基于雙聚類方法分析基因表達數(shù)據(jù)的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、天津師范大學碩士學位論文分類編號:——密級:——單位代碼:巡學號“—13100—90007又滓?guī)熫么髊研究生學位論文論文題目:基王塑塞婁左法盆撫基國麥達數(shù)據(jù)的砑宜學生姓名:寶馥雁申請學位級別:亟申請專業(yè)名稱:讓箕扭應用技本研究方向:生物信息堂指導教師姓名:韭塵強專業(yè)技術(shù)職稱:教援提交論文日期:2Q!墨生曼月天津師范大學碩士學位論文隨著人類基因組計劃的進展,對于基因的功能和基因組內(nèi)各基因的研究逐步深入,研究基因在不同時間和條件下的表達情況

2、,是認識基因功能的一個主要途徑。為了確定某個基因的功能。我們需要捕捉基因表達過程,這個過程描述了遺傳信息如何通過轉(zhuǎn)錄和翻譯轉(zhuǎn)換成為功能基因產(chǎn)品。功能基因組學是通過采用微陣列技術(shù),測試某種條件和環(huán)境的限制下的基因表達水平,在近幾年的科研領(lǐng)域,微陣列技術(shù)已經(jīng)成為生物研究的主要手段。因此,相應的數(shù)據(jù)分析成為生物信息學的重要工作之一,于是產(chǎn)生了許多探究性統(tǒng)計方向,包括雙聚類算法。在生物信息學這一領(lǐng)域中,一個很關(guān)鍵的問題就是對基因表達數(shù)據(jù)進行雙向

3、聚類,將基因通過在多種不同實驗環(huán)境下的表達數(shù)據(jù)進行雙向的聚類,能夠分析和識別同一類基因所共同具備的基因功能和轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件。本文通過對傳統(tǒng)的聚類方法的闡述,將雙聚類的基本原理作為線索,對其研究現(xiàn)狀進行了完整系統(tǒng)的介紹,并且提出了一種新的算法一一ICQUBIC(InformationContentQUBIC),本算法是在QUBIC算法的基礎(chǔ)上進行了改進,引入“信息量”來計算基因表達數(shù)據(jù)矩陣的某一行或某一列的一致性,以期使其聚類效果更佳。關(guān)鍵

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