)位點(diǎn)多為轉(zhuǎn)換，6對(duì)引物在10個(gè)種群中僅檢測(cè)到一個(gè)缺失，沒有插入發(fā)生，轉(zhuǎn)換：顛換≥2:1。利用DNASP4.10軟件統(tǒng)計(jì)分析種群內(nèi)的核苷酸多樣性(Pi)、單倍型多樣性(Hd)及種群間核苷酸歧異度(Dxy)和種群間分化數(shù)(Fst)。并采用MEGA3.10

3、對(duì)10個(gè)種群進(jìn)行LJPGMA聚類分析。綜合6對(duì)引物的數(shù)據(jù)分析結(jié)果，發(fā)現(xiàn)1984～1988年間，遺傳多樣性由高至低依次排列為：86春>86秋>85春>84春>85秋>84秋>87春>87秋>88春>88秋。UPGMA聚類分析結(jié)果表明86、87、88年春秋季節(jié)種群及85年秋季種群遺傳距離相對(duì)較近，而與84春秋、85年春季種群相對(duì)較遠(yuǎn)。綜合實(shí)驗(yàn)結(jié)果結(jié)論如下: 1福爾馬林浸泡標(biāo)本DNA提取的優(yōu)化。經(jīng)過反復(fù)實(shí)驗(yàn)，針對(duì)本實(shí)驗(yàn)室研究提出的由福

4、爾馬林浸泡標(biāo)本組織中提取DNA的方法加以優(yōu)化，從而進(jìn)一步提高了提取DNA的質(zhì)量及數(shù)量。 2篩選出6對(duì)能夠在擴(kuò)增大倉鼠種群中穩(wěn)定擴(kuò)增的引物，其中5對(duì)為自行設(shè)計(jì)引物，擴(kuò)增條帶均單一、明亮，擴(kuò)增效率高、重復(fù)性好、多態(tài)性豐富。 3大倉鼠種群的生態(tài)適應(yīng)及調(diào)節(jié)機(jī)制。 (1)春季種群的遺傳多態(tài)性高于秋季，進(jìn)一步驗(yàn)證了“增殖一擴(kuò)散平衡說”。該學(xué)說認(rèn)為在繁殖期，由于新生個(gè)體不斷產(chǎn)生，在一定取樣范圍內(nèi)，個(gè)體間具有較近的親緣關(guān)系，故群