醫(yī)療數(shù)據(jù)挖掘在疾病早期預(yù)警中的關(guān)鍵技術(shù)研究.pdf

1、隨著醫(yī)院信息系統(tǒng)(HospitalInformationSystem,HIS)的發(fā)展，臨床數(shù)據(jù)庫已經(jīng)積累了大量的關(guān)于患者的醫(yī)療診斷的信息。如何發(fā)掘數(shù)據(jù)背后的關(guān)系模式，以提供新的醫(yī)學(xué)知識，為患者提供更為個人的，及時的預(yù)警和治療得到了越來越多的關(guān)注。因此，需要開發(fā)和應(yīng)用新的醫(yī)療數(shù)據(jù)挖掘方法來發(fā)現(xiàn)這些隱藏的知識。
　　本文針對醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘的一些關(guān)鍵點進行了研究，尤其是在疾病早期預(yù)警方面。早期預(yù)警系統(tǒng)的目標(biāo)是確定臨床惡化的跡象，并提供嚴(yán)重

2、臨床事件預(yù)警。由于醫(yī)療數(shù)據(jù)往往在高維空間里，充分描述數(shù)據(jù)所需的空間規(guī)模是指數(shù)級增長的，計算量可以大到不切實際而且數(shù)據(jù)點很稀疏無法建模。為了解決這些問題，我們提出了核密度邏輯回歸混合模型，監(jiān)督度量學(xué)習(xí)等算法對醫(yī)療數(shù)據(jù)進行處理。最后，我們搭建了一個雙層預(yù)警系統(tǒng)：該系統(tǒng)的第一層從現(xiàn)有的臨床電子病歷數(shù)據(jù)庫中自動識別有惡化風(fēng)險的患者。第二層通過無線傳感器采集高?；颊叩膶崟r生命體征數(shù)據(jù)并進行危險篩查。我們采用數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)這兩個層面上分析數(shù)據(jù)，給予病

3、人的實時分析結(jié)果。論文的主要工作及貢獻(xiàn)如下：
　　1.提出了一種基于密度的邏輯回歸（DLR）分類模型以解決臨床數(shù)據(jù)挖掘算法中的邏輯回歸中非線性分類的問題。其主要思想是根據(jù)Nadarays-Watson密度估計將訓(xùn)練數(shù)據(jù)映射到特定的特征空間，然后組建優(yōu)化模型優(yōu)化特征權(quán)重以及Nadarays-Watson密度估計算法的寬度。其主要優(yōu)點在于：它不僅優(yōu)于標(biāo)準(zhǔn)的邏輯回歸，而且優(yōu)于基于RBF內(nèi)核的核邏輯回歸（KLR）。特別是與核邏輯回歸分析（

4、KLR）和支持向量機（SVM）相比，該方法不僅達(dá)到更好的分類精度，而且有更好的時間效率。該方法的另一個顯著優(yōu)點是，它可以很自然地擴展到數(shù)值類型和分類型混合的數(shù)據(jù)集中。除此之外，該方法在醫(yī)療數(shù)據(jù)挖掘中有模型可解釋的優(yōu)點，這恰恰是其它算法，如核邏輯回歸分析（KLR）和支持向量機（SVM）所不具備的。
　　2.提出了一種監(jiān)督度量學(xué)習(xí)算法–基于內(nèi)核密度的度量學(xué)習(xí)算法（KernelDensityMetricLearning(KDML)）以解

5、決臨床數(shù)據(jù)挖掘中數(shù)據(jù)特征過多引起的模型過擬合問題。該算法通用性強，可以提供非線性的，基于概率的距離量度。通過基于內(nèi)核概率密度估計，KDML構(gòu)建了一個從原始空間至目標(biāo)特征空間的直接非線性映射。KDML內(nèi)部嵌入的非線性映射能夠解決線性度量學(xué)習(xí)在數(shù)據(jù)集上分類錯誤的問題。同時，該算法解決了當(dāng)特征分布不均時，歐幾里得距離在原始空間上的量度導(dǎo)致k近鄰分類失效的問題。除此之外，算法可以實現(xiàn)與現(xiàn)有的度量學(xué)習(xí)算法結(jié)合。我們同時提出了一種綜合的優(yōu)化算法，來

