基于樸素貝葉斯的piRNA識別問題研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、piRNA的識別是目前生物信息學領域研究的熱點問題之一。piRNA，又稱Piwi-interacting RNA是一類重要的非編碼小RNA，其長度大約是25到32個核苷酸，可以和Piwi蛋白結(jié)合形成piRNA復合物，并且與RNA沉默作有關。目前對于非編碼RNA的研究工作主要分為兩個方面，一是大規(guī)模非編碼RNA的鑒定，主要借助于計算機，從已有的非編碼RNA中提取特征信息，然后將特征信息進行全基因組尺度的識別;二是采用基因組學和實驗方法研究

2、非編碼RNA的功能。本文以人類、小鼠、大鼠、果蠅等模式生物作為研究對象，通過搜集現(xiàn)有經(jīng)實驗驗證的piRNA序列構(gòu)建訓練集合，分別構(gòu)建了基于核苷酸組分和物理化學性質(zhì)分類的多種特征表示模型，并采用樸素貝葉斯分類器結(jié)合5輪交叉檢驗的方法進行預測。最后對各種模型的預測結(jié)果進行了比較。結(jié)果表明k-mer頻率結(jié)合核苷酸分類的特征組合模型得到了較好的預測性能，總準確度達到82％多，高于k-mer頻率等的特征模型。
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