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文檔簡介
1、南開大學碩士學位論文基因表達數(shù)據(jù)中的聚類技術研究姓名:葛建業(yè)申請學位級別:碩士專業(yè):計算機軟件及理論指導教師:黃亞樓2002.5.28AbstractTheInventionofGeneChipsallowsUStostudysimultaneousvariationsofgenesatthegenome—widescaleAtypicalgeneexpressiondatasetconsistsofthousandsoreventen
2、softhousandsofgenes,andafewdozensexperimentsWiththeexplosionofthegeneexpressiondata,howtousetheanalysistechnologiesincomputersciencetoanalysisthedataanddiscoveryusefulandinstructiveknowledgeforbiologicalexperimentisattra
3、ctingmoreandmoreattentionsforthebioinformaticiansKDDisthetechnologyofextractingpreviouslyunknownandpotentiallyusefulinformationfromlargesetsofdataAndithasrepresentedgreatpotentialinanalyzingbiologicaldataDuetotherelative
4、lyfewofknownfunctiongene,modelingisnotagoodmethodSo,clusteranalysisisthepreferredmethodtoanalysisthegeneexpressiondataClusteranalysisistheartoffindinggroupsinagivendatasetsuchthatdbjectsinthesamegrouparesimilartoeachothe
5、rwhileobjectsindifferentgroupsaredissimilarThisthesismainlyinvestigatesometraditionalclusteringalgorithms,suchasK—Means,HierachicalClusteringSelfOrganizingMapsAndtheCURE,whichhassuccessfulapplicationinotherfields,hasalso
6、beenimportedtoanalysisthegeneexpressiondataAllofthealgorithmshavegotthesatisfactoryresultsInthisthesistheapplicationofKDDinanalyzingotherbiologicaldataisalsointroducedMoreover,thebioinformaticsprototypesystemBIMiner,whic
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