基于κ-mer頻率的piRNA識別方法研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、生物信息學是建立在數(shù)學、計算機科學和生命科學等學科基礎之上的一門交叉學科，包含了生物信息的獲取、加工、存儲、分配、分析、解釋等在內的各個方面。生物信息學的研究內容十分廣泛，其中，非編碼RNA的研究是目前熱門的研究課題之一。生物體中RNA分為編碼蛋白質RNA和非編碼蛋白質RNA兩類。研究表明，非編碼RNA.基因比翻譯蛋白更易產(chǎn)生功能性RNA產(chǎn)物，它包含許多功能重要的RNA，其中，長度在20～30個堿基范圍內的稱之為小RNA。非編碼小RNA

2、大量存在于高等生物體內，組成了十分復雜的生物調控網(wǎng)絡。到目前為止，人們在真核生物中已發(fā)現(xiàn)了三類非編碼小RNA：微小RNA(miRNA)，小干擾RNA(siRNA)以及Piwi相互作用RNA(piRNA)。目前miRNA的識別和鑒定可以采用實驗分析(包括克隆和測序、miRNA微陣列以及雜交實驗)和計算分析(包括基于決策樹和機器學習如k-gram，支持向量機，貝葉斯網(wǎng)絡等)兩種方法。piRNA(PIWI-interacting RNA)是一

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