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1、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文玉米耐旱相關(guān)候選基因dhn2與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析姓名:趙曦申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):作物種質(zhì)資源學(xué)指導(dǎo)教師:黎裕王天宇20080601AbstractAssociationanalysisisallimportantwaywhichCanindentifyfavorableallelesassociatingwithdroughttoleranceincorngermplasmresources,providin
2、gtechnicalsupporttobenefitgermplasmenhancementandgeneticimprovementteducethenegativeeffectofdroughtoncornproductionAmaizeassociationmappingpopulationwhichisconsistedof95maizeinbredlinesWasusedforevaluatingsequencediversi
3、tyandlinkagedisequilibrium(LD)ofdhn2,acandidategeneofdroughttoleranceinthestudyPhenotyposrelatedtodroughttolerancewerealsocharacterizedMoreoverbasedontheconsiderationofinfluenceofpopulationstnlcture,associationanalysisof
4、dhn2polymorphismanddroughttolerancephenotypesWasconducted,hopingtoidentifyfunctionalallelesofdhn2geneMainresultsareasfollows1Sequencepolymorphismofdhn2Wasevaluatedusing75inbredlinesoftheassociationpanelTotally37polymorph
5、icsiteswereidentifiedinthecodingregionof75sequencesobtained,including20SNPs(oneper48bp)and15Indels(oneper64bp)Amongthesepolymorphicsites,twositeswereinthefnstintronregiononlyaccountingfor54%HighernucleotidediversityWasob
6、servedintheexonregions,andreducedrapidlyinotherregionsLinkagedisequilibriumdecayedrapidlywithin500bpinthe砌,口region,andthereexistedlinkagedisequilibriumamongmultipolymorphicsites2Correlationanalysisshowedthatanumberoftrai
7、tsincludingkernellength,earlength,eardiametereardry—weight,kernelnumberperrowand100kernelweightcouldinfluenceyieldespeciallyeardryweight(Pearsoncorrelationcoefficientsis096861,P00001)And100一kernelweightshowedsignificantc
8、orrelationwitheardiameterandeardry—weightTherefore,thechoiceofinbredlineswithlongerearandkernel,thickerear’morekernelnumberperrowhighereardryweightandhigher100kernelweightareoptimaltogainahigheryield3Sevensignificantasso
9、ciationsbetweenpolymorphismandphenotypictraitswereidentifiedbyassociationanalysisAllthreeSNPwefeC/GmutationUnderdroughtconditions,oneSNPmutationfromCtoGassociatedwiththeincreaseofchlorophyllcontentTheothertwoallelesassoc
10、iatedwiththeincreaseofearlength,earlength,eardiametereardryweightorkernelyieldMeanwhile,twolnDelallelesincluding3bpinsertionassociatedwiththeincreaseoftassellength,andoneInDelwithlbpinsertionassociatedwiththeincreaseofea
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