6、優(yōu)化馬氏矩陣和非線性映射中的超參數(shù)。通過在數(shù)據(jù)集上的實驗證明KDML能夠顯著提高現(xiàn)有度量算法在k近鄰分類中的分類精度。
　　3.提出了一種新的監(jiān)督學(xué)習(xí)算法-快速通量判別算法（FastFluxDiscriminant，F(xiàn)FD），來解決大尺度非線性分類問題。算法提出了一個新的子模優(yōu)化框架，通過分解整個特征空間的核密度估計函數(shù)，將原始高維數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化至低維子空間。子空間的特征將被轉(zhuǎn)換，并在新的特征空間進行線性建模。與其他基于核算法非線性模型

7、不同，由于原始空間的權(quán)重系數(shù)可知，F(xiàn)FD模型具有可解釋性的優(yōu)點，同時通過降維，使得算法的訓(xùn)練和測試時間大大縮短。在實際數(shù)據(jù)集上的實驗結(jié)果證明，該模型在保持高精度的分類結(jié)果的基礎(chǔ)上，具有稀疏性，可解釋性和多尺度性等優(yōu)點。
　　4.提出了一個應(yīng)用在病房中的早期預(yù)警系統(tǒng)（EarlyWarningSystem），為臨床病人提供早期預(yù)警，從而在病人病情進一步惡化之前為醫(yī)生提供早期介入的機會。通過引入Bucketing技術(shù)來捕捉病人重要體征的

8、變化，并填補病人缺失的數(shù)據(jù)，使得數(shù)據(jù)可以應(yīng)用在實際的模型中。同時，我們結(jié)合邏輯回歸，BiasedBucketBagging（解決過擬合為題），探索性下采樣（解決類間不均衡問題）等算法完成系統(tǒng)。此外，在實時預(yù)測系統(tǒng)中，我們引入通過指數(shù)移動平均平滑初級預(yù)測結(jié)果，來較少數(shù)據(jù)波動對模型輸出的影響。
　　5.設(shè)計了無線醫(yī)療監(jiān)控系統(tǒng)-臨床監(jiān)測無線傳感器網(wǎng)絡(luò)，能夠獲得病人的實時醫(yī)療數(shù)據(jù)時間序列。該系統(tǒng)針對無線傳感器網(wǎng)絡(luò)在普通病房布置運用的可能性

9、進行了深入的臨床實驗。基于802.15.4的無線Mesh網(wǎng)絡(luò)，TelosB硬件平臺，針對病人流動性大，醫(yī)療無線傳感器網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)多變性的特點，通過引入動態(tài)中繼協(xié)議（DRAP），收集樹協(xié)議（CTP）來解決節(jié)點數(shù)據(jù)傳輸和能量限制的問題。在醫(yī)院病房中的實驗證明，系統(tǒng)提供了足夠的時間分辨率以支持臨床突發(fā)事件的監(jiān)測，實現(xiàn)了利用無線傳感器網(wǎng)絡(luò)持續(xù)對病人監(jiān)護的預(yù)期目標(biāo)。在此基礎(chǔ)上，我們提出了一種針對一般的病情惡化的綜合數(shù)據(jù)挖掘算法。通過提取一階，二階

10、時間序列特征，去趨勢波動分析（DetrendedFluctuationAnalysis(DFA)），頻譜分析，近似熵（ApproximativeEntropy(ApEn)），時間序列交叉相關(guān)性分析，整合得到時間序列的特征集。然后，通過引入一系列數(shù)據(jù)挖掘方法來進行時間序列分類，其中包括前向特征選擇，線性和非線性分類算法等。最終，我們將算法應(yīng)用在2001年至2008年不同重癥監(jiān)護病房病人的數(shù)據(jù)上，結(jié)果顯示文中提出的綜合數(shù)據(jù)挖掘算法能夠顯著提