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文檔簡介
1、現(xiàn)如今,隨著細胞培養(yǎng)技術(shù)和半導(dǎo)體微加工技術(shù)的發(fā)展,采用細胞芯片對活細胞進行無損、長時程檢測的細胞傳感器得到了廣泛的應(yīng)用。尤其是微電極陣列傳感器(microelectrode array sensor,MEA)、細胞阻抗傳感器(electric cell-substrateimpedance sensor,ECIS)以及光尋址電位傳感器(light addressable potentiometricsensor,LAPS)等胞外檢測方法
2、已成為在細胞水平上實時、動態(tài)研究細胞代謝活動和進行藥物研究的重要手段。但傳統(tǒng)的細胞生理檢測儀器只能對單一的細胞生理參數(shù)進行分析,對于綜合評價細胞、藥物或環(huán)境是遠遠不夠的。為此,我們研制了多參數(shù)細胞生理自動分析儀,該儀器可以同時檢測集成MEA、ECIS和LAPS三種傳感器的新型細胞生理檢測芯片,實現(xiàn)在細胞水平上分析藥物對細胞的作用,并對細胞的多種生理參數(shù)進行檢測。
本文的主要任務(wù)是開發(fā)多參數(shù)細胞生理自動分析儀器的軟件系統(tǒng),通
3、過同時檢測集成芯片的信號,分析得到有關(guān)的細胞生理參數(shù)。軟件系統(tǒng)結(jié)合多參數(shù)細胞生理自動分析儀器,可以實時動態(tài)長時程采集、記錄和分析細胞的各項生理參數(shù)。軟件按照功能分為五大模塊:MEA模塊、ECIS模塊、LAPS模塊、環(huán)境監(jiān)控模塊和流路分析模塊。MEA模塊可以檢測生長在MEA芯片表面的細胞動作電位,記錄細胞電活動;ECIS模塊依靠叉指電極檢測細胞阻抗變化,從而反映出細胞生長、貼附、增殖、凋亡的過程,以及藥物對細胞活性的影響等參數(shù);LAPS模
4、塊通過檢測光生電流變化,可以計算出細胞外環(huán)境中各種離子濃度的改變,用以反映細胞代謝狀況;環(huán)境監(jiān)控模塊可以實時監(jiān)控細胞培養(yǎng)環(huán)境中溫度、濕度和CO2體積濃度的各種變化,并精確控制培養(yǎng)環(huán)境,保證細胞正常穩(wěn)定生長;流路分析模塊通過控制流路分析系統(tǒng)配合儀器完成培養(yǎng)液和藥物的自動進樣以及清洗,實現(xiàn)細胞生理參數(shù)的自動化檢測與分析。
軟件在界面上也比傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)采集軟件有了很大提高,整體框架基于Microsoft.NET Framework
5、3.5開發(fā),可以支持Microsoft Windows系列的多種操作系統(tǒng)平臺。采用多任務(wù)的處理方式,使多種功能可以并行檢測,真正實現(xiàn)了多參數(shù)綜合檢測分析。通過模塊化和面向?qū)ο蟮脑O(shè)計理念,將底層的各個功能模塊封裝,極大的擴展了軟件的適用范圍,并降低了二次開發(fā)難度。
此外,本文研究了基于細胞生理多參數(shù)檢測的自動識別算法。針對MEA檢測,設(shè)計了動作電位峰值自動檢測辨識算法,利用移動窗積分的方法實現(xiàn)了實時峰值檢測與提取。針對ECI
6、S檢測,設(shè)計了細胞指數(shù)與藥物半數(shù)抑制濃度的自動判別算法,利用LOGIT模型結(jié)合最小二乘法擬合,可以實現(xiàn)在線藥物半數(shù)抑制濃度計算。針對LAPS檢測,設(shè)計了自動檢測Ⅰ-Ⅴ曲線工作點的算法,通過多次樣條插值與平滑積分濾波相結(jié)合的方法,確定Ⅰ-Ⅴ曲線的工作點,并計算出離子濃度變化。合理利用上述算法,可以實時研究藥物對細胞動作電位形態(tài)和時長的影響,藥物對細胞生長狀態(tài)和細胞數(shù)量的影響,以及對細胞代謝的作用,實現(xiàn)了細胞生理多參數(shù)的準確辨識和預(yù)測,對于
7、藥物篩選和化合物研究都有重要的意義。
通過該儀器對實際藥物和細胞的檢測實驗,驗證了實時峰值提取算法在信噪比為1.5至3.5時的準確率均超過90%,并計算出了檢測閾值的合理取值范圍;利用半數(shù)抑制濃度自動判別算法計算出阿霉素針對大鼠心肌細胞的IC50曲線;通過分析自動工作點檢測算法在多種離子條件下的誤差,確定30mV為最佳采樣間隔,此時的相對誤差為13.5±1.9%。通過對儀器穩(wěn)定性和算法正確性進行了細致的驗證和改進,以及對實
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