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文檔簡介
1、隨著人類獲取信息能力的飛速發(fā)展,機(jī)器學(xué)習(xí)算法在科研和工程的各個(gè)領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用,涉及到化工生產(chǎn)統(tǒng)計(jì)過程控制、考古學(xué)的文本識(shí)別、社會(huì)和刑偵領(lǐng)域的指紋和圖像識(shí)別以及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的基因組信息研究等。面對(duì)日益增加的大數(shù)據(jù),迫切需要高效和高準(zhǔn)確率等綜合性能較好的變量選擇方法,以刪除信噪比低和冗余變量的干擾,提高機(jī)器學(xué)習(xí)算法在模式識(shí)別領(lǐng)域的精度和效率。我們以非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)亞型的組
2、織學(xué)和人類細(xì)胞中的snoRNAs的識(shí)別為背景,探討不同的變量選擇方法來提高分類精度。
隨著生物信息技術(shù)高速發(fā)展,已經(jīng)運(yùn)用高通量技術(shù)得到大量的生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),如何利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法來研究生物數(shù)據(jù),解決生物模式識(shí)別問題是目前的當(dāng)務(wù)之急。非小細(xì)胞肺癌子類主要是肺腺癌(lung adenocarcinoma,ADC,58.8%)和鱗狀細(xì)胞癌(squamous cell carcinoma,SCC,31.2%),識(shí)別非小細(xì)胞肺癌子類組織
3、學(xué)分類的特征基因?qū)Ψ切〖?xì)胞肺癌的機(jī)理分析和治療方案選擇極其重要;為了研究ADC與SCC各種不同特性的關(guān)鍵機(jī)理,我們聯(lián)合彈性網(wǎng)絡(luò)、最小二乘和貝葉斯分類器等算法基于TCGA數(shù)據(jù)庫中三種數(shù)據(jù)(基因表達(dá)數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)和拷貝變異數(shù)據(jù))建立分類器識(shí)別特征基因集。
對(duì)于snoRNAs(small nucleolar RNA)來說,識(shí)別snoRNAs對(duì)了解snoRNAs和其他RNA等生物生命活動(dòng)有著重要的意義。首先利用多種特征提取算法從有限
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