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文檔簡介
1、目的:
醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)語句新穎性探測的目的在于,有效的解決信息冗余,在醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中自動地發(fā)現(xiàn)攜帶新信息的語句。本文將三種新穎性探測方法,包括余弦值算法、詞重疊度算法,以及詞對逆語句頻率統(tǒng)計法,應(yīng)用到醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)語句級新穎性探測中。對比分析三種方法計算語句新穎度的評測結(jié)果。
材料與方法:
選用pubmed數(shù)據(jù)庫,查找關(guān)于細(xì)胞自噬相關(guān)基因(Autophagy relatedgenes,Atg)的綜述文獻(xiàn)。篩選51篇,其中標(biāo)
2、題和摘要共計383個語句。使用MetaMap、MetaMap結(jié)果處理軟件、MySQL數(shù)據(jù)庫對自然語言進(jìn)行概念抽取,刪去停用詞,得到了由統(tǒng)一的、規(guī)范化的概念詞表達(dá)的語句集。運用R語言構(gòu)建語句-概念向量空間模型,在向量空間模型的基礎(chǔ)上,使用Ruby編寫余弦值算法、詞重疊度算法。在語句概念詞的基礎(chǔ)上,使用Ruby編寫詞對逆語句頻率統(tǒng)計算法。通過調(diào)查問卷方法獲得文獻(xiàn)語句新穎性參考答案,引入召回率、準(zhǔn)確率以及F值三個評價標(biāo)準(zhǔn),對三種算法進(jìn)行評測,
3、統(tǒng)計分析三種方法的評測結(jié)果。
結(jié)果:
對于新穎度計算結(jié)果,詞重疊度算法的均值最小,為0.75,詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的均值最大,為0.85。詞重疊度算法的標(biāo)準(zhǔn)差最大,為0.1802,余弦值算法的標(biāo)準(zhǔn)差最小,為0.1426。在新穎度的基礎(chǔ)上,給定一個閾值,如果探測語句的新穎度大于該閾值,則認(rèn)為有新的信息出現(xiàn),如果計算的新穎度比閾值小,則認(rèn)為該語句表達(dá)信息重復(fù)。對三種方法在其設(shè)定的各閾值下得到的語句新穎性探測評測結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)
4、計描述。結(jié)果表明,詞重疊度算法的召回率均值最高,為0.7444,詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的召回率均值次之。詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的準(zhǔn)確率均值最高,為0.8343,詞重疊度算法的準(zhǔn)確率均值次之。詞重疊度算法的F值均值最高,為0.7621,詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的F值均值次之,為0.7611,差值為0.001。余弦值算法的召回率、準(zhǔn)確率以及F值得均值都是最低。另外,在其設(shè)定的各個的閾值下,只有詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的評測數(shù)據(jù)中,有F值超過了0.8的情
5、況(對應(yīng)閾值為0.80、0.81、0.82)。
結(jié)論:
將三種新穎性探測方法,應(yīng)用到醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)語句級新穎性探測中,對于新穎度計算結(jié)果,詞重疊度算法的均值最小,為0.75,標(biāo)準(zhǔn)差最大,為0.1802,說明詞重疊度算法能夠更好的將語句內(nèi)容間差異表現(xiàn)在數(shù)據(jù)上。
三種方法評測數(shù)據(jù)顯示,在其設(shè)定的各個閾值下,只有詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的評測數(shù)據(jù)有F值超過了0.8的情況,說明詞對逆語句頻率統(tǒng)計法的語句級新穎性探測效果是三者
6、之中最優(yōu)的。
詞對逆語句頻率統(tǒng)計法對比其他兩種算法的優(yōu)勢在于,第一,詞對逆語句頻率統(tǒng)計法計算過程不需要構(gòu)建向量空間模型,計算簡便,耗時少。第二,該算法通過統(tǒng)計概念詞對出現(xiàn)的頻次,來計算語句新穎度,概念詞對對比單個概念詞能夠更好地體現(xiàn)語句所包含的信息。第三,該方法的運算公式能夠直接得出語句新穎度,運算思路是基于和待探測語句之前出現(xiàn)的所有語句包含的所有信息進(jìn)行對比,而非和待探測語句之前出現(xiàn)的每一條語句包含的信息,進(jìn)行逐一對比。這一
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